| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992759 | 67 (1.050) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTT > NC_000913/3992618‑3992900 | tatgctggtgtgttGGGCATGGTTTAACGGCATGCTGTGCTCGCGCACCCGTTTGTAGATGAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTg < 1:526146/130‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGAGCATGGTTTAACGGCATCCGGAGCCCGCGCGCCCGGTTGTATATCAAAGGTAACGGCATTGTCGCTTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcacc > 2:152612‑M2/1‑138 (MQ=255) tggtggCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccg < 2:1177222‑M2/143‑7 (MQ=255) gCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGCCGTGTCGCACCATTCCCCGCTGCGCTTACCCgcaccgacccg < 1:1085099‑M2/143‑12 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aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc < 2:1158982/143‑1 (MQ=255) aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc > 2:729099/1‑143 (MQ=255) aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc < 1:515325/143‑1 (MQ=255) gTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGACATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCTCTGCGCTTATCTgcaccgacacggcgcagtcgct < 2:113640‑M2/143‑23 (MQ=255) tttAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGCCACCGAACGCGCTCTa > 2:802849/1‑143 (MQ=255) ttAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATGTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctgg > 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cccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCAGGGGCTTATCGTTAACCTGGGATATGACCGGACAGCGGCGTTACGCAACCAGGTGGGGCATTGCGAATACCGTGAGCTgg > 1:1039235/1‑143 (MQ=255) ccGCTGCGCTTACCGgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgcatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcg > 1:430020‑M2/1‑15 (MQ=255) cGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaacgcggtagctccgccgatgagccgtttattcagaaggcgtttctttctctgccagtgatacccgcgc < 2:876260‑M2/143‑130 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgagacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgctacccgatgagccgtttattcagctggagtttccttctctgccagtgatccccgcgctaaaa > 1:427765‑M2/1‑9 (MQ=255) gcTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCCGGTGGTGCATTTCGATGTCCGTAGGCTGGATGTCTTc > 2:233804/1‑143 (MQ=255) ttACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgtttcccgctgtgccgtttattcagttgtcgtttctttctctgccagtgctcccctcgctaaaacta < 2:252459‑M2/143‑138 (MQ=255) ttACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATTCGCAATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAg > 2:332573/1‑143 (MQ=255) aCCTgtacctacactgctcagtcgctggcggaacaaattgacgccttcaaagccgccgcccgttaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaac > 2:80258‑M2/1‑4 (MQ=255) cTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctgaacctaccca < 2:960276‑M2/143‑142 (MQ=255) cTGCACCGACACCGAAGGCGCCCTAAAGCCCATGTGAGATCCGCCAGCTGGCGATTAGCGTCAACCTGGGATATGGCCCGACAGCGGCGTTCCGCAGTCAGGTGGTGCGTGTCGATCTCCGTACGCTGGAGGTCGTCGGCtgg > 1:535710/1‑141 (MQ=255) | TAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTT > NC_000913/3992618‑3992900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |