| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1739666 | 76 (0.810) | coding (133/933 nt) | ydhB | LysR family putative transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGCCCGTTCCGCGACTATCGTCGTTAATCACCCGTTGCGGGAGTCTCTTCCGGCTCCCGCAGCCACTCCTTATTCAGCGTCTCACTATCGCCGAGATACTCAAGCAACCAGGTTAACGCAGGCGACATATCATTTTGCTGCCATGTCAGACAACATGCCGAATCCGGAAAGGGGTTTTCCAGTTCTAATGCTACCCACTTCCCCTCATTAAGCCACGGTTTGGCGAAATGTGTTGGCACCATCCCTATGCATAATCCTGCCGAGATACAGGTTGCCGATGATTCC > NC_000913/1738557‑1739127 | tCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGc < 1:454841/289‑1 (MQ=255) 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tcttctGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCAGTGGCTGCAGGCCCGTTCCCCCACTa > 1:759607/1‑289 (MQ=255) cttgttgggtggctgtttgttGGCAATGGGCGCACTTTGGGCTGCTGATGAAATGGGCCGGGGCGTCCCGCAGGAGGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGCCCGTTCCGCGACTa < 1:25540/268‑1 (MQ=255) ctGTTGTGGCGATATCATGGCAGTGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGCAATTGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGCCCGTTCCGCGACTAtcgt < 2:646262/289‑1 (MQ=255) tggtggCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAATTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCCCCGGGGCTCACGGCCCGTTCCCCGCCTCTcgtcgt > 1:466284/1‑289 (MQ=255) tggCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGCCCGTTCCGCGACTATCGTCGTTaa > 1:546756/1‑289 (MQ=255) atCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTTTCGCTGATCGGTT‑ATGATAACGTGCGCAACGCGCGCTATTTTACGCCGGCGCTGACCACGATCCATCAGCCAAAAGATTCGCT‑GGGTGAAACAGCGTTCAACATGCTGTTGGATCGTATCGTCAACAAACGTGAAGAACCGCAGT‑CTATTGAAGTGCATCCGCGCTTGATTGAACGCCGCTCCGTGGCTGACGGCCCGTTCCGCGACTATCGTCGTTAATCACCCg < 2:27708/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |