Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,661,662 | A→G | 12.1% | E417G (GAG→GGG) | mdtF → | anaerobic multidrug efflux transporter, ArcA‑regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,661,662 | 0 | A | G | 12.1% | 321.1 / 3.5 | 138 | E417G (GAG→GGG) | mdtF | anaerobic multidrug efflux transporter, ArcA‑regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (59/55); new base G (9/11); total (71/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CAGGAAGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACCCCTGCCCTGT > NC_000913/3661424‑3661889 | cAGGAAGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGa < 2:1168351/239‑1 (MQ=255) aaGTTTTGAAAACACTGGTTGAGGGTATCAGCCTAGTCTTCCTGGGCAGGTAGCTGTTTGTGCAGGATTTCCGGGCCACAAGCGTCCCGACGATTGCCGTAACGGTTGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTGGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTGCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCg < 2:355306/238‑1 (MQ=38) aaGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAg < 1:526839/236‑1 (MQ=255) tttCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTTTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTGGGTTTCACTCTCAACACGTTGACTATGTTTGTGATGGTGCTGGCGCTATGGTTACGTGTGGATGACGCCATCGTTGTGGGCGGGGACGTCCCGCGTTTCa > 2:779785/1‑239 (MQ=255) tttCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCAGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCgtgt < 1:210991/237‑1 (MQ=255) aaaCTCTTGTTTAGGCTCTCAACCTAGTCTCCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTAACGGTGGTTATTCTCGGGCCGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCg < 2:874214/239‑1 (MQ=255) ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGGCTATGTTCGGGGTGGTGGTGGCGCTGGGGTTCCCGGCGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGGGGACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATCAGCTa > 2:545536/1‑238 (MQ=255) ggCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGGACGTCGAGCGGGTCATTGTGGAAGATAATCTa > 2:910995/1‑238 (MQ=255) gCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGGTTGGGGTACTGGTGGATGACGCCATCGGGGTGGTGGAGGACGTCGGGCGGGTCATTGCGGAAAATAAGCTAcc > 2:193810/1‑239 (MQ=255) gCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGGTGGCTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCGATCGTGGTGGGGGGGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCGAcc > 1:1112041/1‑239 (MQ=255) tATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTAccg < 1:309717/238‑1 (MQ=255) tcatcCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTAccgccg > 1:740960/1‑239 (MQ=255) tcatcCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGTTCACCATCAACACGTTGACTATGGTCGGGGTGGTGCTGGCGATAGGGTTAATGGTGGATGACGCCATCGTGGGGGGGGAGAAAGTCGGGTGTGTGATTGCGGAGGATAAGATAccgccg > 2:290293/1‑239 (MQ=255) catcCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCga < 1:173647/239‑1 (MQ=255) tAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGCCTATGTTCGGGATGGGGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGGGTGTCATTGCGGAAGAGAAGCTACCGCCggaggaa > 2:1093836/1‑239 (MQ=255) cTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCg > 1:817087/1‑238 (MQ=255) tCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGTTGGTGCTGGCGGTAGGGGTACTGGTGGATGACGCCATCGGGGTGGGTGAGAACGTCGAGGGTGTCATTGCGGAGGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGAc > 2:364245/1‑238 (MQ=255) ccTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCCACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGGGGATGCCGCCCTCGGGGTGGTGGAGAACGGCGAGGGGGTCATTGCGGAGGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGc > 2:347801/1‑239 (MQ=255) ccTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACg > 1:608026/1‑238 (MQ=255) tGGTTATGTATCTGTTTGTGGTGAATTGCCGTGCCCCAATTATCCCGACGATTGCCGTCCCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGGCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCAt < 2:1214632/239‑1 (MQ=39) ggTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGGGCGGGGCATTGCGGCAGATAAGCTACCGCCGGAGGAAGCGACGCATa > 1:685712/1‑239 (MQ=255) tcagttATCTGTTTTTGCAGTATTTCCGTGCCACAATCACCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATaa < 2:1065970/233‑1 (MQ=255) tGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCg > 1:725194/1‑239 (MQ=255) tGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCGCCACGCCGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTGGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg < 2:1206957/239‑1 (MQ=255) tGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg < 1:910995/239‑1 (MQ=255) tGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg < 1:347801/239‑1 (MQ=255) tGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGCTACTGGCGGATGACGCCCTCGGGGGGGTGGGGAACGTCGAGCGGGTCATTGCGGAAGATAAGCTAACGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATgggg > 1:355394/1‑239 (MQ=255) gTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGGAGAGACGCATAAATCGATGGGGc > 1:722496/1‑239 (MQ=255) tttGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCTGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGGGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGGAAGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATCAATTGGTGGGGCAgg > 1:319809/1‑238 (MQ=255) aTTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAAc < 1:1011029/237‑1 (MQ=255) tCCGAGCCACATTCACCCCGACGATTGCCGTACAGGTGGTTATTCGCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCGCCATCAACACGTTGACTAGGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTgcg < 2:1123081/239‑1 (MQ=255) cccGTGCCACAATCACCCCGACGATTGCCTTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTgcg < 1:545536/238‑1 (MQ=255) gTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTg < 1:193810/239‑1 (MQ=255) gCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGGCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGAGGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGt < 1:1093836/239‑1 (MQ=255) ccACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTGGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGt < 1:199257/238‑1 (MQ=255) ccACAACCGTCCCGATGATTGCCGGACCGGTTTTGATTTCCGGGCAGTTTGTGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCGCCATCACCACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGAGGACGCCATCGTGGGGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTTCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGt < 2:716587/238‑1 (MQ=255) atcatcCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTAt < 2:817087/239‑1 (MQ=255) acgaTTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGCTCTTGTCGGCGGTCGGTTTCAACATCCACACGTTGTCTCTGTTCGGGTTGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGGGGAAGCCCTCGCGGTGGTGGGGGACGTCGAGCGTGTTCTTTCGGAAATTAAGCTTCCGCCGAAGGCAGCGACCGATAAATCGTTGGGGCCGATCCCACGTGCGCTgggtcgcattggcccatt > 2:224364/1‑223 (MQ=255) ttGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCCCCCTCCACACGTTGGCTATGGTCGGGATGGTGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGCTGACGCCATCGCGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGATACCGCCGCAGGAAGCGACGCATAACTCGATGGGGCAAATCCAACTGGCGCTGGGCGGCATTGCCGCTGTtttt > 2:1109180/1‑239 (MQ=255) ttGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCCCCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCt < 1:917832/238‑1 (MQ=255) gTACCGGTGGTTATTCTCGGTACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 1:1153904/239‑1 (MQ=255) gTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 1:712229/239‑1 (MQ=255) gTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGc < 2:311327/239‑1 (MQ=255) tACCGGTGGTTATTCGCGGGGCGGTTGCGATCTTGGCGGGGGGCGGGTTCACCAGCAAACCGGTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGGGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGGTCTTTCCGc < 2:233035/238‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCa < 2:145959/238‑1 (MQ=255) ggtTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCCTCAACACGTTGACTCTGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGGTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGGAGGAAGCGACGCATAAATCGGTGGGGCAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGGGTTGCCGTTGGTCTTTCCGCAGTGTTTa > 2:1162145/1‑239 (MQ=39) ttCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGGTAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGGAGATAAGCTACCGCCGGAGGAAGCGACGCATAAATTGATGGGGCAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCCGTGTTTATGCCg > 1:786991/1‑239 (MQ=255) ttCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTATCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAAAGTGCGCCGGTCGGCATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATTCCg > 1:995916/1‑239 (MQ=255) ttCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGGGTTACCATCCACCCGTTTACTATGGTCGGGATGGTGGTGGCGATATGGTTTCTCGCGGATGACGCCGTCGTGGGGGGGGGGAACGTGGAGCGGGTCCTTGCGGAAGATAAGGTAACGGCGCAGGAAAGGACGCATAAATCGACTGGGCGAATCCCACCTGCCGAGGTCGGAATTGACGGTGTTCTTTCGGccggtcttcagggg > 2:720477/1‑226 (MQ=255) tgtcGGGACGTTTGCGATCTGGTCGTCGGGCGGTTGCTCCATCAACACGTTAACTAGGTTCGGGTTGGGGGTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCGTCGTGGTGGTGGAGAACGTGGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGa < 2:326910/237‑1 (MQ=255) cGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGGCTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGGTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGGGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGGAGATAAGCTACCGGCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATTGGGCAGATCCAACGTGGGCTGGGCGGGATTGACGCTGGTCTTTCCGCAGTGGTTATGCCGGTgg > 2:579514/1‑239 (MQ=255) gggACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTTACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGTAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGGAGATAAGCTACCGCCGGAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGGGCGCCGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATgg > 2:179192/1‑238 (MQ=255) gggACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATgg > 1:772683/1‑238 (MQ=255) gTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTa > 1:1211821/1‑239 (MQ=255) gTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTa > 1:929260/1‑239 (MQ=255) ttGCGATCTTGTCGGCGGTAGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTTGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGGGAACGTCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGGATAAATCGATGGGGCAGATCCCACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCCTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATg > 1:600294/1‑239 (MQ=255) ttGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGc < 1:447908/143‑1 (MQ=255) gTCGGCGGTCGGTTTCACCCTCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGGGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGGATTGGCGTTGTTCTTTTCCCCGTGTTTATTCCGGTGGCCTTTATGAGCGGTGCa > 2:855647/1‑238 (MQ=255) tataaccgcGTTGAGTATGTTGGGGTTGGGGCGGGGGAGAGGTTTGCTGGTGGATGACGCCATGGTGGTGGGGGAGAAGGGCGGGCGTGGCATGGGGGAAGATAAGCTCCCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGGGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGcc < 2:900696/231‑1 (MQ=255) tCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGt < 2:1187458/160‑1 (MQ=255) aaCTCGTGGACGATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACGGGTGGATGACGCCAGCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATGGCGGAAGATACGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGtt < 2:929260/239‑1 (MQ=255) ggcggagtggggggggggggtgggCAATGGGGTTATTGGAGGAGGAGGCCACCGGGGGGGTGGAGAACGGCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTCCCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCAt < 2:608026/216‑1 (MQ=255) gACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCCACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATc > 1:178203/1‑238 (MQ=255) cTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGCTGGCCTGTATGAGCGGTGCAACCGGGGCGATCTCCCGCCAGTTCTCCATCaa > 2:1132192/1‑237 (MQ=255) aTGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGCGGCGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCAACGCATAAATCGATGGGGCGGATCCAACGTGCGCTGGCCGGTATTGCCGTTGCTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGCGGCGATCTCCCGCCGGTGCTCCATCAc > 2:1049848/1‑236 (MQ=255) tGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCCCGCTg > 1:298201/1‑239 (MQ=255) tGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTg > 1:256845/1‑239 (MQ=255) tCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGa > 1:263096/1‑237 (MQ=255) ggATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGAtctc > 2:420693/1‑238 (MQ=255) ggTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCa > 1:539201/1‑239 (MQ=255) tGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCCACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAt > 1:456705/1‑238 (MQ=255) tGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCCACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCGTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATAACGCTGCTCTCCTCCAt > 1:1143886/1‑238 (MQ=255) gttggcgtatgggttctgggtggATGAGGCCATCGGGGTGGTGGAGAAGTTCGGGCGTGTCATGGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg < 1:289162/220‑1 (MQ=255) gctgccgtgaGGGTTATTGGTGTAGGACCCCATCGTGGTGGGGGAGAACGTCGAGCGTGTAATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg < 2:263096/229‑1 (MQ=255) gCTGGCGATAGGGTTAATGGTGGATGACGCCATCGTGGTGTGGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg < 1:840961/238‑1 (MQ=255) ggttggggTTACTGTTGGAGAAGGCCACGGTGGGGGTGAAGAACGCGGGGCGTGTAATGGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATgctgct < 2:773787/233‑1 (MQ=255) ggtagggtgtgtgggggagtaCGCAATCGGGGGGGGGGAGAACGCGGAGCTGGACATTGGGGAAGAGAAGCTCCCGCCGAAGGAAGCGACGCATAACGCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATTCCGATGGCCTTTATGAGCGGTTCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCtt < 2:554125/218‑1 (MQ=255) ttAGGGTTCCTGGGGGATGACGCCATCGTGGGGGGGGAGAACGTGGGGGGGGTCATGGGGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGGGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGGGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCttt < 2:772683/237‑1 (MQ=255) tAGGGTTTCTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTc < 1:540433/238‑1 (MQ=255) tAGGGTTAGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCa < 1:1034931/239‑1 (MQ=255) tAGGGTTACTGGGGAATGACGCCAGCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTc < 1:106973/238‑1 (MQ=255) aGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAg > 2:88014/1‑239 (MQ=255) aGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAg > 1:1004902/1‑239 (MQ=255) aGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACAGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAg > 1:722416/1‑239 (MQ=255) aGGGTTACTGGCGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTGCATCACGCTGCTCTCCTCCATGCTGCTTTCAg > 1:1085924/1‑239 (MQ=255) ggTTACTGGGGTATGACGCCATCGTGGGGGGGGAGAAGGTCGAGCGTTTCATTGCGGAAGATAAGCGACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTGCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGt < 2:319809/238‑1 (MQ=255) aCTGGTGGATGCCGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTTTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCATTCCGttcttg > 2:523443/1‑234 (MQ=255) aCTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTtg > 1:681305/1‑239 (MQ=255) ggggtgagggcGCCAGCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGGGGAAGAAAAGCTCTCGGCGAAGGGAGTGAGGCATAAGTCGATGGGGCTGATCCACCGTGGGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGTTGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTCACGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATgctgct < 2:442126/216‑1 (MQ=255) tgggATGACGCCATCGTGGTGGGGGAGAAGGCGGGCCGTGTCTATGGGGAAGAGAAGCTCCCGCCGAAGGAGGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTgg < 2:489877/236‑1 (MQ=255) aTGACGCCACCGTGGTGGTGGAGAACGGCGGGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAAt < 1:1162145/238‑1 (MQ=255) cGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTAttt > 1:442126/1‑226 (MQ=255) cGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAg > 1:1127916/1‑237 (MQ=255) gccaggttggtggtggAGAACGTCGGGGGTGTCTTTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAGGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGTTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTTTTTATGCCGTTGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCt < 2:1211821/232‑1 (MQ=255) gCCATCGTGGTGGTGGAGAACGGCGAGCGTGTCATTGCGGAAGAAAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCt < 1:1187777/239‑1 (MQ=255) cggggggattgagcACGTCATGCGTGTCATTGGGGAAGATGACCGCCCGCCGAAGGTGGCTACTCATAAATCGATGGGGCAGCTCCAACGTGCGCTGGTAGTTATGGTCGTTGCTCTTGCCGCAGTGTTTATGCCGTTGGCCTTTATGAGCGTTGCAACCGGGGAGCTCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATGTGTGGCAATGAGCCTGAccc < 2:611037/229‑1 (MQ=255) gtggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACccctgccc < 1:88072/238‑1 (MQ=255) gtggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACccctgc > 1:783385/1‑236 (MQ=255) tggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg > 2:520531/1‑197 (MQ=255) tggAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCAtg < 1:520531/197‑1 (MQ=255) | CAGGAAGTTTTCAAAACACTGGTTGAGGCTATCATCCTAGTCTTCCTGGTCATGTATCTGTTTTTGCAGAATTTCCGTGCCACAATCATCCCGACGATTGCCGTACCGGTGGTTATTCTCGGGACGTTTGCGATCTTGTCGGCGGTCGGTTTCACCATCAACACGTTGACTATGTTCGGGATGGTGCTGGCGATAGGGTTACTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGTGTCATTGCGGAAGATAAGCTACCGCCGAAGGAAGCGACGCATAAATCGATGGGGCAGATCCAACGTGCGCTGGTCGGTATTGCCGTTGTTCTTTCCGCAGTGTTTATGCCGATGGCCTTTATGAGCGGTGCAACCGGGGAGATCTACCGCCAGTTCTCCATCACGCTGATCTCCTCCATGCTGCTTTCAGTATTTGTGGCAATGAGCCTGACCCCTGCCCTGT > NC_000913/3661424‑3661889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |