| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,214,301 | A→G | 2.7% | E8G (GAG→GGG) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,214,301 | 0 | A | G | 2.7% | 552.0 / 2.6 | 173 | E8G (GAG→GGG) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (97/68); new base G (2/3); total (100/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AATCGCAACGAGTTCCTCCCCTTCCTCATGCCGTGAGCGGCGAATACTAATAACCATTTTCTCTCCTTTTAGTCATTCTTATATTCTAACGTAGTCTTTTCCTTGAAACTTTCTCACCTTCAACATGCAGGCTCGACATTGGCAAATTTTCTGGTTATCTTCAGCTATCTGGATGTCTAAACGTATAAGCGTATGTAGTGAGGTAATCAGGTTATGCCGATTCGTGTGCCGGACGAGCTACCCGCCGTCAATTTCTTGCGTGAAGAAAACGTCTTTGTGATGACAACTTCTCGTGCGTCTGGTCAGGAAATTCGTCCACTTAAGGTTCTGATCCTTAACCTGATGCCGAAGAAGATTGAAACTGAAAATCAGTTTCTGCGCCTGCTTTCAAACTCACCTTTGCAGGTCGATATTCAGCTGTTGCGCATCGATTCCCGTGAATCGCGCAACACGCCCGCAGAGCATCTGAAC > NC_000913/4214066‑4214536 | tCCTCATGCCGTGAGCGGCGAATACTAATAACCATTTTCTCTCCTTTTAGTCATTCTTATATTCTAACGTAGTCTTTTCCTTGAAACTTTCTCACCTTCAACATGCAGGCTCGACATTGGCAAATTTTCTGGTTATCTTCAGCTATCTGGATGTCTAAACGTATAAGCGTATGTAGTGAGGTAATCAGGTTATGCCGATTCGTGTGCCGGACGAGCTACCCGCCGTCAATTTCTTGCGt > 1:157461/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |