| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,418,396:1 | +C | 3.7% | coding (1318/1521 nt) | yfcC → | putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,418,394 | 1 | . | C | 3.7% | 446.2 / 8.6 | 107 | coding (1316/1521 nt) | yfcC | putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (51/52); new base C (2/2); total (53/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCACCGCTTGGCGATCTGGTCGGTGTTAA‑CCGTCAGGTTACCGTGCTGGCGTTCCAGTTTGGTGATGGCTTCAGTCACATCATTTACCCAACCTCAGCGTCGTTAATGGCAACGCTCGGTGTGTGCAGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTAGTGATCGGCGCTCAGTTGATGGGCTACCACTAAAAATGTTAAGAGCCGCAATTGCGGCTCT > NC_000913/2418158‑2418627 | gggTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCACCGCTTGGCGATCTGGTCGGTGTTAA‑cc > 2:26786/1‑239 (MQ=255) 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gAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCTTTATCAGCATTGCCCATGCCATTAGCGGTCTGGACAGCGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGTCGTCCGGTTCTGGTCGTGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCACCGCTTGGCGTTCTGGTCGGTGTTAA‑CCCTCAGGTTACCGTGCTGGCGTACCAGTTTGGTGATCGCt < 1:125048/238‑1 (MQ=255) gAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCACCGCTTGGCGATCTGGTCGGTGTTAA‑CCGTCAGGTTACCGTGCTGGCGTTCCAGTTTGGTGATGGCtt < 1:765377/239‑1 (MQ=255) aaGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCACCGCTTGGCGATCTGGTCGGTGTTAA‑CCGTCAGGTTACCGTGCTGGCGTTCCAGTTTGGTGATGGCTTc > 1:975289/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |