| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,769,672 | (A)8→7 | pseudogene (1/111 nt) | yibV → | pseudogene, putative cryptic Rhs immunity protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,769,665 | 0 | A | . | 97.5% | 342.6 / ‑0.5 | 79 | pseudogene (322/327 nt) | yibV | pseudogene, putative cryptic Rhs immunity protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base . (51/26); minor base G (1/1); total (52/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAA > NC_000913/3769527‑3769800 | gATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATaaaaa > 1:733552/1‑143 (MQ=255) gagccggACTTGGCTAATCCCACACACGCTAATTATTAAGTAACGGAAAGATCATGAGGCCAGGTCTGAAAAAGCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCGG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATaaaaaa < 2:660496/138‑1 (MQ=255) aTGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGACGCTG‑CTTGCATTGAACCAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATaaaaaa > 2:809754/1‑143 (MQ=255) cTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATaaaaaaatc > 2:237703/1‑141 (MQ=255) cTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCAGAAAAAACTAAATCCACTCCAACTTGACGCCG‑ATTGCAAGGAAACCGCACATAAAATAAAAGATAAGAATaaaaaaata > 2:470093/1‑141 (MQ=255) tttCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCTAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGat > 1:1261323/1‑143 (MQ=255) tttCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGat > 2:933644/1‑143 (MQ=255) gAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAACAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATaaa > 2:787969/1‑143 (MQ=255) ataCATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑CTTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTAAGtt > 2:1337684/1‑143 (MQ=255) cATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGATAat > 1:977380/1‑143 (MQ=255) aTGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAata > 1:1242963/1‑143 (MQ=255) tGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAatat > 1:499718/1‑143 (MQ=255) tGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGAGCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAatat > 1:1302880/1‑143 (MQ=255) cTATTTATTAAGTAAAGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACATGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATAttt < 2:1056440/143‑1 (MQ=255) cTAGTTATGAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATAttt < 1:465284/143‑1 (MQ=255) attaagtaagtaagAGAAAGAGCATAAGAACATATATGAAAAATATAAATACAAACAAACTTGGAGATG‑AAAGAAATGAAACAGTAAAAAAAATAAAAGATAAAAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGt < 2:103929/137‑1 (MQ=255) tttattAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTa > 2:615346/1‑143 (MQ=255) ttaAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATCGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGtga > 2:570273/1‑143 (MQ=255) gtaagGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACCCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTATAGTgatgat > 2:512065/1‑143 (MQ=255) aagGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATaa > 2:1235273/1‑143 (MQ=255) agGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAAACGTATAAAAAACACAAGA‑GTCAGGGAAAGAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATaaa > 2:966781/1‑143 (MQ=255) gggAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATaaaa > 2:986599/1‑143 (MQ=255) gggAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATaaaa > 2:558863/1‑143 (MQ=255) gggAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACACCAACATGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATaaaa < 2:577783/143‑1 (MQ=255) gaacATAAGACCAAATCTGAAAAATCTAAATACACACAAACTAACCGCAG‑AATACATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAACATCTaa < 2:1042932/140‑1 (MQ=255) gATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATaa > 1:978211/1‑143 (MQ=255) gATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTACAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATaa < 2:425801/143‑1 (MQ=255) aaccacaaGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAACTTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATaa < 1:822482/137‑1 (MQ=255) aTCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTATTGATGATAAAAATATaaa > 2:16033/1‑143 (MQ=255) tAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTg > 1:342460/1‑143 (MQ=255) aaGAACATATAAAAAAAATATAAATCCTCTACAACATGACGCTG‑AATGAATAGAAATAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAAGTCAGTGAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTga < 2:746876/143‑1 (MQ=255) ccATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGt > 1:1268224/1‑143 (MQ=255) tctcAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAACAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATa < 1:194613/143‑1 (MQ=255) tCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAACTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATa < 2:641269/143‑1 (MQ=255) cTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGACGCTG‑ATTGCATTGGAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAg < 1:924439/143‑1 (MQ=255) tGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTaa < 1:1134190/139‑1 (MQ=255) tGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTaa > 2:1134190/1‑139 (MQ=255) tGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGt > 1:1338868/1‑143 (MQ=255) tGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGt > 1:259521/1‑143 (MQ=255) gAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTa > 2:1108938/1‑143 (MQ=255) aaaaaTCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCAGCAGTG‑AGATAAACAGTAAATAAAATAAAACATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAAGATTTGTAGAGATGATAAAAATAAAAAATTGAAAGATAATAGTAc > 2:975612/1‑143 (MQ=255) aaaTCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTTATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATAGAGAGTTAATAGTACta > 1:384886/1‑143 (MQ=255) tCTAAAACCAATCGAACATGCAACTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACtatta < 2:620237/143‑1 (MQ=255) cTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACtattat > 1:77971/1‑143 (MQ=255) aTCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGcc > 1:894824/1‑143 (MQ=255) cACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCAtt < 1:1025481/143‑1 (MQ=255) aCTCCAACTTGCCGTTG‑ATTGCATCGAAACAGGAAAGAAAATAAAAGATAAGAA‑GAAAAAAATCATTTATATTAAGTCAGTGAATATTTGTAGTGATTATAAAAATATAAAATTGAGTGTTAAGAGTACTATTATGGCCATtg < 1:548994/143‑1 (MQ=255) tCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAACTCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATtgat > 1:935710/1‑143 (MQ=255) tCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATGATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGGACTATTATGGCCATtgag > 1:10237/1‑142 (MQ=255) tCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCAAtgat > 1:1261110/1‑143 (MQ=255) cacccacccGCTG‑AGTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAAAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATACAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATtgatga < 1:1098701/136‑1 (MQ=255) cAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCGATtgatga > 1:1243375/1‑143 (MQ=255) cAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATtgatga > 1:1262340/1‑143 (MQ=255) aaCTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTgatgat > 2:448171/1‑143 (MQ=255) cTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTc > 1:1205985/1‑143 (MQ=255) gCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCAATTGATGATTCtat > 2:451912/1‑143 (MQ=255) ccGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCtata > 1:1088313/1‑143 (MQ=255) cGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaa > 1:691042/1‑143 (MQ=255) cGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaa > 2:615971/1‑143 (MQ=255) tgcgtagttgaTTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAATATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaa < 1:1143925/133‑1 (MQ=255) gatG‑ATTGCATTAAAACAGTAAAAAAAAAAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAATTAATATTTGTAGTAATGATAAAAATATAAAAATGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaaa < 1:4664/141‑1 (MQ=255) gCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaaa > 2:561691/1‑143 (MQ=255) gCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaaa < 2:688901/143‑1 (MQ=255) gcacaTTTCATTAAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATaaa < 2:1283238/139‑1 (MQ=255) cTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAg < 1:518803/143‑1 (MQ=255) tG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGt < 1:972077/143‑1 (MQ=255) ttGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTATGATTATTGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCa > 1:922151/1‑143 (MQ=255) tGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCCTTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCAt < 1:51166/143‑1 (MQ=255) aTTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCAATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGa > 2:562563/1‑143 (MQ=255) ttGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGat < 1:558283/143‑1 (MQ=255) tGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGatg > 2:1258994/1‑143 (MQ=255) gAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGatga > 1:262244/1‑143 (MQ=255) aaaCAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGatgaa < 1:146235/143‑1 (MQ=255) aaCAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCAGCGatgaat > 2:863278/1‑143 (MQ=255) gTAAATAAAATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATCTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCAACGATGAATGATa > 2:5183/1‑143 (MQ=255) taaataaaATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATaa < 1:483267/143‑1 (MQ=255) taaataaaATAAAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATaa > 1:200665/1‑143 (MQ=255) aataaaataaAAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACt > 1:1357745/1‑143 (MQ=255) ataaaataaaAGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACtt > 1:639366/1‑143 (MQ=255) taaaaGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATCAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATCGCCATTTATGATTCTATAAAGTGCATCCATGACACTTAACTTAAtttt > 2:1012824/1‑143 (MQ=255) taaaaGATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAAtttt > 2:767213/1‑143 (MQ=255) aaaaGATAAAAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTCTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATttta < 2:450614/143‑1 (MQ=255) gATAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACGTAATtttattta > 1:526635/1‑143 (MQ=255) aTAAGAAT‑AAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATtttatttga > 1:532166/1‑141 (MQ=255) | GATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTG‑ATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAA > NC_000913/3769527‑3769800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |