Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 981,253 | T→G | 21.0% | G69G (GGT→GGG) | ldtD → | murein L,D‑transpeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 981,253 | 0 | T | G | 21.0% | 244.0 / 12.0 | 117 | G69G (GGT→GGG) | ldtD | murein L,D‑transpeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/76); new base G (26/2); total (38/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.23e-16 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTATGATAAAAACAGGGGGCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCAC > NC_000913/981022‑981491 | gATAAAAACAGGGGGCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTTCAGCCCTTGCC‑CGAA‑GGGGCGG‑CAG‑aaaa > 1:359639/1‑239 (MQ=255) gATAAAAACAGGGGGCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGAGCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑caaa > 1:478004/1‑239 (MQ=255) tAAAAACAGGGGGCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑aaaaa < 1:87252/238‑1 (MQ=255) ggggCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCCGCCATTTGC‑TGAA‑GGGGCGG‑GCG‑AAAAAAACcgcccg > 1:1154023/1‑238 (MQ=255) ggggCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCACACATTTCC‑CTAC‑AGGGGGG‑CCG‑AAAAAACCcccacc > 1:296569/1‑237 (MQ=255) ggCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGAAGCCGCCACTCCC‑CCAA‑AGGGTGG‑CAG‑GAAGAACCcgcacg‑cca > 2:1105192/1‑237 (MQ=255) gATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGaa < 1:1070511/238‑1 (MQ=255) tGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAAtc < 1:79548/238‑1 (MQ=255) gTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTTCAGACCATGCC‑TGAA‑AGGGCGG‑CAG‑GAAAAACCCGCACG‑Ca‑aacaccaact > 1:1053318/1‑230 (MQ=255) gTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGGCCCACCATTGTC‑TGAA‑GGGGCGG‑GCG‑AAAAAACCCCCCCC‑CA‑AATTCAAtct > 1:1002162/1‑238 (MQ=255) aaTATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCCGCCATTGCC‑TGGC‑GGGGCCG‑CAG‑GAAAAACCCGCACC‑CC‑AAATGAATCTCAATTaa > 1:463319/1‑237 (MQ=255) tatGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCCTTGCC‑TGAAGGGGGGGG‑CGG‑AAAAAG‑CCGCACGCCA‑AACCGAGTC‑CAATTAcca > 1:896306/1‑237 (MQ=255) tgtgtgGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCCGCCATTGCCTTGAA‑GG‑GCGG‑CCG‑AAAAAACCCCCCCG‑CC‑AAACGAAACTCAATTAccccccgga > 1:657996/1‑233 (MQ=255) tgtgtgGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑GAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AACCGAATCTCAATTACCCCCAggg > 1:885042/1‑238 (MQ=255) tgGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCATTGCC‑TGAG‑GGGGCGG‑CGG‑GAAAAGACCGCCCG‑CA‑ACACGAATCTCCATTACCCGCCGGGTACa > 2:865558/1‑239 (MQ=255) tgGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGACCAGCCCTTTCC‑CGGA‑AGGGCGG‑CGG‑AAAAAACCCCCCCG‑CC‑AAACGCAACTCAATTAACCCCAGGGTACa > 2:860809/1‑239 (MQ=255) ggTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGAGCAGCCCTTTCC‑CGGA‑AGTGCGGCCGG‑AAAAAACCGCCACG‑‑A‑AAACCAAACTCACTTAACCCCCGGGTACaa > 2:833408/1‑239 (MQ=255) cAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGt < 1:396178/239‑1 (MQ=255) aaGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATGCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGt < 1:439735/238‑1 (MQ=255) cTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGAGGTACAGCCATTGCC‑TGAC‑GGGGCGG‑CCG‑AAAAAAACCCCGCG‑CC‑AATCGAACATCCATAAACCGCCGGGGACAAGCCGGtttt > 2:774056/1‑238 (MQ=255) tCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGGCCAGCCAGTTGC‑GGCA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAACACCCACG‑CACAAGAGAA‑CCCACTTACGCGCAGGGTAGAAACCGGGTTATCt > 2:435051/1‑239 (MQ=255) ggCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGACCAGCCACTGCC‑TGAA‑AGGGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGCACG‑CC‑AAACGAAACTCCAATACCCCCacgctcacaaccggactatcttt > 2:936211/1‑217 (MQ=255) cAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTaa < 1:804971/238‑1 (MQ=255) cAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTaa < 1:96037/238‑1 (MQ=255) cAATCAGTTTGTGCCAGGCCGTAACATGCGCTCCACTGTGCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACGGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTaa < 2:1053318/238‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAAcc < 2:335059/239‑1 (MQ=255) cAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGc < 2:1212963/239‑1 (MQ=255) ttGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTc < 1:307713/238‑1 (MQ=255) tgtgTCGGGCCTTAACATTCGCTCCACGGTGCAATGCGAAGGCGGATGAGCCGGAAGTAATCCCTGGCGCCATCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCaa < 2:101966/239‑1 (MQ=255) tgtgCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCaa < 1:1004143/239‑1 (MQ=255) tgggCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCaa < 1:1105192/236‑1 (MQ=255) gtggCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAGTGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCGGGCGACAGCCCGGTGGCGGTCAGTGAGGAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGAAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AAGCGAATCTCAATTGCCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCaa < 2:636350/236‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAGCAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACtg < 2:941561/238‑1 (MQ=255) tAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGAGGGCCCCCCCTCGCC‑CGAG‑AGGGCGC‑CAG‑CAAAAAACCGCCCG‑CA‑CATACAAACTCCATTTCCCGCGGGTGACCAGGCCCTTTTTCTTAACCAACTTCAAcatttacatgg > 2:1063095/1‑228 (MQ=255) cATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑a < 1:865558/239‑1 (MQ=255) tCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑Acgc < 1:915070/239‑1 (MQ=255) gCTCCGCCGTTCAATGCGCAGGCCGGGGAGCCTGAATTAAACCCTGGCGACAGGCCGGTGGCTGCCAGTGAACCGGGCGAGGTGCTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCAATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCCTCAACTGTTGTATGCCGG‑ACACGa < 2:814489/239‑1 (MQ=255) tCCACTGTCCAATGCGGAGGCCGATGAGCCGGAAGTAATCCCTGGCGGCAGCCCGGTGGCGGTCAGTGAACAGGGCTAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAACGGCGGGGAACCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAACTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGata < 2:1002162/239‑1 (MQ=255) ttCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGCTCCAGCCACTGCC‑TGCA‑GGTGCGG‑GAG‑AAAAAAACCGCACG‑CC‑AAAAGAAACTACATTACCCGCCGGGGACAAACCGGTTTGACATAAACACACTCCACCGCTGTATGCCGC‑ACGCCACATgacac > 2:1197281/1‑234 (MQ=255) ttCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGc < 1:456805/205‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCCGCCATTTCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGCACG‑CA‑AAACGAATCTCAATTACCCGCCGGTTACAAGCCGGGTTATCTTACACACCTTCAAACGTTGTATGCCGC‑ACGCGACAAGATA‑CCCAtgt > 2:1041875/1‑239 (MQ=255) aGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGATCAGCCCATTCC‑TGCA‑GGGGGCG‑CCG‑GAAAAACCCGCCCG‑CC‑AAACGGAACTCCATTACCCCCCGGGTTCAAAACGGTTTTTCTTAACCAACTTCCACTCTTGTATTCCGC‑Acgccctcttccaccccacatggag > 2:123586/1‑218 (MQ=255) aGGCCGATGAGCCTGAAGGAACCCCCGGCGACCGCCCGCTGCCTGTCAGTGAACAGGGCCAGGCACTGCCGCAGGGGCAAGCAACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGaa < 2:624154/239‑1 (MQ=255) ggCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGaa < 2:531471/238‑1 (MQ=255) ccGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGaa < 1:337547/236‑1 (MQ=255) gATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTGCCGCCATTGCC‑CGAA‑AGGGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGCACG‑CC‑AATCGAAACTCAATTACCCGCCGGTTACAAGCCGGGTTATCTTAACCAGACTCAACTGGTTTCTGTCGC‑ACGCGAGATGCAACCCCAGGGGGGAAAAcg > 2:882548/1‑238 (MQ=255) gCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGAt < 1:166023/238‑1 (MQ=255) gCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGGCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGAt < 1:964078/238‑1 (MQ=255) gCCGGAAGTAACGCCGGGCCACAGCCCGGGGGCGGTAAGTGAACAGGGGGGAGAACTGCCGCAGGCGAAAGCCGCGGCAATAATGGCGGGGATCGAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGTACG‑CA‑AAGCGAATCTCAATTGCCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGA‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGAt < 2:634637/238‑1 (MQ=255) cTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTGCAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATg < 1:1103479/237‑1 (MQ=255) tGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCGAGCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CGG‑AAAAAACCACCCCG‑CC‑AATCGAAACTCCATTAAACGCCGGGTACAAGAAGGGTTTACTTAACCAGCTTCAACTATTGTATGCCGCTACAC‑ATAAGCTA‑CCCATTTGGGagaaacaggaggatgttatcaactga > 2:233860/1‑216 (MQ=255) tGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCCGGGTACAAGCCGGGTTATCTTAACCAGCTTCAACTTTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGGAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTc > 1:650259/1‑238 (MQ=255) gCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCCGCCCTTGCC‑TGAC‑GGGGCGG‑CCG‑AAAAAGGCCCCACG‑CA‑AAACACACCTCAATTAACCCCCGGGTCCAAGACGCGTTATTTTAACCAACTTCAACATATTTACTCCGC‑ACGCGGTAGTCAC‑CCCCTATGCGCAAAACACGTAG‑CTGTTAAAGCCATccca > 2:756069/1‑237 (MQ=255) cggcAGCCCGGTGGCGGCCAGTGACCAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAg < 2:259787/235‑1 (MQ=255) gACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCa < 1:843634/239‑1 (MQ=255) aGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAACCAATGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CGG‑GAAAAAACCCCACG‑CA‑AATCGCATCTCAAATAAACCCCGGTTACAAACAGGGGTATCTTAACCAACTTCAACTGTTGTTTGCCGC‑ACCCCCAGTGCAC‑ACCAAATGGGGAAACCCTGATGTTTGTTAAA‑CCTTGCCGCaaa > 2:420415/1‑237 (MQ=255) ccGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACa < 1:781110/236‑1 (MQ=255) tGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAACCCGCCCG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGGTTAAAGCCGGGTTATCTTTACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGGTATGCAA‑CCCCTGTGGGGAAACCGTGATG‑CTGTTTAAGCCTTTCCGCAACAGCTggga > 1:269629/1‑237 (MQ=255) ggcggccAGTGAACAGGGCAAGTCACGGCGGCAGGGGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCA‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATAGGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCa < 2:296569/232‑1 (MQ=255) ggCTGTCGGTTAACAGGGCGAGGGATTGCCGCGGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCATCCATTGCC‑TGAA‑GGGGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCa < 2:749547/238‑1 (MQ=255) ggCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTc < 1:1093341/238‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTcc < 1:295003/235‑1 (MQ=255) aCTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGc < 2:708815/239‑1 (MQ=255) aCTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGc < 1:774056/239‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCg < 1:521225/239‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCg < 1:409154/239‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCg < 2:359639/239‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTGCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCCGTTTCCAGCCg < 1:923668/239‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCGGAAGCCACGGAAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGc < 1:572852/239‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGc < 1:1073046/239‑1 (MQ=255) cGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAg < 1:756069/239‑1 (MQ=255) gcAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTtaata < 2:144541/239‑1 (MQ=255) cACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATggg < 1:995657/239‑1 (MQ=255) cACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATg < 1:677758/237‑1 (MQ=255) cgtaaataatGCCGGAGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAC‑AAAAAGCCCGCACG‑AA‑AGTCGAACCGCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGGTTCCAGCCGCAGTTTAATAAAGGGGTa < 2:1124638/235‑1 (MQ=255) cGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa < 1:267145/239‑1 (MQ=255) cGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa < 2:463319/239‑1 (MQ=255) cGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa < 1:214423/239‑1 (MQ=255) cGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa < 1:343764/239‑1 (MQ=255) ggCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTag < 1:20902/239‑1 (MQ=255) gaaataatGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGTGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AGTCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTATCCAGCTTCAACGGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTag < 2:78299/236‑1 (MQ=255) gaaataatGGCGAGGATACAGACAGTTCC‑CGCA‑GTTGC‑G‑CAGAAAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCCCAATTACCCTAAGATGACAAGCACTTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGGTGGTTGCCGC‑ACGCCATAAGGAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGAGT‑CTGTTAAAGGCTTCCAGCAACATCTGGCTGAGGGGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTACAAAATGGGTa < 2:150101/235‑1 (MQ=255) taatGGCGGTGATCCATCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTa < 1:624992/239‑1 (MQ=255) taatGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTa < 2:650259/239‑1 (MQ=255) taatGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTa < 1:93157/239‑1 (MQ=255) cGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑TAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGAc < 1:1209372/238‑1 (MQ=255) cGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGAc < 1:233860/238‑1 (MQ=255) cGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGAc < 2:657996/238‑1 (MQ=255) tCCAGCCATTGCC‑TGAA‑TGTGCGA‑CAG‑AAAAAGCCCGCCCG‑CA‑AAACGAATCTCAATTTGCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATcc < 1:598325/238‑1 (MQ=255) tCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATcc < 1:924298/238‑1 (MQ=255) ccAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTg < 2:885042/239‑1 (MQ=255) tGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa < 1:897634/212‑1 (MQ=255) tGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTa > 2:897634/1‑212 (MQ=255) tGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAAc > 1:469290/1‑239 (MQ=255) c‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACggg < 1:435051/239‑1 (MQ=255) gAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGAt < 1:704034/239‑1 (MQ=255) aa‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATg > 2:537715/1‑239 (MQ=255) tGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCAc > 2:680634/1‑239 (MQ=255) tGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCAc > 1:928846/1‑239 (MQ=255) tGCGG‑CAG‑AAAAAGCACGCAAG‑CA‑AAGCGAACCGCAATTACCCGGAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCGGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGc < 1:1089025/237‑1 (MQ=255) | GTATGATAAAAACAGGGGGCAAGGGATGTTGCTTAATATGATGTGTGGTCGTCAGCTGTCGGCAATCAGTTTGTGCCTGGCCGTAACATTCGCTCCACTGTTCAATGCGCAGGCCGATGAGCCTGAAGTAATCCCTGGCGACAGCCCGGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCC‑TGAA‑GGTGCGG‑CAG‑AAAAAGCCCGCACG‑CA‑AATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGC‑ACGCGATATGCAA‑CCCATGTGGGAAAACCGTGATG‑CTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCAC > NC_000913/981022‑981491 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |