| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,239,840 | A→G | 12.0% | E321G (GAG→GGG) | dadX → | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,239,840 | 0 | A | G | 12.0% | 236.3 / 2.6 | 100 | E321G (GAG→GGG) | dadX | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/54); new base G (12/2); total (44/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATG > NC_000913/1239604‑1240075 | ccAGGCGCTAAAAGCGGGCGGGCGTGGGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAg < 1:702036/238‑1 (MQ=255) cAGACGCTGAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTGCCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCt < 1:249060/239‑1 (MQ=255) aCGCGAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGGGCGCCATGAGCAGCGAATCTGCCTTGTCGCCGGCGGGGACGCCGCCGGGTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGCGGGCGGCGGGCGCTCCCCGCCGGAGGGGGCCGCCCCGCTTGATATGCTCGCGGGCGCTTTCCCGCCTGGCCCGCAGGCGGGGGTGGGGAGGCCGTGTGTGCtgtg > 2:508314/1‑239 (MQ=255) aaaaGCGGGCGGGCGTGTGGGCTGCGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAAACGGCATTGTCGCCGCATGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGc < 2:1049563/238‑1 (MQ=255) aaGCGGGCGGGCGTGTGGGCTACGGCGGGCGGTATACTGCGCGCGTTTAACAGCGAATCGGCATTGGCGCCGCAGGGTACGACGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGGCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAg < 2:1130136/239‑1 (MQ=255) gCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGAt < 1:58503/238‑1 (MQ=255) cGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCCCCGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTTCCGGTACCCCTGTTTTAGTGGGCGGCGTGCGCCCCATGCCGGGGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGGCGGTTTAACGCCTTGCCCGCCGGCGGGGATTTTTACGCCGGGGGTGCTGTGGGGGCAGgaggcgc > 2:1159734/1‑235 (MQ=255) taCTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCg < 1:991382/239‑1 (MQ=255) gcgcgcGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGGACGCCGGTTGAGCTGTGGGGGAAGGGGGTCAAAATT‑GGTGATGTCGGCGCCGCCGCCGGAAc > 1:400665/1‑239 (MQ=255) gcgcgcGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTGTAGGTGTGGGGGAAGGGGATCAAAAAT‑GTTGATGTTGGCGCCGCTGCCGGGAc > 1:1130074/1‑239 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAgg < 2:477816/201‑1 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAgg > 1:477816/1‑201 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTTGTACGGCGGGTTGGCTTTGGGGGAAGGAGATCCAACTTGGAGGTTGTC‑CCGCCGCTGCCggggcg > 2:171560/1‑235 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGGGCTGGGGGGGCAGGGGATCAAAAAT‑TATGATGTCGCCCCCGCTGCCGGGACg > 1:180447/1‑239 (MQ=255) gcgctATGATCAGCGAATCGTCATTGTCGCCGCGAGGTACGCCGACGGTTGTCCGCGCCACGCGCGTACCGGTTCCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACg < 2:739677/238‑1 (MQ=255) gcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTGTTGGTAAGCCGGTTGTGCTGTGGGGCAAGGGGAGCAAAATT‑GTTGTAGTCGCCCCCGCTGCCGGGACgg > 1:1056061/1‑239 (MQ=255) cgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGGGGGGCAAGGAGATTAAAATT‑GATGATGTCCCCGCCGACGCCGGAGCGGt > 1:125964/1‑239 (MQ=255) gcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTg < 1:225560/239‑1 (MQ=255) gcgATGAACAGCGAACCGGCATTGTCGGCGCGGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGGTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGt < 2:526546/238‑1 (MQ=255) gcgATGAAAAACGAACCGGCATTGTCGCCGAAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCAAGCGCCTACCGGTCCCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGt < 1:293982/238‑1 (MQ=255) gATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCCTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTGTTTGTACCGCGGTTGGGCTGTGGGGCGACGGGGCACAAATT‑GATTATGGTGCCGCCGCAGCCGGTACgggagg > 2:1153008/1‑235 (MQ=255) tGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCt < 1:414320/239‑1 (MQ=255) gAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTTGGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGGGGGTATGAGTTg > 1:296397/1‑239 (MQ=255) ggCATTGTGGCAGACGGGTACGCCGAGGGTTATTCGTGCCGCGGGCCTACCGGTACCACTGTTTTAGTGGGAGGATGGGGCTTCATGACGGTGGGGCCCGTCTCGATGGATACGCTAGCGGTCGATTTATCGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAACTT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGAtgtg < 2:552156/239‑1 (MQ=255) gCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGAtgtg < 1:842062/238‑1 (MQ=255) ttGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTgcgcg < 1:132886/239‑1 (MQ=255) gTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTAcg < 1:171560/237‑1 (MQ=255) aCGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTc < 1:836738/239‑1 (MQ=255) cGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGTACCGTCTCGATGGATATGCTAGCTGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTTGTACGGCCGTGTTGCCGTGGGGCAAGGGGGTCAGAATT‑GAGGTTGTCGCCGCCGCTTCCGCAACGGGGGGCCTTGAGGTCGTGGGAGGGCTGGCGCCACTCGGTCCGCTtg > 2:508312/1‑239 (MQ=255) tacccGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCGGTGTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 2:152703/235‑1 (MQ=255) tATCCGCGCCCCGCGCCTACCGGTGCCCCTGTTTGAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 1:221470/238‑1 (MQ=255) tATCCGCGCCAGGCGCCTCCCGGTACCCCTGTTTTAGGGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 1:1196266/238‑1 (MQ=255) tATCCGCGCCACGCGCCGACCGGTACCCCTGTTGTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 1:523174/238‑1 (MQ=255) cgccgcccctggcttgccGGTCACCCTGGTTTGGGGGAGGGCGTGGGCACCAGGACGGTGGGGCCCGGCTCGATGGATATGCTGGCGGTGGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGgt < 2:861639/223‑1 (MQ=255) cTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑a < 1:525579/239‑1 (MQ=255) aCCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGGGGTTTGGGGCAGAGGGGTCACAATT‑GATGGTGTCCCCGCCCCTGCCGGAAGGGTGGGGGATGAGATTTCGGGCGCGGTGGCGGCACGGGGGCCGGGTGGGGAGGGGTAACTttttgttatcgggg > 2:647041/1‑230 (MQ=255) ccccTGTTGTAGTGGAGGGGGTGCGGGCCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCGGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATc < 2:1213002/239‑1 (MQ=255) cTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGTTGTGGGGGCAGGGGATCAAAATT‑GATGGTGTCGCCGCCGCTTCCGGGACGGTGGGGTATGGGTTTATTTGCGCGCCGGCGCTCCGCGTCCCCGTTGGGACGGGGTGACTTGTTTT‑AAGCCGGGGCGGa > 2:307715/1‑239 (MQ=255) gTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGGTGGGCTGTGGGGCGAGGGGATCAAAATT‑GGTGATGTCGCCGCCGCGGGCGGGACGGGGGGCCATGAGTTGATGTGGGCGCTGGGGCCACGCGTCCCCGGTGTGACGGGGGGACTTGTTGG‑AAGCCggggaggagg > 2:56037/1‑231 (MQ=255) tttAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGc < 1:844008/238‑1 (MQ=255) gtAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCaa < 1:540886/238‑1 (MQ=255) gACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGAGCTGGTGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCCGCCGGGACGGTGGGCTATGAGTTGGTGTGGGCGCTGGCGCTACGCGGCCCGGTTGTGGCGGGGGTACTTTTTGG‑AAACCGGAATGGGGGGAACgacct > 2:732233/1‑235 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGGCAGGAGAGCAAAATT‑GGTGATTTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGCGATGGGTTGATGTGCGCGGTGGCGCCACGCGTCCCGGGTGGGGCGGGGTAACTTGTTGT‑AAGGCGGGTCGGAGGCAACGgc‑t > 2:479876/1‑236 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGGGGCAGGGGACCAAAATT‑GATGATTTCGCCGCCGGTGCCGGGACGGGGGGGTGTGGGTTTATGTGCGCGCTGGGGCCACGCGCCCCGGTTGGGGCGGGGGACCTTTTTGT‑AAGGCgggacggggggcacgggt > 2:953763/1‑220 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGGGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GGTGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGGTATGGGTTGATTTGCGCGGTGGCGCTACGCGGCCCGGGTGTGACGGGGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATGGGGGGCCACGtc‑t > 2:461672/1‑236 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGGTGAGGTGTGGGGCAAGGGGGTCAAAAAT‑GGTTGTGTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGGGGGGTATGGGGTGTGGTGGGGGCTGGGGCCACGCGTCCCGGGTGGGGGGGTGTCAATTTTTGG‑AAGCCggggtggggggtccgcctttt > 2:491553/1‑220 (MQ=255) cGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GATGATGGCGCCGCCGCTGCCGGGAAGGGGGGGTGTGAGGTGATTTGGGCGCGGGGGCTACGCGGCCCGGTTGGGAGGGGGGTAATTGGTGG‑AAGCCGGGTCTGGGGGCACGGC‑TTCTggg > 2:1075457/1‑239 (MQ=255) gcACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCaa < 1:1153008/239‑1 (MQ=255) cATGAGGGTGGGGACCGGCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGAGTTAGCGCCTTGCCAGCAGGCGGGTATGGGTACGCCGGTTGGGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCaaaaaa < 2:516400/239‑1 (MQ=255) aTGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACCGCGGTTGGGCTGGGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GATGATGTTGCCGCCGGTGCCGGGAGGGGGGGCTATGAGGTGATGTGCGGGGTGGCGCTCCGCGGCCCGGGTGTGGCGGGGGAACTTGGTGT‑AAGGCGGGCCTGAGGCAACCGC‑CTCTGGGGGGcaaaaaa > 2:1094058/1‑239 (MQ=255) gACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTTGGACGCCGGGTGGGGTGGGGGGGAAGGGGGTCAAAATT‑GGTGATGTCGCCGCCGCGGCCGGGACGGGGGGGGATGGGATGGTGTGGGGGCTGGGGCTCGCCGTGCCGGGTGGGACGGGGGAACTTGTTGT‑GAGCCGGGGCGGAGGCGACCGC‑CTCTGGGGGCGCAAAAatc > 2:595118/1‑239 (MQ=255) gggACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTTTGGGGCAAGGGGGTCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCCGGACGGGGGGCTATGAGGTGATTTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGGTGTGGCGGGGGCACTTGTTGT‑AAGCCGGGGCGGGGGGCACGGT‑TTCTGGGGGCAAAACAATctttcat > 2:263821/1‑238 (MQ=255) ccGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGAGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGAGCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGc < 1:384695/239‑1 (MQ=255) gTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTg < 1:196985/239‑1 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGGTTTGTACGCCGGGTGAGGTTTGGGGCCAGGGGATCAAAATT‑GATGGTGTCCCCGCCGCGTCCGGGACGGGGGGGCATGGGTTGTGTTGCGGGCCGGCCCTAAGCGGCCCGGTGTGGGTGGGGGGACTTGTTGTCAAGCCGG‑TCGGGGGCAACGTG‑TTCTTGGGGGCAAAACATCaaccctcccggcag > 2:1168616/1‑233 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTTGTGCAGCGGTTTAGTTTAGGGGCCAGGGGATCAAAAAT‑GCTGATGTCGCCCGCGCTGCCGGGACGGGGGGCTATGAGTTTATGTGCGCGCCGGCGCTACGCGTCCCGGGTTTGGCGGGGGGAACTGTTTT‑AAACCGGCGTGGGGGGGACCTCTTTGTGGGGGC‑AAAAAATCATTCATCCgcacgg > 2:167996/1‑234 (MQ=255) tggATGGATAGGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCGGGCGGGTATTGGTACGCGGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTc < 2:1073477/237‑1 (MQ=255) aTGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGAATGGTACGCCGGGTGGGCTGTGGGGCCAGGAGGTCACAATT‑GATGAGGTCGCCGCCGCCGCCGGGACGGTGGGCGATGCGTTGATGTGCGCGGTTGCGCTACGCGCGCCGGTTGTGCGCGTGGAACTTTTTGT‑GAGCCGGGTTGGTGGTGACGTCTTTGTGGGGGCaaaaaatactacaactcgcccgtgcg > 2:77044/1‑218 (MQ=255) tGGGTATGCTAGCGGTCGAGTTAACGCGGGGCCGGCAGGGGGGGAGTGGTACGCCGGTGGAGGTGGGGGGCAAGGAGATCAAAAGT‑GAGGAGGGCGGCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCGATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTG‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCAGCCATCCGGCTGGTCAGc < 2:17296/238‑1 (MQ=255) tGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGGGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGc < 2:93878/238‑1 (MQ=255) ggATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCaa < 1:307715/239‑1 (MQ=255) tatGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACt < 1:227614/238‑1 (MQ=255) ttggtAGGGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGGAGGCCGGTATGGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGTTCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCGATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGt < 2:729274/235‑1 (MQ=255) tGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGCGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GATGGTGTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGGGGGGTATGAGTTTGTGTGCGCGCTGGCGCTACCCGTCCCGGCTGTGACGGTGTTACTTGTTTT‑AAGCCGGGTCGGAGGGCCCGGC‑TTCTGGGTGGCAAAAAATCATCCCTTCCGCTGGGCAGCAAcagca > 2:165546/1‑235 (MQ=255) cTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGGGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGCTATGAGTTGATTTGGGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTTAATTGTTGG‑AAGCCGGATCGGGGGCCACGGC‑TTCTGGGGGCAAAAAAATCATCCATCCGGCCGGTCCGCCAATGTAgt > 2:199752/1‑239 (MQ=255) gaGCGGTCGATTTGACGCCGTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGGGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAgtt < 2:625261/238‑1 (MQ=255) aGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGGCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAgtt < 1:639256/238‑1 (MQ=255) aGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACCCCGGGTTAGGTGGCGGGGAAGGGGGGCAAAATT‑GAATATGTTGCCGCCCCTGCCGGGACGGTGGGCTAAGAGTTTAGGTGAGCGCTGGGGCTACCCGCACCGGTTGGGTCGGTGGGACTTGTTGT‑AAGGCGGCTCGGAGGCAAAGGT‑TTCTGGGTGAGAAAAAATCATCAATCCGGCAGGGGCGCACATGTAgttg > 2:686910/1‑239 (MQ=255) cGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCAAGGAGAGCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGGGGGGTATGAGGTGATGTGCGCGCCGGCGCCCCGCGGCCCGGGTGGGGAGGGGTTACTTGTTGT‑CAGCCGGGTCCGGGGGCACGGC‑TTTTGGGGGCGAAAAAATCATCCATCCGGCTGGGCAGCAACTTTAgttggt > 2:35180/1‑237 (MQ=255) tAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACa < 1:607402/239‑1 (MQ=255) ctggCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:758800/236‑1 (MQ=255) ctggCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCGGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 2:986060/236‑1 (MQ=255) cgtGCCCGCAGGGGGTGATGGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:508314/237‑1 (MQ=255) catGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGGGGTGGGGCAAGGGGATCAAAATT‑GATTATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 2:296397/237‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:180838/239‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:35180/239‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTGGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATG‑GAGGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:978599/239‑1 (MQ=255) tGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGGTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:523884/239‑1 (MQ=255) tGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTTAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGGTGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGGGGCTATGAGTTGGTGTGCGCGCCGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGGCGGGGGAAATTTTTGT‑TAACCGGGTCGGGGGCCACGGC‑TTCTGGGGGCGAAAAAATCATCCCACCGGCTGGCGAGCGACTTTAGTTGTTTATGTGAAAAAGCCAtt > 2:242412/1‑239 (MQ=255) gCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 2:180447/238‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGcc < 1:1159734/239‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGc < 1:479876/238‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGGGTAGTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGcc < 2:400665/239‑1 (MQ=255) ggCGGGTATTGGTACGCCGGTTTGGCTGTGGGGGAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGCTATGAGTTGGTGTGCGCGCTGGCGCTACGCGGCCCGGTTGTGACGGGGTTACTTGTTGT‑TAGCCGGGTCGGAGGCCACGGC‑TTTTGGGGGGAAAAAAATAATCCATCCGGCGGGTCCACAACTGTAGTGGTTCAAGGGACCACGCCATTTCCCCTGa > 2:680202/1‑239 (MQ=255) aTTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAgtgt < 1:200093/238‑1 (MQ=255) tGGTCCGCCGGTTGAGCGGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCa < 1:15405/239‑1 (MQ=255) aCGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaa > 1:387634/1‑239 (MQ=255) cGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGCCCAAAATT‑GCTGATGTCGCCGCCGCTTCCGCACCGGTGGGCTATGAGTTGATGCGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTTACTTGTTGT‑ACGCCGGATCGGAGGCAACGCC‑TTCTGGGTGCATAAAATTCATCCATGTGGCTTGTCAGCAACTGTCACTGTCAATGAGACAGAGCCATTGCCCATGCCAGTGTCCATTaa > 2:113707/1‑238 (MQ=255) cGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGCGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaaa > 1:338241/1‑239 (MQ=255) gCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaaaa > 2:1145554/1‑239 (MQ=255) gCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaaaa > 1:981849/1‑239 (MQ=255) gCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaaaa > 2:517028/1‑239 (MQ=255) gCCGGATGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaaaa > 2:519418/1‑239 (MQ=255) ccGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAg > 2:730520/1‑239 (MQ=255) ccGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGGCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTCCCCAGGTTAGTGTCCATTAAAAg > 2:531939/1‑239 (MQ=255) ccGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGATGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAg > 2:936530/1‑239 (MQ=255) gTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGAt > 2:90867/1‑239 (MQ=255) tGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATg < 1:661521/238‑1 (MQ=255) tGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATg < 1:461672/238‑1 (MQ=255) tGAGCTGTGGGGCAAGGAGAACAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTACATTAAAAGGATg < 1:358468/238‑1 (MQ=255) | CCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATT‑GATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGT‑AAGCCGGATCGGAGGCAACGTC‑TTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATG > NC_000913/1239604‑1240075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |