| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1688218 | 60 (1.150) | coding (160/1647 nt) | fumA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I | |||||
CGCAGATTATCTTCGATATAAGTGTTATAGACACCGCGCGCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTAC > NC_000913/1687944‑1688491 | cgcAGATTATCTTCGATATAAGTGTTATAGACACCGCGCGCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGc > 1:295228/1‑275 (MQ=255) atatAAGTGTTATAGACACCGCGCGCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCCTGAAACGCCTGGCTCGCCAACag > 2:443568/1‑275 (MQ=255) cgcgcgCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGACCGCCGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCCACAGGGTTAACGCTTCGGGTGc > 2:116592/1‑274 (MQ=255) cgcgcgCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCct < 2:304156‑M2/243‑3 (MQ=255) cgcCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCctggcg > 1:304157‑M2/1‑237 (MQ=255) catcaCCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGc < 1:306520/275‑1 (MQ=255) ccGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCaa > 2:286256/1‑254 (MQ=255) 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caacaaTAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGc < 2:130760/275‑1 (MQ=255) caacaaTAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGc < 1:182526/275‑1 (MQ=255) aacaaTAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCctggcgcgcggtgtctataacacttatatcgaagataatctgcgctactcgcaaaacgcgccgctggatatgtataaagaagtgaataccgg < 1:138307‑M2/275‑93 (MQ=255) 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ggCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCa > 2:521199/1‑146 (MQ=255) ccACCGGGTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTaaaa < 2:498397/275‑1 (MQ=255) aCCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTACCGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTacaa > 1:253414/1‑273 (MQ=255) aCCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTa < 1:521200/146‑1 (MQ=255) aCCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACAt > 2:466756/1‑209 (MQ=255) gttgttGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGtt < 1:466757/209‑1 (MQ=255) ttgttgGTGCGCCTGACGCAGCATGAACGACGACTCATGAAACGCCTGGGGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAg < 2:416918/273‑1 (MQ=255) ttgttgGTGCGCCGGACGGAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGCTAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTC‑CTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAg < 1:402150/272‑1 (MQ=255) tggtggGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACa < 1:361505/274‑1 (MQ=255) gACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTacac < 2:278958/275‑1 (MQ=255) gAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGACTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCATGTTAAAAGCGTGTAACAATATCCTACACACTTTTTTaa > 1:107562/1‑275 (MQ=255) aaCGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGATTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTATGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAAc > 1:429100/1‑275 (MQ=255) acgacgCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACa > 1:458808/1‑275 (MQ=255) gCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCCGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAACGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTCCACACTTTTTTAACAAATACCGAGACTAGTa > 1:376892/1‑274 (MQ=255) ccTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTAc > 2:459515/1‑274 (MQ=255) | CGCAGATTATCTTCGATATAAGTGTTATAGACACCGCGCGCCAGCGCCGCTTCATCACCACCACCGGTCCATACACGCTGCCCTTTTTTACCAACAATAATCGCGGTGCCGGTATCCTGACAGGTTGGCAGAACGCCTTTCGCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTAC > NC_000913/1687944‑1688491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |