New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1917402 = | 75 (1.390) | 3 (0.060) | 3/474 | NT | 4.0% | coding (1145/1284 nt) | yebS | inner membrane PqiA domain protein |
? | NC_000913 | 1917764 = | 71 (1.340) | coding (255/2634 nt) | yebT | MCE domain protein |
GAGGACGGCAGGAAGATACAATTCTTTCCGGAATTATGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGCAGGAATCGTGTTTATCGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCG > NC_000913/1917132‑1917674 | ctgttcagcgaaccgagatcgggggcttgcaggtggatcatcagatcgccattgtccagccgatatttcggttgggtatcgagtgcgacaaagtgatcctgctctttacctttacccggcatcatgccgatatagttcccaccgacgagggcgtccagcccggagacacctgccaacgatgcttttggcgtcaccacccagaactgagtctcttcgcgcagcgcatctttcctatctgacttgatgctgaccttgacttcaaccttacgaaagtc < 2:298389‑M1/5‑5 (MQ=255) ggaCGGCAGGAAGATACAATTCTTTCCGGAATTATGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGCAGGAATCGTGTTTATCGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCt < 1:229386/275‑1 (MQ=255) ggCATGATGATACAATTCTTTCCATAATTATTTCGCTGGCATGTAGCGAAATTGCGTTTGCCGGATTCGTGTTTTTCGCCCGTATTCTGGTTCCTTTTACTCAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTGACGCACACGCATTTTGGTACTGCGGTTTGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCt < 1:500079/275‑1 (MQ=255) cgaaccgagatcgggggcttgcaggtggatcaacagatcgccattgtccagccgatatttaggttgggtatcgagtgcgacaaagtgagcctgctctttacctttacccggcatcatgccgatatagttcccaccgacgagggcgtccagcccggaaccacctgccaacgatgcttttggcgtcaccagcgagaactgagtctcttcgagcagcgcatctttcatatcggacttgatgctgaccttgacttcaatctcacgaAAATCCTCGctg < 1:702‑M1/12‑2 (MQ=255) cAGGGAGATAGAATTCTTTCCGGAATGAGGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGAATGAATCGTGTTTATTGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGCTCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCttt < 1:266465/275‑1 (MQ=255) cAGGAAGATACAATTCTTTCCGGAATTATGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGCAGGAATCGTGTTTATCGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCttt < 2:299792/275‑1 (MQ=255) gAAGATACAATTCTTTCCGGAATTATGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGCAGGAATCGTGTTTATCGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGGCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTa > 2:279836/1‑274 (MQ=255) 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gTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCCGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGACTGGCTGGCGAGGCGCTTAACTTGGCATg > 2:292251/1‑275 (MQ=255) tttACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATGCTCGCTTTTACTATGGGACCGGATGAGTTTTATTTGTGCGCAGCGGTAATTCTGAATAATCTTGCTGTGTAATAGCGTGAGAGCCGCTCTATTTGGGacag > 2:425939/1‑272 (MQ=255) tttACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGc > 1:199794/1‑275 (MQ=255) 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cattcattTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAgcg > 1:471360/1‑275 (MQ=255) catgcagtTTAAGTGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGTTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAgcg < 1:363210/275‑1 (MQ=255) ggTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTa < 2:199793/275‑1 (MQ=255) 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actgtgttgggggcttggctgATTCTCGCCCTGTTTGTCATATCTTTAACCGTGTCGGTGCTTAGTCGTGTTCAGATTCTAGCTTTTACTATGGGCCCGGCTGCGTTTTTTTTCGGCGGCGCGGTAATTTTGACTATTCTTGGTGTGGAATGGCTGTACAGCCGCTTACATTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTTGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTCTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTaa < 2:365909/255‑1 (MQ=255) tGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGCAGCGCAGATTAAAAATACACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGGTCATCGCGCTCATGa > 2:85826/1‑275 (MQ=255) aTTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTCAAGCGCAGATTAAAAACAAACGCCGTACCGCACCTTCTTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTg > 2:492532/1‑275 (MQ=255) gTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTCTTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCat > 1:528789/1‑274 (MQ=255) gTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGTAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATACACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCCTCGCGCTAATGCTTGcccg > 2:342213/1‑273 (MQ=255) gTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGGGCAGATTAAAACTAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTACTTATTGCCat > 2:164623/1‑274 (MQ=255) ggTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGc < 2:69500/274‑1 (MQ=255) gaccgttttGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCGTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACa < 1:122244/269‑1 (MQ=255) gTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTAt > 1:190977/1‑275 (MQ=255) 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atatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGAc < 1:435178/274‑1 (MQ=255) atatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGAc < 2:427906/274‑1 (MQ=255) atatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGAc < 2:159181/274‑1 (MQ=255) atatCTTTAACAATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTAATATGGGACCGGCTGCGTTTTCTTTCGCCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCCTACTTTGGGATGCCCATTAGTCAGGAAACGACCGCTTCGACGACTGCCGCGCAGATCCAAAATACACGCCGTAACTCCCCTTTCTGGCTGCTTCCGCTCATCGCTCTAGTGCTTGCCAGTTCGCGGATCTCGGACAGTTATCCGGAc > 2:398347/1‑274 (MQ=255) tatCTTTAACCATGTCGCTGATTTATCGCGATCAGATCCTCGCGTGTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAGTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCg < 1:377834/275‑1 (MQ=255) cTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAACTAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGTGCAGTTATCAGGACCgggg > 1:529710/1‑275 (MQ=255) cTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAACTAAACGCCGGATCCCACCCTTCTGGCTGCTGCCGTTCAACGCGCTAATGATTGCCAGGTGGCTGTTGTTGGACAGTTAttcggcacgggg > 2:65203/1‑264 (MQ=255) tttAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGt < 2:107817/275‑1 (MQ=255) aaCCCTGTCGGTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGGTTTTGCTATGGGACCGGGTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGGCTATTCTTGCTGTGGGATGGCTGGACGGCCGCTTACTTTGGGATGCAAATGAGTCAGGCAACGCCCGCTTCGACGGCTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGTACAGTTATCAGGAc < 1:65203/266‑1 (MQ=255) 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GAGGACGGCAGGAAGATACAATTCTTTCCGGAATTATGTCGCTGGCAAGTAGCAACATTGCGGTTGCAGGAATCGTGTTTATCGCCAGTATTCTGGTACCGTTTACTAAAGTGATCGTCATGTTCACTTTACTGTTGAGCATTCATTTTAAATGCCAGCAAGGTTTACGCACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCG > NC_000913/1917132‑1917674 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |