| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,992,523 | (CGGGC)2→1 | coding (1372‑1376/2547 nt) | cyaA → | adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3992521 = | 3 (0.050) | 48 (0.800) | 46/270 | 0.2 | 94.3% | coding (1370/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 3992515 | 3 (0.050) | coding (1364/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
TCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACC > NC_000913/3992374‑3992657 | tctcCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCGTTATTTATGTGCCg < 2:592628‑M2/143‑2 (MQ=255) cGCCGGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgg > 1:315026‑M2/1‑138 (MQ=255) gCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCAACCGATCTCTCGGAACCGAATATGACCTTTATTCACGTGCCgccggg < 1:492862‑M2/143‑7 (MQ=255) ggccgcGGGAGATCGGCGTGCTGACGCGTGAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaa > 1:115078‑M2/3‑133 (MQ=255) tCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGGGCCGCTGGTAAGCCCGCAGATGTCACCCGATCTCTCGGAACCGAAGCTGACCCTTATGTATGGGGCgccgggctaac < 1:807630‑M2/143‑12 (MQ=255) ccGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACGAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGACCCGAGTCTGACCATAATTTAGGTGTCgccgcgctgacc < 1:30167‑M2/143‑13 (MQ=255) gcagcaTATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCCGATTTCGCCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTGATTTATGTGCCgccgggctaaccgt > 1:186432‑M2/1‑129 (MQ=255) gCAGTATATCGGCTTGCTGAGGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGAATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgt > 1:965408‑M2/1‑129 (MQ=255) gCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgt < 2:870648‑M2/143‑15 (MQ=255) aGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttc > 1:576680‑M2/1‑127 (MQ=255) tCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCAAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttg > 1:455385‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGACGCGTAAGCGGGATGCCGCGTTCGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgt > 2:219245‑M2/1‑113 (MQ=255) tGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgta < 2:181570‑M2/143‑32 (MQ=255) cgaCGCGTAAGCTGGATGCCGCGTTTGAAGCACTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgta > 2:1022492‑M2/2‑112 (MQ=255) cgcgTCGGCTGTAGGCCGCGTTTGACGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAACCCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataa > 1:645271‑M2/1‑109 (MQ=255) cgTAAGCGGTATGCCGCGTTTGAAGCATCACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGAGTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataacc > 2:366982‑M2/1‑107 (MQ=255) tAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTCTGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgc < 1:651272‑M2/143‑39 (MQ=255) aGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAACCCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgc > 2:522290‑M2/1‑103 (MQ=255) cTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGGAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCGAGGAACCGAATCGGACCTTTATTTAGGTGCCgccgggctaaccgttagggttggtatcggtgtaaccgcgcgg < 2:28773‑M2/143‑43 (MQ=255) tGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaat < 2:592781‑M2/143‑48 (MQ=255) gcgTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaagctga < 2:30800‑M2/143‑52 (MQ=255) gttgAAGCATCACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagt > 2:642046‑M2/2‑89 (MQ=255) caacctttACCATCTAAATCGACTCTTCTAATCCCCCATATTTCACCCGTTCTCTCGTAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCTCCG‑‑‑C‑‑TCTAACCTTTCATTTTGGTATCTTTATAACCTCTCGCCAAATATTGAGTCGa < 1:800062/137‑1 (MQ=255) aaGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgat > 2:668421‑M2/1‑85 (MQ=255) ttACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatca < 1:637125‑M2/143‑64 (MQ=255) ttACCAGGTAAAGGGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatca > 2:483751‑M2/1‑80 (MQ=255) aGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccat > 2:1079583‑M2/1‑75 (MQ=255) ggTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgcccaagattgagtcgatcatccgccatc < 1:613775‑M2/143‑70 (MQ=255) aggtgACTCGGATTAACCGGCAGATGGCCCCCGCTCTCTCGGGACCGAATCTGACTTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctctataaccgcgcgccaaatattgagtggatcatcagccatcagcc > 1:968952‑M2/3‑70 (MQ=255) aGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACGGAATGTCACCCTAAGTTATGTGCC‑‑‑‑‑GCCGTGCTAACCGGTCAGGTTGTTATGTGTATAACCGCGCGCCAAATCTGGAGTCGCCcatcagcccgccgccg > 1:185719/1‑135 (MQ=255) tGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgct > 1:923321‑M2/1‑67 (MQ=255) gCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgagccaactatcgagtcgatcatcaggcatcagccgctggaa < 1:975900‑M2/143‑81 (MQ=255) ggTAAACCCGCAGATTTCACCCGTTCGCTCTTAACCGAATCTGACCTGTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatat > 2:682853‑M2/1‑60 (MQ=255) tAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgctcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccactggaatataa < 2:637062‑M2/143‑86 (MQ=255) aaCCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaacattgagtcgatcatcagccatcacccgcgggaatataacc < 1:746612‑M2/143‑88 (MQ=255) ccGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgtt < 2:32548‑M2/143‑91 (MQ=255) cGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgtta < 2:478194‑M2/143‑92 (MQ=255) gCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttgc < 2:403588‑M2/143‑93 (MQ=255) gCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttac > 2:269839‑M2/1‑51 (MQ=255) tttCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTACGTGC‑‑CC‑‑‑CCGGGCTCACCGTTCAGGCTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAACAATTGCGCCGATCATCTGCCACCCGCCGCTGGGCTAAAACCCttctccgac > 1:194023/1‑136 (MQ=255) cccGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagccgatcatcggccatcagccgccggaatatcaccgttacctggctaacc < 2:121822‑M2/143‑103 (MQ=255) ccGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagacatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaact < 2:821688‑M2/143‑104 (MQ=255) cGAGCGCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggcgaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactg > 1:870648‑M2/1‑39 (MQ=255) gctctcgGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtacaaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctgggatataaccgttacctgaataaactggtg > 2:596871‑M2/2‑36 (MQ=255) ctcGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcg < 1:578232‑M2/143‑111 (MQ=255) ctcGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataacagcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgactaacctggtggcg < 1:130525‑M2/143‑111 (MQ=255) tcGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgt < 2:1039795‑M2/143‑112 (MQ=255) cacggATCTGGCCTTGATTTCGGCGCCgcggggctaaccttgcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggca > 1:28773‑M2/3‑27 (MQ=255) ttatttatGTGCCgccgggctaaccgttaaggttgggttctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcggccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactgggggcgtgggcatggtttaactgcct < 1:898202‑M2/143‑131 (MQ=255) tatttatGTGCCgccgggcggaccgttgaggttgggatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccagcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctg > 1:671275‑M2/1‑12 (MQ=255) gcggggccgccgggctaaccgtgcaggttggtatctgtagaaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctga > 2:271328‑M2/6‑8 (MQ=255) cccgccgggctaaccgttcaggctggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcg > 1:554825‑M2/2‑3 (MQ=255) ccgccgggctaaccgttcaggtgggtatctgtacaaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgc > 2:91520‑M2/1‑2 (MQ=255) cgccgggctagccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccgaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcg > 1:753277‑M2/1‑1 (MQ=255) | TCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACC > NC_000913/3992374‑3992657 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |