| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2262030 | 11 (0.160) | 46 (0.670) | 41/282 | 0.7 | 80.8% | coding (334/939 nt) | fruK | fructose‑1‑phosphate kinase |
| ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | intergenic (+32/‑55) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CGCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCT > NC_000913/2261891‑2262172 | aggttgccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgctaggcatcgtcttaccgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttggcgcttatG‑GGGTGACTTCaaa < 1:596051‑M1/14‑1 (MQ=255) gCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcata > 1:333510‑M1/1‑139 (MQ=255) gtggccatgcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAAc > 1:308568‑M1/128‑143 (MQ=255) tggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcatacttcagagggtgccacctttaagtgaacgcttctG‑GGGTGACTTCAAAAcc < 2:798969‑M1/17‑1 (MQ=255) ggCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagc < 2:955148‑M1/143‑8 (MQ=255) cGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGAACAAGACTTTTTAGAGAGGTGGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcagaagcgc > 2:875262‑M1/1‑134 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaataatgcgttacatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttccacccttacgttagcgcttctT‑GGGTGTCTTCAAAACACGAGAAGtt < 2:229548‑M1/26‑1 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtagcattctccggatggttcaacccttaagttggcgcccgtGCGGGTG‑CTTCAAAACCCGAGAAGtt < 1:190843‑M1/26‑1 (MQ=255) gtgcgacactatccctgccagcgtacaaaacgcaattgcagaacgcgatgcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGtt > 1:1012699‑M1/118‑143 (MQ=255) tgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcacaaaaG‑GAGAGACATCAAAACCCGAGAAGTTg < 2:339284‑M1/27‑1 (MQ=255) tCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGACTCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑AGGTGACTTCcataagcgctaactta > 2:137355‑M1/1‑127 (MQ=255) tCCAGGCGGTGAACGCGTCCGGGCTGACGCCGGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaactta < 1:1123252‑M1/143‑17 (MQ=255) ccAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCGGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaa < 2:678298‑M1/143‑18 (MQ=255) cAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACCGACCATATCGGACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaag > 2:938929‑M1/1‑125 (MQ=255) cAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaag < 2:1136782‑M1/143‑19 (MQ=255) aggcggtGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagg < 2:290330‑M1/140‑20 (MQ=255) gTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagagctaacttacggg > 1:49262‑M1/1‑123 (MQ=255) cagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGCGAAGTTGAAGTc < 1:1101964‑M1/32‑1 (MQ=255) tccccgaccgcctacaccgcgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCa > 1:1033648‑M1/107‑143 (MQ=255) ctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACtt < 2:560618‑M1/40‑1 (MQ=255) cGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCCGCGG‑GGGTGCCTTCcataagcgctaacctaagggttgtggtat > 1:1062022‑M1/1‑114 (MQ=255) tgagcgcctacaaaacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTc > 1:46536‑M1/103‑143 (MQ=255) ttCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGCATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGAGACATAaataagcgctaacataagggtagaggtaataa > 2:291988‑M1/1‑111 (MQ=255) cagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTGACTTCGcc < 1:434701‑M1/44‑1 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatT‑GAGTGACTTCAAAACCCGAGAAATTGAAATCGTTCACTTCGCcgtat < 2:1115618‑M1/48‑3 (MQ=255) aCGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctgtg > 2:437282‑M1/1‑101 (MQ=255) cGCCCGACGGAAAGCCTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 2:315196‑M1/143‑44 (MQ=255) aacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTcggtcacttcgcggccatttccc < 1:1059461‑M1/54‑12 (MQ=255) aacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTcc < 2:761914‑M1/54‑1 (MQ=255) 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tAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc < 2:1035783‑M1/143‑54 (MQ=255) aagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTaa < 1:460393‑M1/64‑1 (MQ=255) gagcgctatgcatcgccttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACg > 2:600474‑M1/78‑143 (MQ=255) gCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccga > 2:192265‑M1/1‑87 (MQ=255) aacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCCACAGCTAAACGt < 1:1155677‑M1/67‑1 (MQ=255) 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aaaGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaag > 2:709723‑M1/1‑30 (MQ=255) ttaagttagcgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTGTCGGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCCGCTCGctgagca < 2:328909‑M1/127‑4 (MQ=255) ctttccCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCccttagtgctaccttaagggttgtggtattacgcctgttatgatttaacgtgcctatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaact < 1:137355‑M1/141‑118 (MQ=255) tCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTGCcataagcggtaactgaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattacgctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgga < 2:803760‑M1/143‑121 (MQ=255) aGTCGGCGG‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatctgatttaacgtgccgatgacttactctcacgataactggtcagcaattatggcacaaattggtaagccagagcaacgggataca > 2:158896‑M1/1‑19 (MQ=255) cgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGCACAGTTGCTGaa < 2:534611‑M1/136‑1 (MQ=255) cgcttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGaa < 2:850855‑M1/136‑1 (MQ=255) tCGGCGG‑GGGTGACTGCcataagcgctaacttaagggtttaggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttc < 1:291988‑M1/143‑127 (MQ=255) cggcgg‑GGGTGACTTCcataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg < 2:1027694‑M1/143‑128 (MQ=255) cggcgg‑GGGTGACGTCcataagcgctaacctaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattacgcgcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg < 1:695922‑M1/143‑128 (MQ=255) ttatG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTGAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAAGGCCCAGCTAGCTGAACAGTTGCTGAAAAc < 1:1007497‑M1/139‑1 (MQ=255) gcgg‑GTGTGACTTCcatgagcgctaactcaagggttgtggggttacgcctgatatgatttaacgtgcctcttaatcactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggc < 1:666497‑M1/143‑130 (MQ=255) tGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAGACAAACCTGa > 1:624709/1‑143 (MQ=255) aCTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGAtt < 2:724934/143‑1 (MQ=255) cTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGGCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGTAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTg > 2:258039/1‑143 (MQ=255) ttCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTCCACCCTGGAAACGGTTGGCACTGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGt > 2:762466/1‑143 (MQ=255) ttCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAGTGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGt > 1:929471/1‑143 (MQ=255) ttCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGGTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGGGACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTTGTGAAAACCATCTTGATTGt > 1:216441/1‑143 (MQ=255) ttCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTGTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGt > 2:621268/1‑143 (MQ=255) tCAAAACCCGAGAAGTTGGAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTc < 2:503663/143‑1 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtgagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccggg > 1:294891‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGCAGGCGAGTCATCCAGTCGGTGAACGCTTCCGGGCTGACGCCTGACGGTAAGCTTCCGCTGACACAGACCATATCGAACTGACCGAGCCAGCTCAGAGAATCAGTCACAAAGCGTTCCCAGTCGGCGG‑GGGTGACTTCAAAACCCGAGAAGTTGAAGTCGGTCACTTCGCCGTCTTTTTCCGTCAGCTTAACGTTAATTCGGGTGCGCCCCTGTACAACCTGGAAACGGTTGGCAATGCCCAGCTCGCTGAACAGTTGCTGAAAACCATCCTGATTGTCT > NC_000913/2261891‑2262172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |