Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,817,914 | T→G | 4.6% | intergenic (‑56/+143) | argQ ← / ← argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,817,914 | 0 | T | G | 4.6% | 761.9 / 27.8 | 217 | intergenic (‑56/+143) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (106/101); new base G (5/5); total (111/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.12e-01 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATG > NC_000913/2817627‑2818197 | ccGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGATCACTTATTCTACTACTGATATTGATACCGCTACTACCGCCATATCAATTAGGAGATGGTGCATCCGGAAGTATTATTc > 2:704598/1‑288 (MQ=255) 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cctGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACt > 1:2121755/1‑227 (MQ=255) cctGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCtt < 2:1595593/233‑1 (MQ=255) cctGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 1:2709971/252‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |