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ttGTTATGGGTTAACTGGCGCGGCTCGCCGCCCTGTGGCGAGATAAGCCACAGTTGCACAATGCCGTTATCATCTCGCATTAAAAACGCGATTTGTGTACCCTGCGGATTACAGCGCACCCAGTGGCGCGGGACGTTGACTAACCCCGGATAAGCCCGATGGTGGGTAAAGGTTAAACGTCGCTGCACGACGCCACGCGGTGGCGCGGGCAGGGTTGTTTCCGTTCCGCTTAACGGCGCATCACCTGCCGCTTTCCAGCCAGCTTCATCTTGCGGTAACTCAACGATaa > 2:586527/1‑289 (MQ=255) ttGTTATGGGTTAACTGGCGCGGCTCGCCGCCCTGTGGCGAGATAAGCCACAGTTGCACAATGCCGTTATCATCTCGCATTAAAAACGCGATTTGTGTACCCTGCGGATTACAGCGCACCCAGTGGCGCGGGACGTTGACTAACCCCGGATAAGCCCGATGGTGGGTAAAGGTTAAACGTCGCTGCACGACGCCACGCGGTGGCGCGGGCAGGGTTGTTTCCGTTCCGCTTAACGGCGCATCACCTGCCGCTTTCCAGCCAGCTTCATCTTGCGGTAACTCAACGATaa > 2:204764/1‑289 (MQ=255) aCTGGCGCGGCTCGCCGCCCTGTGGCGAGATAAGCCACAGTTGCACAATGCCGTTATCATCTCGCATTAAAAACGCGATTTGTGTACCCt > 2:1924242/1‑90 (MQ=255) aCTGGCGCGGCTCGCCGCCCTGTGGCGAGATAAGCCACAGTTGCACAATGCCGTTATCATCTCGCATTAAAAACGCGATTTGTGTACCCTGCGGATTACAGCGCACCCAGTGGCGCGGGACGTTGACTAACCCCGGATAAGCCCGATGGTGGGTAAAGGTTAAACGTCGCTGCACGACGCCACGCGGTGGCGCGGGCAGGGTTGttt < 1:982739/207‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |