| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4094681 | NA (NA) | 26 (0.450) +TGTAGGCCGGATAAGGCACTTGT |
4/238 | 8.6 | NA | noncoding (367/402 nt) | REP299 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 9 REP sequences | REP299 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 9 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4285323 = | NA (NA) | noncoding (23/77 nt) | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCG > NC_000913/4285181‑4285457 | tcttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg < 1:701208/143‑1 (MQ=255)tcttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGAGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAGCCCTTGCCGAATGTTGGCCGGCTTCGGCGTTTAcg > 2:589614/1‑143 (MQ=255) ttctGTCCGATGATAGATGGTGCCATTCTTCACCGATGCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 1:1188648/143‑1 (MQ=255) ttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCACTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc > 1:118779/1‑143 (MQ=255) tctATCCGCTGATAAATCGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTCATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccg < 1:446680/143‑1 (MQ=255) tctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTACCCCTTGCCGAATGTAGGCCGGGTAAGGCGTGTAcgccg > 2:7765/1‑143 (MQ=255) ctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccgc > 2:774497/1‑143 (MQ=255) ctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccgc > 2:771088/1‑143 (MQ=255) cGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCg > 1:549711/1‑143 (MQ=255) gCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCgg < 2:855761/143‑1 (MQ=255) aTAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatcaat < 2:596501/143‑1 (MQ=255) gtgtctgtcatctCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCTCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGcc < 2:850026/136‑1 (MQ=255) gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGcc > 1:292718/1‑143 (MQ=255) tGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCGCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt > 2:900729/1‑143 (MQ=255) ccgttCATCACAGATGCTCCAGAGGTAATGTAGGGGTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGa < 1:1080872/140‑1 (MQ=255) aTTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATg > 1:979391/1‑143 (MQ=255) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACg < 1:771088/143‑1 (MQ=255) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACg < 1:774497/143‑1 (MQ=255) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGCAGAAGGTTAACGCTCGGGTCACCCCTTCGGAATGTCGGCCGGACACGGCGTTTACGCCGCCTCCGGCCCTCAATGCCTCCTGCGCCg > 2:1071717/1‑143 (MQ=255) acctatcctcCAGCGGGAAGATAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTCACGGGAGAAGGTGAACGCTCGCGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGTCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCt < 1:627142/136‑1 (MQ=25) tctcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcgcg > 1:1118665/1‑143 (MQ=255) tcCAGAGGTCATGTAGGGATTGTTTTACTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTc < 1:767542/143‑1 (MQ=255) gggTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATc < 1:345273/142‑1 (MQ=255) tAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAgg < 2:755058/143‑1 (MQ=255) cttGTACGGATTGTTGTAATTCCACCTGCCTTGTGGAAGACGGTTAGCGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGc < 1:87303/141‑1 (MQ=21) aaTGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGc < 2:145028/143‑1 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTACGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:521908/143‑1 (MQ=255) gTAGGCATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:958150/143‑1 (MQ=255) aGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACa > 1:897409/1‑143 (MQ=255) aGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACa > 2:1136779/1‑143 (MQ=255) aTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAcc < 2:572244/143‑1 (MQ=255) ttGTTTTCATGCCCGCGCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAACGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCg < 2:168320/143‑1 (MQ=255) ggTTTTGATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTACCCCTTGCCGAATGTATGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCTGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGt < 1:481570/142‑1 (MQ=25) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGttc > 2:89859/1‑142 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTa > 1:1145415/1‑143 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCGGTTAGGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAc < 1:778199/143‑1 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAc < 1:1146051/143‑1 (MQ=255) ttgaTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAcc < 2:955482/140‑1 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCAGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGATACCGACt > 2:426409/1‑143 (MQ=255) gtCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACt < 1:1020952/142‑1 (MQ=255) tCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTGAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTc < 1:858227/143‑1 (MQ=255) cTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAcgcggaaa > 1:331552/1‑139 (MQ=255) gctcTTATGGTAGGATGTTAACGATCTGGTAACCCTTGCCGCATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCg < 2:330745/140‑1 (MQ=21) gcttggggtggaAGGTTAGCGCTCGGGTAACCCTGGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCggg < 1:625290/133‑1 (MQ=25) ccTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCggg < 2:118620/143‑1 (MQ=255) ccTTATGCGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGCTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGCCGCTGTCGCGTCTTACCCGGCCTACCCACCGTACCCGACGCGCATCggg > 1:1120525/1‑143 (MQ=25) cTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGc < 1:126113/143‑1 (MQ=255) ttATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACACTTGCCGAATGTAGGCCGGCTAAGGCGTTTACGCCGCATCAGGCAATCAATGCCTGAGGGGACGCAGTCGCGACGTATCAGCTCAACAAACCGTGCCCCACTCGCCTCggccg > 2:518969/1‑140 (MQ=25) ggAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGTCGAATGCAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTGCCAACCGTTACCCACTCGCCTCgcgggagtgt > 1:859319/1‑134 (MQ=21) ggAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgt < 2:1118665/143‑1 (MQ=255) gagaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCCCTCAATGCCTTATTCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgtg < 2:1077289/143‑1 (MQ=255) gagaAGGGCAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATCTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgtg < 2:986488/143‑1 (MQ=255) tgaAGGTTAACGCTGGGGTAACCCTTGTCGTATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 1:904078/142‑1 (MQ=255) agaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCCATCAATGCCTGAGGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 2:755068/143‑1 (MQ=255) agaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCCATCGTgg > 1:1079708/1‑143 (MQ=255) agaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 2:751694/143‑1 (MQ=255) aaGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGt > 1:647826/1‑143 (MQ=255) ttAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACg > 2:301481/1‑143 (MQ=255) aaCGCTCGGGTATCCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGAt < 2:623250/143‑1 (MQ=255) aaCGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCGTACAAACCGTTACAGACTCGCATCGGGCAATGGTGGGTTACGAt > 2:1085114/1‑143 (MQ=255) ccgggctggTAACGCGTGGCGAATGTAGTCCGGATAAGGCGTTTGCGCCGCATCCGGCAATCAAGGCCGGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATg < 1:504688/136‑1 (MQ=21) cGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATAACTGATGCGCCGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTCACCGACTCGCGTGGGGCGAGTGAGGGTGACGATgg > 1:703137/1‑143 (MQ=21) gCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGc < 2:1162312/143‑1 (MQ=255) gggTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATcg < 2:865752/143‑1 (MQ=255) gTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGGTACGATGGCATcgcg > 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2:1056276/143‑1 (MQ=255) tAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAGTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGCCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCACTTGTGGGTTGCGATGGGATGGGCAGAGCGTGCTTCTCTTc > 1:259277/1‑143 (MQ=21) ggCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaa < 2:952179/143‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaa < 2:48446/143‑1 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATACGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGACTACAAACCGTTACCGAATCGCAACGGGCCATCGTGGGATACGAGGGCACCGCGATAACCTGGTTGTCTGCagg > 1:448701/1‑141 (MQ=18) cGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGACTTATCGGGCCTACAAACCGTTACCGACTAGCAGCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGGTAACCGGCTGCGCTTCAagca > 2:256273/1‑143 (MQ=25) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAagcagc < 1:499477/143‑1 (MQ=255) aTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAgctgct > 2:837649/1‑143 (MQ=255) aGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTtct < 1:277137/143‑1 (MQ=255) ggCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTtctc > 1:216711/1‑143 (MQ=255) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCg > 2:562995/1‑143 (MQ=255) | TCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCG > NC_000913/4285181‑4285457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |