Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,308,962 | 0 | T | C | 12.2% | 327.0 / 3.0 | 119 | intergenic (‑40/+69) | nlpI/pnp | lipoprotein involved in osmotic sensitivity and filamentation/polynucleotide phosphorylase/polyadenylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/32); new base C (2/17); total (68/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.51e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCCTGCTGTAAAGTCGGTTGCAATGGTACCGCGAGGACTTCACTTTTACGCCAGGAAGTATTACTGCATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAA‑‑ACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACT‑CCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCGGTACTTCCTGACCCATCTGCAGGTAATCGGTCACTTTCTCAACGCG > NC_000913/3308726‑3309195 | tataAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCCTGCTGTAAAGTCGGTTGCAATGGTACCGCGAGGACTTCACTTTTACGCCAGGAAGTATTACTGCATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAA‑‑ACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACT‑CCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTcc < 1:710434/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |