| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2262020 = | 5 (0.070) | 69 (1.020) | 54/278 | 0.1 | 93.4% | coding (344/939 nt) | fruK | fructose‑1‑phosphate kinase |
| ? | NC_000913 | = 2515611 | NA (NA) | intergenic (+170/+30) | insL1/yfeA | IS186 transposase/putative diguanylate cyclase | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AGGACACTGACTACGCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAAC > NC_000913/2261878‑2262158 | atctggagcttgcaggtggccagtcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaggaacgcgaggcatcgtcttaacaaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg > 1:335657‑M1/143‑143 (MQ=255)atctggagcttacatgtagccatgcgcgggagagtatcccggacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg > 1:453592‑M1/143‑143 (MQ=255)atctggagcttacagtggcccattcgtggcacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg > 2:1018142‑M1/143‑143 (MQ=255)atctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgccattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaaccctgacgttcgcgcttatg < 1:96337‑M1/1‑1 (MQ=255) tctggagcttacaggtggccattcgtgtgacgtgatccctcacagtctacaaaccgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaatgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg‑g > 1:624147‑M1/142‑143 (MQ=255) tctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg‑g > 2:731311‑M1/142‑143 (MQ=255) gagcctgtccgcGCAGGCGAGTCACCCCGTCGGGCATCGCTTGCGGTCTGGCGCCTGACGGTAAGCTTCCCCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGGCGGCgg‑gg < 1:643711/132‑1 (MQ=255) ctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaacacgcaattgacgaacgtgaggcatcggcttaacgcggcaacgagccgacgcaatcttcagatggtgcaacccttcagtaagcgattatgag < 1:151057‑M1/3‑3 (MQ=255) ctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg‑gg < 1:478961‑M1/3‑1 (MQ=255) gagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg‑ggcta < 1:1127189‑M1/6‑4 (MQ=255) gagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTg < 1:404643‑M1/6‑1 (MQ=255) cTGATTAGGGAGGCGAGTCTTTTAGTCGGTTATCGCTTTCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACTGAGTCAGCTCAGAGAATCAGTCACTAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGa < 1:294496/143‑1 (MQ=255) tGACTACGCAGGCGAGTCGTCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGCCGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGAc < 1:476536/143‑1 (MQ=255) gcttacaggtggccattcgtgggaaagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGAc > 1:548270‑M1/136‑143 (MQ=255) gCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcata > 1:333510‑M1/1‑139 (MQ=255) gtggccatgcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAAc > 1:308568‑M1/128‑143 (MQ=255) ggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGGGACTTCAAAAccc < 2:674275‑M1/18‑1 (MQ=255) cGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGAACAAGACTTTTTAGAGAGGTGGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcagaagcgc > 2:875262‑M1/1‑134 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaataatgcgttacatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttccacccttacgttagcgcttctT‑GGGTGTCTTCAAAACACGAGAAGtt < 2:229548‑M1/26‑1 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtagcattctccggatggttcaacccttaagttggcgcccgtGCGGGTG‑CTTCAAAACCCGAGAAGtt < 1:190843‑M1/26‑1 (MQ=255) gtgcgacactatccctgccagcgtacaaaacgcaattgcagaacgcgatgcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGtt > 1:1012699‑M1/118‑143 (MQ=255) tgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcacaaaaG‑GAGAGACATCAAAACCCGAGAAGTTg < 2:339284‑M1/27‑1 (MQ=255) tCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGACTCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑AGGTGACTTCcataagcgctaactta > 2:137355‑M1/1‑127 (MQ=255) ccAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCGGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaa < 2:678298‑M1/143‑18 (MQ=255) cAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACCGACCATATCGGACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaag > 2:938929‑M1/1‑125 (MQ=255) cAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaag < 2:1136782‑M1/143‑19 (MQ=255) aggcggtGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagg < 2:290330‑M1/140‑20 (MQ=255) gTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAACTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACCAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACCTCcataagcgctaacttaaggg > 2:778092‑M1/1‑123 (MQ=255) tCGGTGCACGCTTCCGGGCCGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGCGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcttacgcgctaacttaagggt < 1:600477‑M1/143‑22 (MQ=255) 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ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatT‑GAGTGACTTCAAAACCCGAGAAATTGAAATCGTTCACTTCGCcgtat < 2:1115618‑M1/48‑3 (MQ=255) aCGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctgtg > 2:437282‑M1/1‑101 (MQ=255) aacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTcggtcacttcgcggccatttccc < 1:1059461‑M1/54‑12 (MQ=255) cgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGt > 1:972848‑M1/88‑143 (MQ=255) cgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGt > 2:478961‑M1/88‑143 (MQ=255) cgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGt > 2:226429‑M1/88‑143 (MQ=255) ccTGCCCGTAAGCTTCCGCTGACACCGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCCGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatt < 1:1095468‑M1/143‑46 (MQ=255) ctgttgaagggcgcgaggcatcgccgtaacgaggcacgggggcgtcgcatccttcagatgggtcaacccttcagttagcgcttagG‑GTGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCa > 1:156688‑M1/86‑143 (MQ=255) acgctcagcttccGCTGCCACACACCACATCGAGCTGCCCGAGCCTGCTCAGAGTATCAGTCACAAAGCGTGCCCAGTCGGCGG‑GGGTTACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:1073575‑M1/137‑50 (MQ=255) tAAGCTTCCGCTGAGACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc < 2:115872‑M1/143‑54 (MQ=255) 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agatggtatcgtactGTCTGGGCCAGTTCATTGAATCAGTGATTAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcac < 1:1017491‑M1/137‑71 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttgagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCt > 2:556793‑M1/59‑143 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCt < 2:1025371‑M1/85‑1 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCt > 2:662669‑M1/59‑143 (MQ=255) atatCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataa < 2:366181‑M1/143‑76 (MQ=255) 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gagaATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcccgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt < 2:981558‑M1/143‑101 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGCCGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTCGGCCCCTGTACGACCGGGAAccggttggcgccgccct < 2:729470‑M1/115‑9 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTTTTTTTTCGTGAGCTTAACGTTAAGTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAg > 2:73306‑M1/28‑143 (MQ=255) gttcaaccctgaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCGTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCt > 1:117613‑M1/26‑143 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCt > 2:1153701‑M1/22‑143 (MQ=255) caAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaa < 2:1178274‑M1/143‑113 (MQ=255) aaaGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaag > 2:709723‑M1/1‑30 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGaa > 2:418284‑M1/19‑143 (MQ=255) ttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTGTCGGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCCGCTCGctgagca < 2:328909‑M1/127‑4 (MQ=255) tCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTGCcataagcggtaactgaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattacgctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgga < 2:803760‑M1/143‑121 (MQ=255) aGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatctgatttaacgtgccgatgacttactctcacgataactggtcagcaattatggcacaaattggtaagccagagcaacgggataca > 2:158896‑M1/1‑19 (MQ=255) cgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGCACAGTTGCTGaa < 2:534611‑M1/136‑1 (MQ=255) tCGGCGG‑GGGTGACTGCcataagcgctaacttaagggtttaggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttc < 1:291988‑M1/143‑127 (MQ=255) cggcgg‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg < 2:1027694‑M1/143‑128 (MQ=255) cggcgg‑GGGTGACGTCcataagcgctaacctaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattacgcgcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg < 1:695922‑M1/143‑128 (MQ=255) ttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTGAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAAGGCCCAGCTAGCTGAACAGTTGCTGAAAAc < 1:1007497‑M1/139‑1 (MQ=255) | AGGACACTGACTACGCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAAC > NC_000913/2261878‑2262158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |