Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 177,958 | 0 | T | A | 2.7% | 541.5 / 3.7 | 148 | T169S (ACC→TCC) | btuF | vitamin B12 ABC transporter periplasmic binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (72/72); new base A (2/2); total (74/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.35e-01 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
AAGCGCATTACAGAGCTGTTGTGCAGCGAGGATAATACGTGGGCTTGCACGTTCAAACCAGTCACTCGTGAGAGGAATAACGGGAATTTTGAGCTGTTCACCCCAGTATTGTTTGATTTTAGGAATTTGGTCCGGTCCGCCTGTAATGACAATCGCCTGTGGCGAGCGTGCTAACACCTGTTCGCGGCTAACTTGCGGCCAGGGAACCCGGCTGTCTTTAAAGATGTTTTCTCCGCCACAAACTTCGAGTACCTGGTTCTGAATCGACTCTTTTCCACTGGTAAATGGCGGATTAATGCCGAATTGCAGAAAAACACGTTTTTTAGGTTTATCAGCATATTGCGCTTTCAATTGCGCGTACTGATCCAGCAGGGATTGCGCGGCTTGTTCGGCCTTGTCTGGTTGCGGACTCCAGGGGGCCAGTTGACGTAACGCATTGGCAATTTGTTCAATGCTTGTCGCATCGACCCACATCACTTTTATTCCCAGCGAAGCCAGCTGGTCAACCTGCCGCTCGGCATTACCTCCACGCCAGGCAATCACCAGATCGGGTTTCAGCGCGACAATGC > NC_000913/177677‑178245 | cTGTTGTGCAGCGAGGATAATACGTGGGCTTGCACGTTCAAACCAGTCACTCGTGAGAGGAATAACGGGAATTTTGAGCTGTTCACCCCAGTATTGTTTGATTTTAGGAATTTGGTCCGGTCCGCCTGTAATGACAATCGCCTGTGGCGAGCGTGCTAACACCTGTTCGCGGCTAACTTGCGGCCAGGGAACCCGGCTGTCTTTAAAGATGTTTTCTCCGCCACAAACTTCGAGTACCTGGTTCTGAATCGACTCTTTTCCACTGGTAAATGGCGGATTAATGCCGAAt > 1:1039522/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |