New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4515803 = | 93 (0.960) | 3 (0.030) | 3/492 | NT | 3.0% | coding (876/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer, ferric citrate extracelluar receptor, FecR‑interacting protein |
? | NC_000913 | 4516244 = | 104 (1.120) | coding (435/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer, ferric citrate extracelluar receptor, FecR‑interacting protein |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGCCAGTGAAAGCTGCGGCTGACCGTAAGGGGCGAAGGGGACGGGGATGCCGTCCA > NC_000913/4515517‑4516089 | tGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGGGc > 2:42230/1‑288 (MQ=255) aaTTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCaa > 2:648881/1‑289 (MQ=255) gcacacagcggatttaccctctcggttgacgccagcctgacgcgcggcaagcagagcaacggcctgcacggcgattacgacgtcgagagcggcctgcaacaactgctggacggcagcggactgcaggtaaaaccgctgggaaataacagctggacgctggagcccgcgcccgcaccaaaagaagatgccctgaccgtggtcggcgactggctgggtgatgcgcgtgaaaacgacgtatttgaacatgctggcgcgcgtgacgtgatccgacgggaggatttcGCCaaaa < 2:386483‑M1/7‑1 (MQ=255) cacacagcggatttaccctctcggttgacgccagcctgacgcgcggcaagcagagcaacggcctgcacggcgattacgacgtcgagagcggcctgcaacaactgctggacggcagcggactgcaggtaaaaccgccgggaaataaccgctggacgctggagcccgcccccgcaccaaaagaagataccctgaccgtggtcggcgcctggctgggtgacgcgccggaaaacgacgtatttcaacatgctggctcgcgcgacgtcgtccgcgtggaggctttcgccacaa < 1:522686‑M1/7‑4 (MQ=255) aTGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCg > 2:619993/1‑289 (MQ=255) tCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGTTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCt < 2:747545/288‑1 (MQ=255) ggAACTGGGAGCCCAGGCTCGCCAGCTGGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgcc < 2:175706/289‑1 (MQ=255) gAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgcc < 1:84463/288‑1 (MQ=255) gAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgcc < 1:373023/288‑1 (MQ=255) gAACTGGGAGCCCGGGCTAGCCGGCTTGGGGCGACCCCAGAAGCGGTCATGCGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTC‑ATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgcc < 1:459205/288‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |