New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 582145 = | 187 (1.190) | intergenic (+48/+7) | tfaD/ybcY | pseudogene, DLP12 prophage, tail fiber assembly protein family,Phage or Prophage Related/pseudogene, DLP12 prophage, methyltransferase homology,Phage or Prophage Related | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GAAAGATGCAGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATTCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAACAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCACTTCAGGATGCTGTAGATCTGGAAATCGCAACGGAGGAAGAAACCTCATTGCTGGAAGCCTGGAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGT‑CTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTA‑TTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGCATCAGTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGC > NC_000913/581857‑582428 | aaaGATGCAGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATTCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAACAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCACTTCAGGATGCTGTAGATCTGGAAATCGCAACGGAGGAAGATACCTCATTGCTGGAAGCCTGGAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGT‑CTTAAGCAAGAACATGCTGCGGtt > 1:1479592/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |