| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3845530 = | 139 (0.860) | 109 (0.700) | 72/486 | NT | 45.0% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| ? | NC_000913 | = 3992759 | 133 (0.850) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
ACAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGAT‑‑GAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGGCGGATT > NC_000913/3845242‑3845817 | aCAGCGGAAATGTGTGTGAGCGCGATGATGTGAGCTTGATTGCCGGAGTTGGGCGGTGCGGGATGCAGCTGGGTCCGGCTTGGGGTTTGGTTGGCGGGTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGGGACGGTCAGCAATGACGGCGATAATAGGGAGGTGAGCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGAGCTTGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGATGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGGCAGCTGCCGTTACACATTGCCGGGCTGAT‑‑TAg < 1:577148/289‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTGATAGGGAGGATGTGGGCTTTAGTGCCGTACTTGAGCGGTGCGGGCAACTGCTGGCTCCGGCGTGGGGTTTGCTTGGCGTCGTTGGAATGAATGAAGGTGCGCGGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCAGAATATGGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCGGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGTCTGTGCGTGGTTCGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGAT‑‑GAGCACCGaca < 1:1155243/289‑1 (MQ=255) tttGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGAT‑‑GAGCACCGACACGgcg < 2:1051883/288‑1 (MQ=255) cgATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGCAGAGATGGCGCGGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCTGCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGAT‑‑GAGCACCGACACGGCCGAGTcccgg > 2:231516/1‑285 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |