| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,513,778 | T→G | 13.8% | V321G (GTG→GGG) | ydcT → | putative ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,513,778 | 0 | T | G | 13.8% | 204.5 / 2.6 | 80 | V321G (GTG→GGG) | ydcT | putative ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/42); new base G (11/2); total (36/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.58e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTCGCGTGATGTGATGGTG‑CCGCTGGTTGAGGAGAGGTGAATGGCGATGAATGTATTGCAA‑TCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGA > NC_000913/1513542‑1514012 | tGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGa < 1:681292/239‑1 (MQ=255) tGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTcc < 1:61927/239‑1 (MQ=255) cAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTg < 1:789453/238‑1 (MQ=255) agagAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACCGGTTGTGAGTCAGGGCAATAAAACAGGCGGAGAACTAGCCGTCAAGCCCACGCCCGGCCAAACGGCGAGGGTTTCCTg > 2:515059/1‑237 (MQ=255) agaAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGGGAAAAACTGGTTGTGAGGCAGGCCAATATGAAAGGCGAAGAACTGCCCGCCACGGTCACGCCCGGAACACAGGTGGTGGGTTTCTGGTcg > 1:286126/1‑239 (MQ=255) aaCTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTcgcg < 1:730019/238‑1 (MQ=255) tgtgGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGACCATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTCGCgtgatgt < 1:780810/239‑1 (MQ=255) tgGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGGGGCAGGGCAATATGACAGGCGGAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGGGGTGGTTTTCTGGTTGCggggtgtga > 1:659623/1‑239 (MQ=255) cGGGAAGCTTCGACAGAGAACCGGTACATATCGGCCGCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCCGTAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGTCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACACCAGGTGATGGTTTCCTGCTCGCGTGATGTGATGGTG‑CCg < 2:1203665/239‑1 (MQ=255) agggAAGCTGCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCGTCAACACCCCTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCTGTGCAATATCAGGGCGAGGAAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTCGCGTGATGTGATGGTG‑CCg < 2:717505/238‑1 (MQ=255) 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1:390034/192‑1 (MQ=255) cTGGTGAACTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACCGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGAAAGGCGAAGAAATGCCCGCCCCGCTCACGCCCGGACAAAAGGGGATGGGTTTCTGGTCGCGGGATGTGGTGGGG‑CCGGCGGCTGAGGAGAGGGGAATGGCGGTGACTGTATTGCAA‑TCaacg > 2:24530/1‑236 (MQ=255) aCTGCAGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTCGCGTGATGTGATGGTG‑CCGCTGGTTGAGGAGAGGTGAATGGCGATGAATGTATTGCAA‑TCACCTTCACGTc < 1:1147986/239‑1 (MQ=255) aGGCCAATGGCACGATCCAGGCGGTGCAATATCAGGGCGCGGCAACTCGTTTTGAACTGAAATTGAACGGCGGTGAAAAACTGCTTGTGAGTCAGGCCAATATGACAGGCGAAGAACTGCCTGCCACGCTCACGCCCGGACAACAGGTGATGGTTTCCTGGTCGCGTGATGTGATGGTG‑CCGCTGGTTGAGGAGAGGTGAATGGCGATGAATGTATTGCAA‑TCACCTTCACGTCCAgg < 2:397207/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |