| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,731,719 | 0 | C | A | 20.9% | 232.2 / 12.2 | 105 | A197E (GCA→GAA) | xylF | D‑xylose transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/25); new base A (2/21); total (56/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCGCGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATTCCGGAAAAATTAAAGTCGTTGGTGA‑CCAATGG‑G‑TTGATGGCTGGTTACC‑GGAAAACGCATTGAAAATTATGGAAAACGCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGTATAAACCTATTACGTTGTTGGCAAATACTGCCGC > NC_000913/3731481‑3731953 | gATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCGCGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATTCCGGAAAAATTAAAGTCGTTGGTGA‑CCAATGG‑G‑TTGATGGCTGGTTACC‑GGAAAACGc > 1:581559/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |