Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 759,810 | 0 | A | T | 2.8% | 487.5 / 2.5 | 142 | T369S (ACC→TCC) | sucA | 2‑oxoglutarate decarboxylase, thiamine triphosphate‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/81); new base T (2/2); total (57/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.59e-01 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AAAAAACCGCAAGACTTGTTCGACGAGTTCGCCGGTAAACATAAAGAACACCTCGGCACGGGTGACGTGAAATACCACATGGGCTTCTCGTCTGACTTCCAGACCGATGGCGGCCTGGTGCACCTGGCGCTGGCGTTTAACCCGTCTCACCTTGAGATTGTAAGCCCGGTAGTTATCGGTTCTGTTCGTGCCCGTCTGGACAGACTTGATGAGCCGAGCAGCAACAAAGTGCTGCCAATCACCATCCACGGTGACGCCGCAGTGACCGGGCAGGGCGTGGTTCAGGAAACCCTGAACATGTCGAAAGCGCGTGGTTATGAAGTTGGCGGTACGGTACGTATCGTTATCAACAACCAGGTTGGTTTCACCACCTCTAATCCGCTGGATGCCCGTTCTACGCCGTACTGTACTGATATCGGTAAGATGGTTCAGGCCCCGATTTTCCACGTTAACGCGGACGATCCGGAAGCCGTTGCCTTTGTGACCCGTCTGGCGCTCGATTTCCGTAACACCTTTAAACGTGATGTCTTCATCGACCTGGTGTGCTACCGCCGTCACGGCCACAACGAAGCCGAC > NC_000913/759522‑760097 | cGCAAGACTTGTTCGACGAGTTCGCCGGTAAACATAAAGAACACCTCGGCACGGGTGACGTGAAATACCACATGGGCTTCTCGTCTGACTTCCAGACCGATGGCGGCCTGGTGCACCTGGCGCTGGCGTTTAACCCGTCTCACCTTGAGATTGTAAGCCCGGTAGTTATCGGTTCTGTTCGTGCCCGTCTGGACCGCCTTGATGAGCCGAGCAGCAACAAAGTGCTGCCAATCACCATCCACGGTGCCGCCGCAGTGAACGGGCAGGGCGTGGTTCAGGAAACCCTGa > 1:1492908/1‑288 (MQ=255) 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GAAACCCTGAACATGTCTAAAGAGCGTGGTTATGAAGTTGGCGGTACGGTACGTATCGTTATCAACAACCATGTTGGTTTCACCACCCCTAAGCCGCTTGATGCCCGTTCTACGCCGTACTGTACTGATATCGGTAAAATGGTTCAGGCTCCGATTTTCCACGTTAACGCGGa > 1:747885‑M1/1‑173 (MQ=255) | AAAAAACCGCAAGACTTGTTCGACGAGTTCGCCGGTAAACATAAAGAACACCTCGGCACGGGTGACGTGAAATACCACATGGGCTTCTCGTCTGACTTCCAGACCGATGGCGGCCTGGTGCACCTGGCGCTGGCGTTTAACCCGTCTCACCTTGAGATTGTAAGCCCGGTAGTTATCGGTTCTGTTCGTGCCCGTCTGGACAGACTTGATGAGCCGAGCAGCAACAAAGTGCTGCCAATCACCATCCACGGTGACGCCGCAGTGACCGGGCAGGGCGTGGTTCAGGAAACCCTGAACATGTCGAAAGCGCGTGGTTATGAAGTTGGCGGTACGGTACGTATCGTTATCAACAACCAGGTTGGTTTCACCACCTCTAATCCGCTGGATGCCCGTTCTACGCCGTACTGTACTGATATCGGTAAGATGGTTCAGGCCCCGATTTTCCACGTTAACGCGGACGATCCGGAAGCCGTTGCCTTTGTGACCCGTCTGGCGCTCGATTTCCGTAACACCTTTAAACGTGATGTCTTCATCGACCTGGTGTGCTACCGCCGTCACGGCCACAACGAAGCCGAC > NC_000913/759522‑760097 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |