New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2034871 | 70 (1.020) | 3 (0.050) | 3/268 | 10.2 | 4.3% | pseudogene (159/531 nt) | yedS | pseudogene, outer membrane protein homology, putative outer membrane protein |
? | NC_000913 | = 2034893 | 67 (1.030) | pseudogene (181/531 nt) | yedS | pseudogene, outer membrane protein homology, putative outer membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTA > NC_000913/2034733‑2035013 | tCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAata > 2:894531/1‑143 (MQ=255) tCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGATGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAata > 2:606939/1‑143 (MQ=255) gTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTCGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCCATCTg > 2:250174/1‑143 (MQ=255) aGGTTGGAGGTGGGTTGAATGGTCGTAGCCGTAGCCACCGAAATGCTTGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGAcc < 1:449619/143‑1 (MQ=255) ttGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGGGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggt > 2:589780/1‑143 (MQ=255) tttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATgtggtggtg > 1:670806/1‑143 (MQ=255) ttAAATGGTCGTAACCAGAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGAGGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggtggtgg < 1:110184/143‑1 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCGCATAgggtggtgg > 2:1051213/1‑143 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGAGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggtggtgg > 1:1183509/1‑143 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGATGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGATATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCAAATAtgttgctgg > 1:326136/1‑143 (MQ=255) tAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCACAATATGACCCCATATGGTGGTCGc > 2:80296/1‑143 (MQ=255) caacgagcGTAACCAGAGTTGCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCg < 1:637047/136‑1 (MQ=255) aaTGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGa > 2:839863/1‑143 (MQ=255) tGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGt > 2:1038587/1‑143 (MQ=255) gATCGTAACCAGAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGtt < 1:81955/143‑1 (MQ=255) atcgtcgacagaGCAACAGAAATGCGGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCCATAAGAGCTGATATGGTGGTGGCGAGttt < 1:429406/132‑1 (MQ=255) cGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGCCTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCCATATGACGCCACATGGGGGTGGCGAGTATGa > 1:353036/1‑143 (MQ=255) cGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGa < 1:363407/143‑1 (MQ=255) gTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGCCTGTTGGTGCAAAATATGGTGGAAAAAATGTGGACTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGAt > 2:1198377/1‑143 (MQ=255) gTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGAt < 2:842562/143‑1 (MQ=255) aCCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAAt > 1:224162/1‑143 (MQ=255) cATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATgg > 2:975064/1‑143 (MQ=255) aggaaCAGAAAGGCGGGTGGTGGAACCGCTGGAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGGATTTAGCAGCTATGTACGCTGTAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGa < 1:365905/140‑1 (MQ=255) gtgaCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGaa < 1:1201685/140‑1 (MQ=255) aaCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTAAGCTGAAACTCGCAATATGACACCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATc > 1:415288/1‑143 (MQ=255) aCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCa < 2:126193/143‑1 (MQ=255) ctGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTTATAATTTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 2:520021/142‑1 (MQ=255) aggCTCGTTGTGGAACCGCTTAACGGTGGACTGTGGGTGCACAATATGTGGCTCATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATACTGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 1:378771/141‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTGTAACCGCTGAAGCATTGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 1:979077/143‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATCTGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 2:720693/143‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGGGAAACCGCTGGAGCATGGACTGTTGGTGCAATATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTTTGTTCGCTGAAACGCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCTTGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 1:449924/143‑1 (MQ=255) tggtggGGAACCCGCTGTAGCATGGATTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCa < 1:37019/143‑1 (MQ=255) gaggtgCAACCGCTGACGCAGCGACTCTTGGCGCAAAATAGCATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATCACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATc < 2:14199/141‑1 (MQ=255) ggtgAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCGATCGc > 2:437351/1‑143 (MQ=255) aaaCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAGTAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCACGAT‑‑CCGCCATCGCTAAc > 1:983212/1‑143 (MQ=255) aCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACaa > 2:711702/1‑143 (MQ=255) aCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCGAACaa > 1:647151/1‑143 (MQ=255) cGCCGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTCCGCTGAAGCTCGTAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACaaaa < 2:732296/143‑1 (MQ=255) gCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAAc < 1:815390/143‑1 (MQ=255) ttgACTGTTCGTGCAAAATACGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCGATGTACGCTGAAACTCGCAACATGACCCCATATGGTGGTGGCGCGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACtt < 1:1085573/141‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGCAAAATACGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCGGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGaa < 1:515120/143‑1 (MQ=255) tGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGCGTTTGTCCCGGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAg > 2:45657/1‑143 (MQ=255) tGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGttgttg < 1:589780/143‑1 (MQ=255) tGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGttgttg < 2:1174596/143‑1 (MQ=255) cAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCt < 2:751998/143‑1 (MQ=255) aaaTATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGCCCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCa < 2:1174985/143‑1 (MQ=255) atatGATGCTAATAATGTGTTTTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGt < 2:519187/143‑1 (MQ=255) atatGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAAGTTTGAAGATGTTGCTCAGt > 1:280040/1‑143 (MQ=255) tgatgGTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCGGAAGCTCGCAATATGACCGGATGTGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCCTCGCTGACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATc < 1:203914/143‑1 (MQ=255) taataaTGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCTCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACTCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCg > 2:52591/1‑143 (MQ=255) aataatGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGa > 2:962828/1‑143 (MQ=255) ataatGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAACCTAGGAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCCGTTCGAc > 2:824718/1‑143 (MQ=255) taatGTGTCTTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCTCATATGGTGGTGGCCACTTCGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTCACAAAACCAGAAACTGTGAAGTCGTTGCTCAGTGTCAGGTCgccc > 1:1111911/1‑140 (MQ=255) atGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCACATATTTTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACttt < 2:224162/143‑1 (MQ=255) gtgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCGCTCGCTAACAAACCCCAAAACTTTGAAGGTGTTGATCAGTATCAGTTCGACTATgg > 1:472987/1‑143 (MQ=255) gtgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTgg > 1:611485/1‑143 (MQ=255) tgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACATTGGc > 2:289394/1‑143 (MQ=255) gtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGcc > 1:313087/1‑143 (MQ=255) tATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGATACCATCCATC‑C‑AGCGAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCt > 2:553559/1‑143 (MQ=255) tttAGTAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgc < 1:702993/143‑1 (MQ=255) ttAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgcg < 2:463112/143‑1 (MQ=255) tAGAAGTTATGTACGCTGGAACGCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgcgc < 1:707812/143‑1 (MQ=255) gcagcTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCCGCGccc < 1:1072241/143‑1 (MQ=255) agcTATGTACGCTGACACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGt < 2:652539/143‑1 (MQ=255) tACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCTCGTCCAtagg > 1:501146/1‑140 (MQ=255) gCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGCCTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTa > 1:1146732/1‑143 (MQ=255) tGAAACTCGCAATCTGACCCCATATGGTGGTGGCGAGCTCGATAATCGTGAATCAAAAT‑‑CCGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACCTTGAAGTTGTTGCCCAGTCCCAGAGCGCCCCCGGACTCCGCCCGCCCCTCGCTCAcc > 1:376920/1‑143 (MQ=255) tGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGATTGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTAcc < 2:999545/143‑1 (MQ=255) gAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGCGAATCAACAT‑‑CTGCCATTGATCACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTAAGTCTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCt < 1:975064/143‑1 (MQ=255) aCTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCa < 2:1120921/143‑1 (MQ=255) cAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTa > 2:181340/1‑143 (MQ=255) | TCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTA > NC_000913/2034733‑2035013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |