| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 3,451,524 | (GACTTC)3→2 | 2.8% | coding (154‑159/303 nt) | rplW ← | 50S ribosomal subunit protein L23 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3451517 = | 294 (1.160) | 8 (0.030) | 6/414 | NT | 2.8% | coding (166/303 nt) | rplW | 50S ribosomal subunit protein L23 |
| ? | NC_000913 | = 3451510 | 275 (1.160) | coding (173/303 nt) | rplW | 50S ribosomal subunit protein L23 | |||||
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
TACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAGCAGCTTTGATTTCTGCTTTGGTCGCGTCTTTAGCAACTTTGAGTACGATGGTGTTGGATTTTTCCATCGCAGTAGACGCTTTTTCAGAAACGTGCGGTGCACGCAGCACCTTCAGCAGACGTTCTTCACGAATCATGCCAGCATCTCCTCAACTTGCTTAACAGCATCAGCAGTCATTACGACTTTGTCGAAGGCGATCAGGCTAACCGGGTCGATACCAGTTGCATCGCGTACGTCAACCTTGTGCAGGTTGCGCGCA > NC_000913/3451233‑3451805 | tgttgttacgaccaccggatttgctgtttttttccagcaacggagcaaaaggtttgcccttgtgcagctcagggttaaccactttaactacgtggcgacgacccggagatgtcggtttacatttaacaactgccattgtattactcctccgacttactcagcgccgccaacgaagtccagattctggccttctttcagggtgacgtaagcttttttccagtcgctacgacgaccgatacgctgtccgtgacgtttaactttccctttaactaccagggtgttaacgact < 1:1046950‑M1/5‑1 (MQ=255)tgttgttacgaccaccggatttgctgtttttttccagcaacggagcaaaaggtttgcccttgtgcagctcagggttaaccactttaactacgtggcgacgacccggagatgtcggtttacatttaacaactgccattgtattactcctccgacttactcagcgccgccaacgaagtccagattctggccttctttcagggtgacgtaagcttttttccagtcgctacgacgaccgatacgctgtccgtgacgtttaactttccctttaactaccagggtgttaacgact < 2:888184‑M1/5‑1 (MQ=255) accaccGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGAAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTCACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAAcgacttcgacttcg > 1:1385410/1‑288 (MQ=255) caccGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAAcgacttcgacttcgact > 2:1796177/1‑289 (MQ=255) caccGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAAcgacttcgacttcgact > 2:1504614/1‑289 (MQ=255) tgATTTGCTGTGCTTACCCCGCAACATAGCAAATGTTTTGCCCTGTTTCTTCTCAGGGTTAACCACTTTAACCACGTGGCGACGACCCCGAGATGGCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTGCTCCTCCGACTTACTCAACGCCGCCTCCGAAGTCCAGATTCTTGTCTTATTTCAGGGTGACGTATGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACCACCGTTACTCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAAATACCAGAGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCaa < 1:2517861/288‑1 (MQ=255) tttGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAAc < 2:528717/288‑1 (MQ=255) tGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGttt < 2:116343/288‑1 (MQ=255) aaCGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAGCAGCttt < 2:2601939/289‑1 (MQ=255) aGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAGCAGCTTTGATTTCTGCTTTGGTCGCGTCTTTAg < 1:1504614/288‑1 (MQ=255) 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acgtggcgacgacccggagatgtcggtttacatttaacaactgccattgtattactcctccgacttactcagcgccgccaacgaagtccagattctggccttctttcagggtgacgtaagcttttttccagtcgctacgacgaccgatacgctgtccgtgacgtttaactttccctttaactaccagggtgttaacgacttcg > 2:1299479‑M1/196‑203 (MQ=255) agaTGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCAACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAGCAGCTTTGATTTCTGCTTTGGTCGCGTCTTTAGCAACTTTGAGTACGATGGTGTTGGATTTTTCCATCGCAGTa < 2:2135067/288‑1 (MQ=255) tCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAGCAGCTTTGATTTCTGCTTTGGTCGCGTCTTTAGCAACTTTGAGTACGATGGTGTTGGATTTTTCCATCGCAGTAGACGCt > 2:2528199/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |