| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1937136 = | 3 (0.070) | 63 (1.410) | 52/284 | 0.0 | 95.5% | coding (485/870 nt) | yebK | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | intergenic (‑91/‑6) | insC1/yoeA | IS2 repressor TnpA/CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AATCTGCCATCAACCGCGCCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCAC > NC_000913/1936995‑1937277 | aaTCTGCCATCAACCGCGCCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCgatgat > 1:118099/1‑143 (MQ=255) tGCCATCAACCGCGCCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAAGCTCTTCAGCCGACGTTGCCCACGATGCGATGCATAAGATCTTGCGGTTAAATCTTCCCGTCGAGGACTCCgttgatccat > 2:756579/1‑139 (MQ=255) tGCCATCAACCGCGCCGTCGACTTGCACACTCAGGCAAAAAAAACCGCCCGTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGACTAAGGTCTTTCGCTGTAATGTTCTGGTGGTGTAGTCCGCTGatagtc > 2:65631/1‑140 (MQ=255) gtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGtg < 2:742091‑M1/8‑1 (MQ=255) gtggtacgccggctgcgtttctccggctcgaagacatcgatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGtg > 2:193311‑M1/136‑143 (MQ=255) aTCAACCGCGCCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggat < 1:458238‑M2/143‑6 (MQ=255) gtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactcgtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGtgctg < 1:279963‑M1/11‑1 (MQ=255) gtacgccgtctgcgtttctcccgcccgaggacgtcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagactcagggggccagtctcatatcgccccg < 2:278801‑M1/11‑6 (MQ=255) gttttttttttttttccttccttaagacatcaatcatctgtgcaccgatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAAc > 1:38555‑M1/129‑143 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAAc > 1:251960‑M1/129‑143 (MQ=255) cgggcccgccgactcgCTCACTCCGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcc > 1:121942‑M2/6‑133 (MQ=255) cgcgCCATCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgccc > 1:780837‑M2/1‑132 (MQ=255) gtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCa > 1:249954‑M1/126‑143 (MQ=255) cgcCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccct > 2:108665‑M2/1‑130 (MQ=255) tctgcgtttctccggccctaatacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCAt > 2:653932‑M1/125‑143 (MQ=255) gcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAtcgtcctgcagatcatgag < 2:304017‑M1/22‑10 (MQ=255) gtttctccggccctaagacatcaatcgtctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGtt > 2:464810‑M1/120‑143 (MQ=255) gtttctccggccctaagacatcaatcagctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTACAACGCATGAGtt > 1:198481‑M1/120‑143 (MQ=255) ttctccggtcctaacacattactcatctgtcctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGt > 1:18900‑M1/118‑143 (MQ=255) ttGCTCCCTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTGTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccag > 1:110893‑M2/1‑120 (MQ=255) cggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGaa < 1:666805‑M1/31‑1 (MQ=255) cggccctaagacatcaatcatctattctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagactaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGaa < 2:773868‑M1/31‑1 (MQ=255) tcactcaGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTAGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttcgagacat < 2:65020‑M2/143‑28 (MQ=255) ctaagacatcagtcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTa > 2:690441‑M1/108‑143 (MQ=255) atgaaaaaaaaagcgcCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 2:259741‑M2/5‑110 (MQ=255) aGGCGTAAGAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 2:783321‑M2/1‑110 (MQ=255) ggCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGCCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTTCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttat > 2:693189‑M2/1‑109 (MQ=255) ccatcaatcacctgttccccaatgactagtctaaaaatgattattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcatggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATTAGTTGTATGAATTGTAGCGAc > 2:742454‑M1/103‑143 (MQ=255) aaaaaaaaTCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatccc < 1:220573‑M2/143‑38 (MQ=255) aaaaaaaaTCGCCTTGTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 2:429740‑M2/1‑106 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGgag < 2:218616‑M1/45‑1 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGgag < 1:434918‑M1/45‑1 (MQ=255) aatcatctcttcgccgagatcgagtctaaaaactgttattaagactatcacttatttacgtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGgaga > 2:719771‑M1/98‑143 (MQ=255) aaCCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:454064‑M2/1‑100 (MQ=255) atctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACgtg < 1:643271‑M1/50‑1 (MQ=255) atctgttcgccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACgtg > 1:275381‑M1/94‑143 (MQ=255) gttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACgtggtgg < 1:442799‑M1/54‑1 (MQ=255) cTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgctcctatatttccagacatctgttttcacttaacccattat < 1:107718‑M2/143‑50 (MQ=255) tttttCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:411597‑M2/143‑51 (MQ=255) ggATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatctttccaggcttctgttatctcttcacccttttccatcctg < 1:202775‑M2/143‑57 (MQ=255) aatgactagtctaaacactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGAt > 1:128068‑M1/83‑143 (MQ=255) aatgactagcctaaaaactagtattaagactatcacttagttaacagaacttgccattgtgtttattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGAt > 1:177201‑M1/83‑143 (MQ=255) gATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACGCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc < 1:409040‑M2/143‑58 (MQ=255) ctagtctaacaactagtattaagactatcacttatttaagtggtattggttgtcgggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTATCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTtctc > 1:338287‑M1/78‑143 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTtctc < 1:607558‑M1/66‑1 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTca < 2:451336‑M1/67‑1 (MQ=255) ggCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattccaagcccgctgccg < 1:581143‑M2/143‑63 (MQ=255) tctTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcag > 2:152152‑M2/1‑78 (MQ=255) tctTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacagctgttatcacttaataacttacagacccgatgccgcag < 2:599527‑M2/143‑66 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactctcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCATCGCATGAGTTGTTTGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACt > 1:199092‑M1/73‑143 (MQ=255) ctTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga > 2:118099‑M2/1‑77 (MQ=255) ttCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccagctgccgcagct < 2:528428‑M2/143‑68 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTg < 1:749021‑M1/72‑1 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGAGCTGCTTTCTCACACTGgaa < 2:61475‑M1/75‑1 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatggggtgtcgggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGgaa > 1:295634‑M1/69‑143 (MQ=255) ccgccgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgccgatattcc < 2:343839‑M2/143‑73 (MQ=255) ccgccgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGCTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcc < 1:410481‑M2/143‑73 (MQ=255) ccgccgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTGCTTGCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcc < 2:683900‑M2/143‑73 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCACTGCATGTGGAAAAGTAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGgaaga < 1:177025‑M1/77‑1 (MQ=255) cgccgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcccttaacccattacaagaccgctgccgcagatattccc < 2:429020‑M2/143‑74 (MQ=255) gtattaagactatcgcttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTAGAAGAACaa > 1:720999‑M1/63‑143 (MQ=255) cgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg < 1:441106‑M2/143‑77 (MQ=255) cgTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTGTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg > 1:515387‑M2/1‑67 (MQ=255) ttCCCCACGATGCGATGAATAACTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatctgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggc > 1:287124‑M2/1‑65 (MQ=255) ttaagactatgactgattggagtgatagtggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACaaaaa > 2:478583‑M1/60‑143 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAGCGCATGAGTGGTATGAGTCGTAGCGACGGAGAGGTGGAGGTGCTGATTTGTCACAACGGACGAGcaaaag < 2:147411‑M1/84‑2 (MQ=255) cccACGATGCGATGGTTGAGCTCTTTCGTTTTTATGTTCCGGTGGNGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag > 2:268568‑M2/1‑62 (MQ=255) ccgatgcgatgaATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga > 1:448159‑M2/2‑59 (MQ=255) actatcacttattttagagatattggttgtctggagattcagggggcctgtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTg > 1:760504‑M1/55‑143 (MQ=255) ccatcacgtatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTgg > 1:551597‑M1/54‑143 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGGGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCGCACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGc < 1:91639‑M1/96‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAGAATCTGGTCGAGc < 1:783489‑M1/96‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtccaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGc > 1:550546‑M1/48‑143 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGgc < 1:117749‑M1/100‑1 (MQ=255) aagtgatattggatgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGCCGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGctggcaca < 2:295112‑M1/103‑4 (MQ=255) aaGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcact > 1:570931‑M2/1‑45 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCgagctggagaag < 1:688467‑M1/104‑6 (MQ=255) gTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGCTGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggccagcgataacccagcgcactat < 2:266458‑M2/143‑101 (MQ=255) tttCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattagaagcccggtgccgcagatattcccgtggggagcgataacccagcgcagtatgcgg < 1:765861‑M2/143‑105 (MQ=255) tttCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgatgacccagcgcactgtgcgg < 1:51767‑M2/143‑105 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGc < 1:754437‑M1/109‑1 (MQ=255) ctcgctgtcatgttccggtGGTGTCCTCCGATGATCTCtgcatttgcccctatatttccagacatctgttatgacttaacccattacaagcccgccgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgga > 2:151287‑M2/10‑38 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCCTGCGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGGACCAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCAc < 1:686563‑M1/111‑1 (MQ=255) tCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat > 2:411597‑M2/1‑37 (MQ=255) tCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggagttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggat < 2:671036‑M2/143‑107 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGa < 1:568481‑M1/115‑1 (MQ=255) tctggagcttcagggggccagtccaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGaaaa > 1:444696‑M1/26‑143 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCGTGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGaaaa > 2:151141‑M1/26‑143 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACCCAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCCGCTGGCACGCGCAAccga < 1:145595‑M1/121‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGTACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttata > 2:552011‑M2/1‑24 (MQ=255) gtACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcga > 1:467353‑M2/1‑16 (MQ=255) tACTCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa > 1:98360‑M2/1‑15 (MQ=255) gccagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAACACGACgccatggaggtt < 1:20896‑M1/134‑6 (MQ=255) aCTCCGAGGATATCtggatttgcccctctttatccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaac > 2:585722‑M2/1‑14 (MQ=255) tCCGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaaccccgctgccgcagatcttcccgtggcgggcgataaccccgcgcactgtgcgcatgccactcgtcacaacccccgaacgc < 2:292802‑M2/143‑132 (MQ=255) cagtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGCCGCCATGGTGATTGc < 1:753282‑M1/136‑1 (MQ=255) gtctaATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCgaaaacgacgccagggcgaggggcc < 2:486986‑M1/138‑13 (MQ=255) cGATGATATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 2:610191‑M2/143‑134 (MQ=255) atgatATCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctct < 1:710732‑M2/143‑136 (MQ=255) aATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCctccc < 1:595491‑M1/142‑3 (MQ=255) | AATCTGCCATCAACCGCGCCGTCGACTTGCTCACTCAGGCAAAAAAAATCGCCTTTTTCGGATTAGGCTCTTCAGCCGCCGTTGCCCACGATGCGATGAATAAGTTCTTTCGTTTTAATGTTCCGGTGGTGTACTCCGATGATATCGTGCTGCAACGCATGAGTTGTATGAATTGTAGCGACGGAGACGTGGTGGTGCTGATTTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCAC > NC_000913/1936995‑1937277 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |