Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 433,649 | 0 | T | G | 27.6% | 116.7 / 20.2 | 100 | G65G (GGT→GGG) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (22/47); new base G (23/6); total (47/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.94e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.38e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACAT‑GGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATG‑GCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAAC‑GTGCGGGTGAA‑CCACATGCCGAAGTACAC‑GCGTTGCGTATGGCGGGTG‑AAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCG > NC_000913/433414‑433882 | aaGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGGCTGAGCCATGCAGGAGGAGTATTGCAT‑GGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGACATTGTCAAAGATG‑GCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAAC‑GTGCGGGTGAC‑CCACATGCCAAAGTACAC‑CCGTTGCTTATGGCGGGTA‑AAAAAGCCAAAGGTGCg < 1:916438/239‑1 (MQ=255) 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tttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACAT‑GGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATG‑GCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAAC‑GTGCGGGTGAA‑CCACATGCCGAAGTACAC‑GCGTTGCGTATGGCGGGGG‑AAAAAGCCAAAGGGGCGAcag > 2:1100729/1‑236 (MQ=255) tttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACAT‑GGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATG‑GCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAAC‑GTGCGGGGGAA‑CCACATGCCGAAGTACAC‑GCGTTGCGTATGGCGGGGG‑GCAAAGCCAAAGGGGCGAACg > 2:275783/1‑238 (MQ=255) ttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACAT‑GGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATG‑GCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAAC‑GTGCGGGTGAA‑CCACATGCCGAAGTACAC‑GCGTTGCGTATGGCGGGTG‑AAAAAGCCAAAGGTGCGACCGcc < 2:726749/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |