New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4285334 | NA (NA) | 7 (0.110) +CTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTA |
4/236 | 9.7 | NA | noncoding (34/77 nt) | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences |
? | NC_000913 | 4325806 = | NA (NA) | noncoding (4/583 nt) | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 12 REP sequences | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 12 REP sequences | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGG > NC_000913/4285193‑4285473 | tGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGca < 1:1211621/143‑1 (MQ=255) tAAAGAGTGCCAGTCATCACAGATTCTCCAGAGGGAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatc < 1:1276534/143‑1 (MQ=255) aTAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGCAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatcaat < 1:862286/143‑1 (MQ=255) aGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTCTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 1:940168/143‑1 (MQ=255) aGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGATTTGTGTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcattgattgc < 1:1291061/143‑9 (MQ=38) tGCCATTTATCACAGAGTCGCCGGAGGTAATGGAGGGATTGTTTTAGTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt < 2:621066/143‑1 (MQ=38) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTTATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGa < 2:1117021/143‑1 (MQ=255) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGACTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGa > 1:430835/1‑143 (MQ=255) ccAGTCATCACAGTTTCCCCAGTTGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGa < 2:759794/143‑1 (MQ=38) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGCTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACg > 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agagGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATCCGACGCCGTCGCGTcctc > 2:501843/1‑140 (MQ=255) gagGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCCTCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTAt > 1:659911/1‑143 (MQ=255) gagGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCGTGATGCGACGCTGTAGCGTCTTAt > 1:429292/1‑143 (MQ=255) gTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATTCGGCCATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCGTATCAg > 2:402403/1‑143 (MQ=255) gTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAg < 1:82660/143‑1 (MQ=255) tAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAgg < 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gTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGtt < 2:1005667/143‑1 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTa < 1:1095124/143‑1 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCCTTa > 2:1115439/1‑143 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTCGTCAGGCCTACACACCGttc > 2:660828/1‑142 (MQ=255) gttAATTCCCGCTCCGTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTGGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAAAGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAc < 2:301224/142‑1 (MQ=255) ttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCCCGTCTGATCAGGCCTACCAACCCTCAcc > 2:99579/1‑143 (MQ=37) ttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCAGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGGGTCTTATGAGGCCTACAAACGGTTAcc > 1:25776/1‑143 (MQ=255) caTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGa < 2:720042/142‑1 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCAGCATCAGGCAATCAATACCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATAAGGCATACAAACCGTTACCGACt > 1:1110803/1‑143 (MQ=37) tCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCCGTCGCGCCTTACCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTc > 2:1352618/1‑143 (MQ=255) ccGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTACCGGTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCACCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGc < 1:218742/143‑1 (MQ=255) cccTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTCCCGACTCGCATCgg > 2:1134716/1‑143 (MQ=255) cataagggAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGc > 1:694759/6‑143 (MQ=255) cTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCGGTCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGc > 1:192786/1‑143 (MQ=255) cTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACCCGCACCGGGc > 1:207832/1‑143 (MQ=255) ggAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGAGAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgt < 2:797999/143‑1 (MQ=255) tacgtggTTACCGCGCGGCTAACCCTTGCTGAAGGTAGGTCGGATAAGGCGTTTCCGCCGCAGCCGGCAACCAAAGCTTTATGCGTCTCTGTCGCGTCGTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgtg < 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2:1301527/140‑2 (MQ=21) tAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTc > 2:1136799/1‑143 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCa < 2:543109/143‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTTGCGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaa < 2:956224/143‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCGTGCTTATCTTCaa > 2:632071/1‑143 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaa < 1:405291/143‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAagcag < 1:1165329/143‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTGGCGTCTTGTCAGGCCTACAAGACGTTACCGACTCGCATCGGGCCATTGTGGGTGACGGTGGCCTCGCGCTAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACgg > 1:1258785/1‑142 (MQ=25) gccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGcc > 1:131878/1‑143 (MQ=255) ccgcTTCCTGCTATCAATGCCTGATGCGGCGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCa < 1:940545/143‑1 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCa < 1:966079/143‑1 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCa < 1:1293980/143‑1 (MQ=255) tCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCAAggcac > 1:422893/1‑140 (MQ=255) cGGCAATCAATGCCTGGTGCTACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCgg < 2:550624/143‑1 (MQ=255) | TGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGG > NC_000913/4285193‑4285473 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |