| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 360,362 | T→G | 12.9% | V124G (GTG→GGG) | cynX → | putative cyanate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 360,362 | 0 | T | G | 12.9% | 235.3 / 2.1 | 101 | V124G (GTG→GGG) | cynX | putative cyanate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/51); new base G (12/4); total (46/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.19e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGC‑ACGCCACTGGTGATGGGGCTGTGGTCCGCGGCTCTGATGGGCGGCGGTGGGCTTGGTGCCGCCATAA‑CGCCCTGGTTAGTTCAACATAGCGAAACCTGGTATC‑AAACACTCG‑CCTGGTGGGCGCTGCCTGCCGTTGTTGCGCTCTTTGCCT‑GGTGGTGGCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACA‑ACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGG > NC_000913/360127‑360595 | gtTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGC‑ACGCCACTGGTGa < 1:1042373/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |