| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,542 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,542 | 0 | C | A | 97.4% | 219.8 / ‑4.8 | 77 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base A (33/41); total (35/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
TGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCA > NC_000913/4184404‑4184680 | tGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGCTACTCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTg < 2:847062/143‑1 (MQ=255) tAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 1:73835/143‑1 (MQ=255) aaCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCg > 2:685340/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt > 1:872392/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGAAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATACGCCTTACGATGAAACCGGTACCCCGGCCGACCTCGTCCTGCACCAGCTGCGCGTCCCGt > 1:731061/1‑143 (MQ=255) cataaccAGCCTGGTGAGAAGAAGGCAGGGCGTCACGGTAACAATGGTGTACTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGAGATGCCTCACGATGAAAACGGTACCCCGGTATACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCg < 1:97962/138‑1 (MQ=255) aTCCAGCCTGGTGACAAGAGGGCCGGTCGTCGCGGAACCAATGTTTTTATTTCTATGATCAACCCTATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 1:150556/143‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTCAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAAc > 2:40881/1‑143 (MQ=255) gCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACa > 1:808987/1‑143 (MQ=255) gCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGAGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCACGTATGAAcg > 1:94013/1‑142 (MQ=255) cTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGCACATc > 1:500103/1‑143 (MQ=255) gTGGCAAGATGGCAGGCCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCCTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt < 2:744675/143‑1 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt > 2:453446/1‑143 (MQ=255) tGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTc < 2:204138/143‑1 (MQ=255) agccAACATGGCAGATAACCACGTTAACAAGCGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCTAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTc < 1:748026/140‑1 (MQ=255) aCAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAGTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAg < 1:28441/143‑1 (MQ=255) aCAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACGTCGGTCAg > 1:1090406/1‑143 (MQ=255) aaGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTATCATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGGAATGAATCAGATAGGCGTAGCGTCCGGTATGGACGTCGGTcggca > 2:314051/1‑139 (MQ=255) gATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGAAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGACCCGTATGAACATccaacagaacc > 2:8389/1‑133 (MQ=255) gtaggaGGTGGGCACGGGAACAAGGGGGGAATGTCTAAGATCGACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAGGCGGTACGCCGGTAGAGATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCt < 2:494729/138‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAGCGGTCAGAGCCTc > 2:375355/1‑143 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:948406/143‑1 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:394882/143‑1 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:1007348/143‑1 (MQ=255) ggTCGTTACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAAc < 1:1008319/143‑1 (MQ=255) gtcgtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGAACGCCGGTAGCGCTGGAGCAGAGGCCGCAGGTCGTACCGCCTCGTATGGACATCGGCCAGATCCtacaaccc > 1:509954/1‑136 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCGTTAACATGAAAACGAAACGAAGGTAGACACCGAACCGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGTTTCTCGAAACCCAct > 1:446941/1‑142 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGCGTAATTGCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAcc < 1:244846/143‑1 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTg > 1:637650/1‑143 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCCAAGCTCACCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTg < 1:201663/143‑1 (MQ=255) cGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGTTGAAAACGGTACGCCAGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGAACAGTCTCGTATGGACATCGCTAGGATCGTCGAAACCCAcacag > 2:1069195/1‑139 (MQ=255) aaCAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGACGATATGCCTTACGATGGAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTTTAGGATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 2:338297/143‑1 (MQ=255) acagtcttgtatcttCTAAGATGGGCCCGATCGAGTATATGCTTTCCGTTGTGGACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGCCAGCTGGGTGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 2:1048981/130‑1 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGc > 1:1074830/1‑143 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGc > 2:357174/1‑143 (MQ=255) aaGGGTGTAATTCCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGGAGACATCGCACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACGTCGGTCAGATCCTCGAAACCAACCGCGGTAGGGc > 2:1039613/1‑143 (MQ=255) cgggTGTACTTTCTACCATCCACCCGATCGAAGTTATGCCTTACGATGAAACCGCTACCCCCGTAGACTTCGTACTGAACCAGCTTGGCTTCCCACCCCGTACGATCACCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCt < 2:464503/142‑1 (MQ=255) ggctggaaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATACGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTg < 1:843947/137‑1 (MQ=255) tgtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGa > 1:952148/1‑143 (MQ=255) tcatgtCTAAGATCAACGCGATCGTAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCTACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 2:189917/138‑1 (MQ=255) tactttCTAAGATCCACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAGACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 2:324048/140‑1 (MQ=255) tAAGTTCCAAGATCAACCCGAGCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 2:599748/143‑1 (MQ=255) tAAGTTCCAACATCACCCCGATCGAAGAGATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 1:679251/143‑1 (MQ=255) aatcacTAAGACCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 1:725212/138‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGGTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 2:568427/143‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 1:685340/143‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg > 1:622918/1‑143 (MQ=255) tttCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGAACCTCGAAACCCACAGGGTGATGGCTGCggacgat > 2:638008/1‑137 (MQ=255) 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1:662893/1‑143 (MQ=255) aCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg > 1:355900/1‑143 (MQ=255) cttgATCGAAGATATGCCGTACGATCAAAACGTTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGa < 1:921032/140‑1 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAGCGGTCAGATCCGCGCACGCAATCCGGGTATGGCTCCGCAAGGTATGGGCGagaagacccac > 2:229352/1‑138 (MQ=255) tCGAAGATAGGCCGTAGGATGCAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:83328/143‑1 (MQ=255) gAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAgcgc > 1:1022483/1‑143 (MQ=255) aaGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGCCGACAAGACCAACGcc > 2:925346/1‑143 (MQ=255) cTTACGTGGAAAACGGTACGCCGGTAGACACCGTACTGAGCCGGCTGGGCGTCCCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGCTCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa < 2:181448/143‑1 (MQ=255) cTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa < 1:609689/143‑1 (MQ=255) aCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcag < 2:628990/143‑1 (MQ=255) aacaccgTACGCCGGGAGACATCGGACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGGACATCGGTCAGATTCTGGACTCTCATCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCaa < 2:536574/137‑1 (MQ=255) atggTACGGCGGTAGACATCTTACTTAACCAGCTGGCCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCaagaa < 2:94013/141‑1 (MQ=255) aCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCaagca > 2:275930/1‑141 (MQ=255) ggTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAACGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAAAGCAGCaagaaat > 1:1030496/1‑141 (MQ=255) tACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAACCAGCAGCAAGAAGTcg > 1:817544/1‑143 (MQ=255) aCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGTCGTACCGGCGCGTATGCACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 2:713224/143‑1 (MQ=255) gCCGGTAGACGGCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGa < 2:119213/143‑1 (MQ=255) ggACATCGTAGAGCACCAGGTTGGCGTACCGGCTCATATGAACATCGGGCAGAGGCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGTTCAACGCCATGCTGAATCAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgc < 2:414431/142‑1 (MQ=255) aTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCACGAAGTCGCGAAACTGCGCGa > 1:817701/1‑143 (MQ=255) tCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGaa < 2:622918/143‑1 (MQ=255) cGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAAt < 1:453446/143‑1 (MQ=255) tACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGACATGCAAAAACCGAAGCGAGGAGTCGGGAAACCGCGCGAAATc > 2:992453/1‑143 (MQ=255) tGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATc < 1:174659/143‑1 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCTATGTTGAAACAGAAGCAAGAAGTAGCGAAACTGCGCGAATTGATACa > 1:194778/1‑143 (MQ=255) | TGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCA > NC_000913/4184404‑4184680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |