New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4430455 | 197 (1.210) | 4 (0.030) | 4/490 | NT | 2.0% | coding (591/1413 nt) | cycA | D‑alanine/D‑serine/glycine transporter |
? | NC_000913 | = 4430466 | 195 (1.240) | coding (602/1413 nt) | cycA | D‑alanine/D‑serine/glycine transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCGAAAGGTTTAAGTGGCTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCGTGGGGATTGAGCTGGTAGGTACAACAGCTGCGGAAACCAAAGATCCAGAGAAATCACTGCCA‑‑CGCGCGATTAACTCCATTCCGATCCGTATCATTATGTTCTACGTCTTCGCGCTGATTGTGATTATGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCGTGTTGGTAGGGC > NC_000913/4430170‑4430738 | cACCGGTTGTACTTACGGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGGCGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTATCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGTTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTcgcg < 1:497204/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |