Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,590,074 | 0 | G | A | 4.1% | 340.3 / 3.1 | 99 | E828K (GAA→AAA) | acrD | aminoglycoside/multidrug efflux system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/47); new base A (2/2); total (50/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCACCGGGGGTCAGTACCGGTACGGCGATGGATATTATGGAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTCTGGAGTGGACGGCGATGTCGTATCAGGAGCGGCTTTCCGGCGCGCAGGCTCCGGCGCTGTACGCCATTTCCTTGCTGGTGGTATTCCTGTGTCTGGCTGCGTTGTATGAAAGCTGGTCGGTGCCGTTCTCGGTAATGCTGGTCGTGCCGCTGGGGGTAATCGGCGCGCTGCTGGCAACCTGGATGCGCGGGCTGGAAAACGACGT > NC_000913/2589796‑2590360 | aGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCGACCTCACGCTGGGAAACAGGCTCGCCGCGTCTGGAACGCTATAACGGTTATTCTGCGGTTGAGATTGTTGGGGAAGCCGCAcc > 2:217400/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |