| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 935,501 | C→G | 4.2% | P760A (CCG→GCG) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 935,501 | 0 | C | G | 4.2% | 316.8 / 3.5 | 92 | P760A (CCG→GCG) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/46); new base G (2/2); total (44/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
AACAGTATCAACATGATGTGCCCGTAAACGCAGAAGATGCAGATGCTGCGGCAGAGGCTGAACTGGCTCGTCAGTTTGCGCAAACTCAACAACAACGTTATTCCGGCGAACAACCGGCTGGGGCGAATCCGTTCTCGCTGGATGATTTTGAATTTTCGCCAATGAAAGCGTTGCTGGATGATGGTCCACACGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCC > NC_000913/935217‑935787 | aaCAGTATCAACATGATGTGCCCGTAAACGCAGAAGATGCAGATGCTGCGGCAGAGGCTGAACTGGCTCGTCAGTTTGCGCAAACTCAACAACAACGTTATTCCGGCGAACAACCGGCTGGGGCGAATCCGTTCTCGCTGGATGATTTTGAATTTTCGCCAATGAAAGCGTTGCTGGATGATGGTCCACACGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCCGCAGCCGCAACAACCAGTTccgc > 1:165466/1‑288 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |