New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 1 (0.010) | 81 (1.070) | 54/282 | 0.3 | 98.8% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 | gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 1:781396‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 1:913603‑M1/1‑1 (MQ=255) tgatgtccggcggtgcgtttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgtg > 2:423038‑M1/139‑143 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacttcaaagacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgcc < 1:180806‑M1/10‑1 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATAATGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTCCTCTATTTTGTGCCGggt < 2:809878‑M2/143‑4 (MQ=255) cggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagcaccagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttcgcagcatcaccTTGTCCCGCcac < 2:866574‑M1/12‑2 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:691011‑M2/1‑138 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:956639‑M2/1‑138 (MQ=255) tgtGCTTCGCGCATTGGAGGAATCTAAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGGAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcc > 2:582653‑M2/2‑131 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATACCTATCt < 1:464719‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATAtcg < 1:978085‑M1/21‑2 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt < 1:1001886‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggaggcacagctgatacaaacagaacccactggaccacctcaaacaccacatcatacactaaatcagtcacttggcagcatcaccTTGTGCCGCCACCAAATATCt < 2:237242‑M1/21‑1 (MQ=255) tgtggccgtgacgcaccacccaggcaggagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaagcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt > 1:751330‑M1/123‑143 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaagtt < 2:1101959‑M2/143‑18 (MQ=255) gccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc > 1:1098553‑M1/119‑143 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcattcactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAATAAATCTCTTTtcaca < 2:363560‑M1/28‑3 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATATTTTCATa < 1:398358‑M1/28‑1 (MQ=255) ggacgcgccgacccgggagtggctgaacaggagcgacaggtgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa > 2:269951‑M1/115‑143 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAACTATCTTTTCATAAAATTAg < 2:132180‑M1/35‑1 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGCGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:1258320‑M2/1‑114 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCACAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:365773‑M2/1‑114 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTATATTTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 2:928706‑M2/143‑31 (MQ=255) accccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagagtttggcgcaccccaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa > 1:960795‑M1/106‑143 (MQ=255) taATCTCACACTTATATTTGTGTTGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:205912‑M2/1‑112 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 2:1200807‑M1/40‑1 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 2:1045563‑M1/40‑1 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 1:670827‑M2/1‑110 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:1294420‑M2/143‑37 (MQ=255) cAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:303416‑M2/1‑106 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 1:196065‑M2/1‑104 (MQ=255) tagaTTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa > 2:1174796‑M2/1‑100 (MQ=255) cttaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaacttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGc > 1:266410‑M1/93‑143 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATACCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACCCGGCa < 1:345313‑M1/52‑1 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:802810‑M2/1‑98 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc < 2:164408‑M2/135‑38 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:164408‑M2/1‑98 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAAACGCGGCat < 1:1010049‑M1/53‑1 (MQ=255) ggcaggtgcgcaagctgctagaagcagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 2:916024‑M1/90‑143 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagctcctcaaaaacaccatcatacactaactcagtaagtcggcagtatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCCTATAATTTGCCCGTAAAGACGCGGCatat > 2:1015415‑M1/89‑143 (MQ=255) tGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:1254665‑M2/143‑49 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcagctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTGCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata > 1:243462‑M1/88‑143 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGTAATGTAGGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 2:647817‑M2/1‑91 (MQ=255) gggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt > 1:521156‑M1/83‑143 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTa < 1:319030‑M1/62‑1 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:393386‑M1/80‑143 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:880608‑M1/80‑143 (MQ=255) acagcggatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:225476‑M1/80‑143 (MQ=255) ttgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt > 2:308571‑M2/1‑86 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttcgcagcactatcGTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGACCTCTTTa < 2:465979‑M1/66‑1 (MQ=255) gccgatagactctgaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTac > 1:814422‑M1/77‑143 (MQ=255) ttgAGGTAAGAATAGAGCCTGAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 1:423801‑M2/1‑83 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:1084124‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 2:1037040‑M1/68‑1 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATGGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:259005‑M2/1‑80 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 1:928706‑M2/1‑76 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct < 1:699848‑M2/143‑69 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGAtt < 1:865536‑M1/77‑1 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCAAGAAAAGACGCGACATATAgcactatttacagagctcaat < 2:640194‑M1/77‑10 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGACCTATTTCAACCTATGAttt < 2:41805‑M1/78‑1 (MQ=255) gagagggctaaattcagGTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacgccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 2:321859‑M2/9‑71 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTAAACCGATGATTTCgcag < 2:596168‑M1/83‑1 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGCTGATTTCgcagc < 2:1322239‑M1/84‑1 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 2:389040‑M2/1‑59 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa < 1:1164333‑M2/143‑85 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaagcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt > 1:866574‑M1/51‑143 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGgttc < 1:630991‑M1/95‑2 (MQ=255) aGTTGTGCCATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacga > 2:734351‑M2/1‑56 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:129553‑M1/96‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCTGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa > 2:815500‑M1/47‑143 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactaattgatagtgttttatgttcagataatgccccatgactttgccatgcacctccacccgtattctcaacgaccgcgact < 2:1003817‑M2/143‑96 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatggctccaacttattgatagtgttttatgttcagataaggcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgggaacgacagcgagtt < 1:689011‑M2/143‑97 (MQ=255) actatgatacactaaatccgtaagttggaagcatcgccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATGAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATGTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTg > 2:1092840‑M1/39‑143 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgaatttgagaacgccagcgacgtccga < 2:740394‑M2/143‑101 (MQ=255) ggAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 1:841371‑M2/1‑40 (MQ=255) atacactaattcattaagttggtagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGTAAAGACGTGGCATATAGCCCTATTTACACTGATGATTTCACAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCAt > 2:848901‑M1/33‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 2:480348‑M1/31‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 1:1045563‑M1/31‑143 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTCGCCAGAATAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACAGATGATTTAGCCGCACGTGAGGGTAAAACTTCAGGATTCATGTc < 2:154459‑M1/114‑1 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGACGATTTCGCAGCACGTGAGGTTACAACTTCCTGATTCATGTc < 2:882579‑M1/114‑1 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacggcgacttccgtcccagccgt < 1:374521‑M2/143‑110 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTGTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtt > 1:586476‑M1/25‑143 (MQ=255) aGGAATTCGTAGTTGGTCTTTATTTTGTGCCGtgtcatgtctccatcttattgatagtgttttatgttgagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgc > 2:645417‑M2/1‑32 (MQ=255) ggAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgtctccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagagctacagcgacttccgtcccagccgtgcc > 2:1225606‑M2/1‑31 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcccg < 1:781797‑M2/143‑114 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTa < 1:1177172‑M1/122‑1 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACCACGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCAGATTAATGACTCATTTTATgg < 2:73544‑M1/125‑1 (MQ=255) cAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacattgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgtccggtgc < 1:724275‑M2/143‑119 (MQ=255) aaaaTTGGTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:366285‑M2/1‑24 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 1:28507‑M2/1‑19 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAtt < 1:516096‑M1/132‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactgcaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcattcagctccaccgattgtgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcag > 1:1150238‑M2/1‑17 (MQ=255) gcagcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 1:8180‑M1/9‑143 (MQ=255) catcaccTCGTGCCGCCAATAAATATCTTATCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGGATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCTGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCg > 1:562888‑M1/8‑143 (MQ=255) atcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGCTTCATGTCACATTTTATGTGGAGATTATCGt < 1:794882‑M1/137‑1 (MQ=255) caccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAg < 1:476638‑M1/139‑1 (MQ=255) tttttgGACCGggtaatgactccgacttagtgatagtgttttgtcttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 2:1128262‑M2/2‑11 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc < 1:501162‑M1/141‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCGAGGAATGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCt < 2:158133‑M1/142‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCATTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTACCTGATTCATATCCAAAGAGAGGGGGAGATTAACGTAGGCt < 2:517198‑M1/142‑1 (MQ=255) | GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |