| New junction evidence | |||||||||||
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TCCGTTGAAGCAGCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGCGGCG > NC_000913/3219948‑3220520 | tCCGTTGAAGCAGCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgc < 2:587075/289‑1 (MQ=255) tttcgttatcaacaaactcaatcgccatcaacatccctttaccacgcgcttcctgtaccagatcgggatattcccgcgccagttgacggaaaccgtccagcaacatatcgcctttttgctcagcctgagccggtaagttctgctccagcaacacattgatggtcgccagcgccgccgcacaggccagcgggttgccgccaaaggtggtggtatgcaggaatgggttgtcgaacagaactgaaaacacctcttcagtggcgatggtcgcgccaatcggcatcacgccgcc < 2:649957‑M1/6‑1 (MQ=255) tttcgttatcaacaaactcaatcgccatcaacatccctttaccacgcgcttcctgtaccagatcgggatattcccgcgccagttgacggaaaccgtccagcaacatatcgcctttttgctcagcctgagccggtaagttctgctccagcaacacattgatggtcgccagcgccgccgcacaggccagcgggttgccgccaaaggtggtggtatgcaggaatgggttgtcgaacagaactgaaaacacctcttcagtggcgatggtcgcgccaatcggcatcacgccgcc < 2:282139‑M1/6‑1 (MQ=255) tttcgttatcaacaaactcaatcgccatcaacatccctttaccacgcgcttcctgtaccagatcgggatattcccgcgccagttgacggaaaccgtccagcaacatatcgcctttttgctcagcctgagccggtaagttctgctccagcaacacattgatggtcgccagcgccgccgcacaggccagcgggttgccgccaaaggtggtggtatgcaggaatgggttgtcgaacagaactgaaaacacctcttcagtggcgatggtcgcgccaatcggcatcacgccgc < 1:875664‑M1/5‑1 (MQ=255) tGAAGCAGCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCCCGAACCGCTTCAGGGGGAAGGTGGCGTCATTCTgccgtc > 1:764064/1‑286 (MQ=255) gttatcaacaaactcaatcgccatcaacatccctttaccacgcgcttcctgtaccagatcgggatattcccgcgccagttgacggaaaccgtccagcaacatatcgcctttttgctcagcctgagccggtaagttctgctccagcaacacattgatggtcgccagcgccgccgcacaggccagcgggttgccgccaaaggtggtggtatgcaggaatgggttgtcgaacagaactgaaaacacctcttcagtggcgatggtcgcgccaatcggcatcacGccgccgccg > 2:449541‑M1/280‑289 (MQ=255) cgcTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTa > 2:316428/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |