| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,817,907 | 0 | A | G | 2.9% | 738.9 / 6.5 | 213 | intergenic (‑49/+150) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (103/102); new base G (3/4); total (107/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
ATTTTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGA > NC_000913/2817621‑2818195 | tttttaGAAGGAGATTTTTTGGAGAAGGTGTGGGACCCGGGAGTGTGGCGCACTACCGTTCGCCCTTGGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGTTGCCGGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACTGAGAATATGGTTCATCCGGTAGGATTCGAACCGCCGACCGCTCGGTGCGCAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGCAAACTTATTCTACTCCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCata < 1:1923005/288‑1 (MQ=17) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |