Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 469,190 | T→C | 4.0% | F107S (TTT→TCT) | mdlA → | putative multidrug ABC transporter ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 469,190 | 0 | T | C | 4.0% | 385.0 / 2.5 | 114 | F107S (TTT→TCT) | mdlA | putative multidrug ABC transporter ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/61); new base C (3/2); total (51/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCGTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTG‑ATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAA > NC_000913/468952‑469422 | aTCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGtt > 1:243305/1‑239 (MQ=255) cgcgATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGGATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGtttt > 1:1126327/1‑239 (MQ=255) gATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTAcc < 2:406724/239‑1 (MQ=255) gATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTAc < 1:1072381/238‑1 (MQ=255) aTGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGTGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGTGTTTTa > 2:1215275/1‑236 (MQ=255) aaCTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCa < 1:93036/238‑1 (MQ=255) ttCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTTTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACAATGGTGCTGATTGCCGCTGTGGTTGATATCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGATGTTTGGTGCGTTTTCGCAACTGGCTGTTGCACTTCGTGAAGTTTATTACCGTCCGCTAAGCCGGAAGCATCCTGAGTTTTTCCTGCGTTCTCGCaac > 2:952016/1‑237 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |