| New junction evidence | |||||||||||
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aaaTATTATGCGGGATGGGAATTAAACTACGCCGCTTAACTGCGGGTATCTGTCTGATAACTCAACTTGCGTTCCCTATGGCTGCGGCAGCACAAGGTGTGGTAAACGCCGCAACCCAACAACCAGTTCCTGCACAAATTGCCATTGCAAATGCCAATACGGTGCCCTACACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCa < 2:685862/289‑1 (MQ=255) tGCGGGATGGGAATTAAACTACGCCGCTTAACTGCGGGTATCTGTCTGATAACTCAACTTGCGTTCCCTATGGCTGCGGCAGCACAAGGTGTGGTAAACGCCGCAACCCAACAACCAGTTCCTGCACAAATTGCCATTGCAAATGCCAATACGGTGCCCTACACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgatg > 2:112064/1‑289 (MQ=255) tGCGGGATGGGAATTAAACTACGCCGCTTAACTGCGGGTATCTGTCTGATAACTCAACTTGCGTTCCCTATGGCTGCGGCAGCACAAGGTGTGGTAAACGCCGCAACCCAACAACCAGTTCCTGCACAAATTGCCATTGCAAATGCCAATACGGTGCCCTACACCCTTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGtgatg > 1:588384/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |