New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 173004 = | 69 (0.930) | coding (1543/1983 nt) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
CTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGG‑CGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCGGCGTTTGGCGTGGTGTTGATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTG‑ACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACAC‑CGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCAA‑GTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGC > NC_000913/172419‑172986 | cTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGG‑CGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCg < 1:501087/289‑1 (MQ=255) 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atcgtccgtcgaaagcccatcatccgcgcaatatgcggtgccattaaaccaacaaaactcaacggtccaatagtcatcgtcgcggtcgccgtcaggcaagccgctaacagcagcagcgcaattcgcgtcggcgtcagcgccattcctacggctcgggcggtatcaccacccagcggtaaaatggtcagccagcggcggcacagcggggtaatcgccagcaaaatcaccatcacaattccggtgcgccagacctgcgcatcggccgcgttttaggtcgaACCGGAAAcc < 2:447030‑M1/10‑1 (MQ=255) cgcgTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGG‑CGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGc < 2:649960/289‑1 (MQ=255) agcaTTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGG‑CGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGaa < 2:607880/288‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |