Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,462,089 | C→T | 6.8% | G191G (GGG→GGA) | nrdD ← | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,462,089 | 0 | C | T | 6.8% | 371.1 / 2.2 | 142 | G191G (GGG→GGA) | nrdD | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/79); new base T (9/2); total (61/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.04e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CATCGTAGCACTCTTTGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGTTGAGTAACG > NC_000913/4461854‑4462327 | aTCGTAGCACTCTTTGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAAACTCGGCGTTccc > 2:423935/1‑237 (MQ=255) tttGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTCGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTAGCCGTAGAGAACGACTTCGGCGGATTCATATCGGGGTTCCCCCTTTTTAAGccgt > 1:615082/1‑237 (MQ=255) ttGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTg < 2:868042/239‑1 (MQ=255) tGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTgg < 1:182797/239‑1 (MQ=255) ttCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGc > 1:760975/1‑239 (MQ=255) ttCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCCGGGTTCACCCCTTTAAAGCCCTGGGGCAGc > 2:1191122/1‑239 (MQ=255) tCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCa < 1:423935/239‑1 (MQ=255) cGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCAt > 2:462847/1‑239 (MQ=255) cTTCGGCGTCCGGTATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGGAGTGCCAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGAt < 2:893279/238‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGAt < 2:1130166/238‑1 (MQ=255) cGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGGTTCCCCTTTTAAAGTCCTTGGGCAGGCTG‑GCTTTCAGGTCGGTCac > 1:885311/1‑237 (MQ=255) ggCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACa < 2:413858/239‑1 (MQ=255) gTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATg < 1:891893/238‑1 (MQ=255) ccGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATACTCTGCGCAGTTACCGCGCTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGAGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGGCAGCATG‑ACCTTCAGGTCGATCAACAGGCAg > 2:700880/1‑239 (MQ=255) gggATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGtt < 2:536462/239‑1 (MQ=255) gttccgctcgtgtgggggtgtGCGATGGTTGTTGTAGCTGGCAGTGAAAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTGAAGGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACa < 1:203806/219‑1 (MQ=255) gTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACa < 2:170044/239‑1 (MQ=255) tCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCCTTTTAAAGCCCTGGGGCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACAAGCAGTTGAACAT‑c > 2:203806/1‑239 (MQ=255) aCTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑Cggg < 2:1077140/239‑1 (MQ=255) ctctTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGga < 1:905116/239‑1 (MQ=255) tcttctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGgaa < 2:70901/239‑1 (MQ=255) aggtgtgtataagaggcaggtttgttGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGga < 2:1099564/219‑1 (MQ=255) ttctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTAACCGCGGTTGCCATAGAGATCGACTTCGGCGGGTATACATCGGCGTTCCCCGTTTTAAAGCCCCTGGTCACGCCG‑GCTTTCAGGTCGTTCaaaagcccattcaaaatccggaaag > 1:485457/1‑216 (MQ=255) tctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGgaagaa < 1:497600/239‑1 (MQ=255) tctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGgaagaa < 2:885311/239‑1 (MQ=255) ctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCATTCAGGTCGATCAACCTGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAAc > 2:667391/1‑239 (MQ=255) ctGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAAACTCGGCGTTCCCCATTTTTAAACCCTGGGGCAGCATG‑CCTTTTAGGGCGGTCAACCTGCCGTTGAACAT‑CGGggaggaa > 1:70901/1‑236 (MQ=255) tGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCTCTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACg < 2:308039/239‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGACCCGGGTCCGCCTG‑CCCTTCAGGTCGACCAACATGCAGTTGAGCAT‑CGGgaaagacg > 1:339111/1‑234 (MQ=255) cGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGt < 2:805891/239‑1 (MQ=255) ggTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGt < 2:162932/238‑1 (MQ=255) gCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTTCAACTCCGCGGTCTCCCTTTTTAAACCCTTGGGCTACATGCCCTTTCGGGTCTTTCACAATGCGTTTGCA‑AT‑CGGGAAGAACggggtggtaa > 1:624820/1‑231 (MQ=255) tgtttgttGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCga < 1:632211/238‑1 (MQ=255) tgtttgttGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCga < 2:734215/238‑1 (MQ=255) gtttgttGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCgaga < 1:1036736/239‑1 (MQ=255) gtttgttGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCgaga < 1:316759/239‑1 (MQ=255) ttgttgTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGAt < 1:692578/238‑1 (MQ=255) ttgtAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACa < 2:316143/196‑1 (MQ=255) tgtAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTg < 1:1166601/238‑1 (MQ=255) ggCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGGTTCCCATTTTAAAGCCCCGGGGCAGCATG‑CCTTTCCGGTCGATCAACCTGCAGTTGAACAT‑CGGGAGGGAAGGGGGGGAACCGAGAACGGGATAGTGaa > 1:1093722/1‑239 (MQ=255) cAAACGGTGCCAGCACTTGAGCGCTACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCGGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAATAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGcc < 2:126945/238‑1 (MQ=255) cAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGcc < 2:436378/238‑1 (MQ=255) aaaCGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCAc > 2:615423/1‑239 (MQ=255) tGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCa < 2:530000/238‑1 (MQ=255) tGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCa < 2:760975/238‑1 (MQ=255) tGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGATCCATCTCGGCGTTTCCCCTTTTTAAGCCCTGGGTCAACATG‑CCTTTCAGGTCTGTCAACATACAATTTAACAG‑CGGGAAGGACGGGTAGTAATCGAGATCGGGATAGGGAATAACGCCCCGCCCac > 1:530000/1‑238 (MQ=255) tGCCAGCACGTCAACGATACGGTTCAAGGGGGGGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGGGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTGGCCGTAGGGACCGACTTCGGAGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCa < 1:3922/238‑1 (MQ=255) ccAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGt < 1:668262/197‑1 (MQ=255) tCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTTGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAAAGGTGAGTAATCGAGGTCGTGATAGTGAAAATCGCCACGCTCATGTGCCTGca > 2:246088/1‑238 (MQ=255) cGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGGTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGACCTGGGTCAGCATG‑CCCTTCAGGGCGGTCAACATGCAGTTGAACAT‑AGGGAAGAACGGGGAGTAATCGAGATCGTGATAGAGAATATCTCCACGCGCACGTGCCTGCACCACGTCAc > 1:825477/1‑238 (MQ=255) ttAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTTAATCTCGGCGCTCCCCATTTTTAAACCCCGGGCCA‑CCTG‑CCCTTCACGTCGACCCACCCCTAGTTGCAAATCCGGGCAG‑ACGGCGGGTCATACGGATCGGGATATCGAAAATCACCACGCTCTTGTGCGCGCCCCACCTTAcgccg > 1:273973/1‑236 (MQ=255) ttAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCa < 2:942345/210‑1 (MQ=255) tAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGgc < 2:811528/239‑1 (MQ=255) tgttggtgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGgcagc < 2:1139146/236‑1 (MQ=255) gtgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCCTTTTTAAACCCCGGGTCACCATG‑CCCTTCAGGTCGGTCAACATGCAGCTGAACAT‑CGGGGAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGGGAATATAGCCACGCTCCATTGCCTTGACCACCCCACGCGGCCGCACGt > 1:749768/1‑238 (MQ=255) gtgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGt > 2:939685/1‑238 (MQ=255) gtgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGGTTCCCCTTTTTAAGCCCCGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGGCGATCAACATGCCGGTGGAAAT‑CGGGAAGAACGGGGGGTAATCGAGATCGTGATAGGGAAAAACGCCACGCCCATGGGCCCGCACCCAGCCAAGCGGCAGCAgga > 1:331165/1‑237 (MQ=255) gtgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCCGCGTTCCCCCTTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCCGGTCGGTCAACATGCAGTTTAACAT‑CGGGGAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATATGGAATATCGCCACCCCCCTTGGCCTGCCCCCCGTCACGCGGCCACAgggg > 1:112662/1‑237 (MQ=255) tgCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGGTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAAAGGTGAGGAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAgggg > 2:569989/1‑236 (MQ=255) gccATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATTTCGGCGTTACCCCTTTTAAAACCCTGGGTCTTCATG‑CCTTTCTAGTCGATCAACATTGAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGCCAGTAATCCAGATCGCGATAGGGAATATCGCCCCGCTCATGCGCCTGCAACCAGTCAAGCGGGAGCCGGTGCTGAc > 2:1013280/1‑239 (MQ=255) gccATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGAc < 1:615423/239‑1 (MQ=255) gccATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGAc < 2:620516/239‑1 (MQ=255) accATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGAc < 1:1082862/238‑1 (MQ=255) ccATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTTAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTTAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCCCATGTGCCTGCACCACGTCCCGCGGCCGCAGGTGCTGACg > 1:1099154/1‑239 (MQ=255) gctggcAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTTCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTTAAAAT‑CGGGAAGAACGGGGGGGAATCGAGATCGTGATAGTGAATATAGCCAAGCTCATGTGCCTGCACCACGATACGCGGGAGCAAGGGCTGACGTGACTAGTGtt > 1:94991/1‑239 (MQ=255) gcAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCCTTTTAAAACCCTGGGGCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGGGTTTAg > 2:773244/1‑238 (MQ=255) gAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATc < 2:339111/239‑1 (MQ=255) cgCAATATTCCTCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGATATCGACCTCGCAGGTTCAATCCCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGATCGATCAACCTGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGTGATAGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCCCCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATc < 1:275637/237‑1 (MQ=255) cAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTTCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGgaagaa < 2:786567/133‑1 (MQ=255) taatCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGCCGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGc > 2:190173/1‑238 (MQ=255) atCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGt < 2:646081/132‑1 (MQ=255) tGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCcagcag > 2:890664/1‑239 (MQ=255) cgcAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATAAACATGCAGGTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATAGTGATAGTGAATATCGCCCCGCGCATGTGGCTGCACCACGCCCCGCGGCCGCAGGTGCTGACGGGGCTAGTGTTTAGCCCCGATCCCGGCCCGCAgg > 1:1052463/1‑238 (MQ=255) gcAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGt < 2:333987/238‑1 (MQ=255) ttACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTcgcg < 1:128285/238‑1 (MQ=255) tACCGCGGTTGCCGTATAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCGCCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTcgcg < 2:154049/237‑1 (MQ=255) tACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTcgcg < 1:712700/237‑1 (MQ=255) tACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTcgcg < 2:829280/237‑1 (MQ=255) tACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCt < 2:1093722/239‑1 (MQ=255) gTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCCTTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTTAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCCCGCCCATGTGCCTGCACCCCGTCCCGCGGCAGCAGGAGCTGACGTGGATAGTGTTTAGCCACGATACCCGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTgg > 1:1174708/1‑239 (MQ=255) gTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCt > 2:1037012/1‑187 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCCATCCCGGCCTTCCCCCTTTTTAAGCCCCGGGTCAGCATC‑CCCTTTCGGTGCATCAACCACCCGCTTGACAT‑TCGGCACAAAGGTGGGGAAACGGGCTCCGGGTCGTGAATATCGCCACGCTCAAGCGCCTGCACCACGTCTCCCGGCAGCCGGTGCTGCCGGTCGCAGTGGTTTGCCCCCACCCCGGCCAGCAGGTCGCGCCGGGTTGGaa > 1:1136547/1‑239 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATa < 1:366761/132‑1 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATa > 2:366761/1‑132 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGgcagc < 1:252230/178‑1 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGgcagc > 2:252230/1‑178 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGaa < 2:103537/239‑1 (MQ=255) ccGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCCCGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTcgcg < 2:850278/226‑1 (MQ=255) gTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCCTTTTAAAGCCCTTGGTCAGCCTG‑CCTTTCAGGTCGGTTAACATTCAGTTTAACAT‑CGGGAAGAACCGGGAGTAATCGCGATCGGGGTAGTTAATATCGCCCCGCTCATGTGCCTTCACCACGTCACCCGGCAGCAGGCGCTGACGGGCCTAGTGTTTTGCCCCTGTCCCGGCCCACAGTCCgcgcctggctgggatta > 1:393852/1‑225 (MQ=255) gagcGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCGCAGTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAATAACGGGGAGTAATCGAGATCGTTATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTTGAATCACCTTg < 1:535913/235‑1 (MQ=255) gaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGATCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCCCCACGTCACGCGGCAGGAGGGGCTGACGTGAATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGATCGCGCTGGGTTGGAATCACCtt < 1:181966/237‑1 (MQ=255) tCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCt < 2:94991/238‑1 (MQ=255) cGACTGCAGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTGTAAAGCCCTGGGTCAGCGTG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAG‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATAGCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGt < 1:103629/239‑1 (MQ=255) gcggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTttgttg > 2:481026/1‑239 (MQ=255) tggtCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTAAGCATG‑CCTTTGAGGTTGATCAACATGCAGTTGAGCAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCTCGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGTTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCGGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTgg < 1:1191122/235‑1 (MQ=255) tcGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGtt < 2:149618/239‑1 (MQ=255) gCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGTTGAg > 2:92169/1‑239 (MQ=255) gCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGCGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGGCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGTTGAg > 1:432504/1‑239 (MQ=255) gCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGCGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATGGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGTGTTTTCGTTGAg > 1:1015408/1‑239 (MQ=255) ccccATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGTTGAGTAACg < 1:422355/239‑1 (MQ=255) | CATCGTAGCACTCTTTGATGGTTCGAGAGTTAGCGTAGCCTTCGGCGTCCGGGATGTTCCACTCTTCTGCGGTCTTGCGATGTTTGTTGTAGCTGGCAGTGACAAACGGTGCCAGCACTTCATCGATACGGTTAATGGTGGTGCCGCCATAAATATGGCTGGCAACCTGAGCAATAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATG‑CCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACAT‑CGGGAAGAACGGTGAGTAATCGAGATCGTGATAGTGAATATCGCCACGCTCATGTGCCTGCACCACGTCACGCGGCAGCAGGTGCTGACGTGCATAGTGTTTAGCCACGATCCCGGCCAGCAGGTCGCGCTGGGTTGGAATCACCTTGCTGTCTTTGTTGGCGTTTTCGTTGAGTAACG > NC_000913/4461854‑4462327 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |