New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3750796 | 89 (1.180) | 5 (0.070) | 5/266 | 10.3 | 5.6% | intergenic (+16/+16) | sgbE/ysaC | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase/pseudogene |
? | NC_000913 | = 3750802 | 84 (1.180) | intergenic (+22/+10) | sgbE/ysaC | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase/pseudogene | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGCGCCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGACAACGTC > NC_000913/3750661‑3750943 | tGCGCCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCCCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTACGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACACCGGGGCTTCATCg > 1:307568/1‑143 (MQ=255) tGCGCCTATAGGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTAATCg < 1:270667/143‑1 (MQ=255) gcgcCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCCGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCgg > 1:214899/1‑142 (MQ=255) gcgcCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCATGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAAATGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGGCGATTACGGGCAGTAATCCCGCACGCCGGGGCATCATCGc > 2:129569/1‑143 (MQ=255) cgcCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGcc < 1:777422/143‑1 (MQ=255) tatGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGAAATACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCa > 1:7287/1‑143 (MQ=255) atGGGTCTATTCTCGCGTCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCAc < 1:497242/143‑1 (MQ=255) gggTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGcccca > 2:616547/1‑139 (MQ=255) ggTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACGTGCGTAAGCCTGGTGCCAATGCCTATGACGGGCAGTAATCCCTCCCGGCGGGGCTTCATCGCCCCGGCAGTAc > 2:584024/1‑143 (MQ=255) ttCGCGCGCCAGCTCGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTg < 1:434720/143‑1 (MQ=255) tctcGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGACCTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTACGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCCCACGCCGGGGCTCCATCGCCCCGGCCCTCCgcctcga > 1:491886/1‑137 (MQ=255) tcgcgcgCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGa < 2:7838/140‑1 (MQ=255) cgcCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGCGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAACTGatagct > 2:176236/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGCTCTGtt > 1:789853/1‑143 (MQ=255) ggCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATACGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCt < 1:1289704/142‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCCTAAGCATGGGCCCAATGCCTATTACGAGCAGTAATCCCTAACGCCAAGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCtt > 1:191503/1‑143 (MQ=255) tGCGCCGCAGCTCCCCGCGATGCACAACGAACTGCTGGAAAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAAGGCCTATGACGGGCAGTAATCCCTCTCTCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCt < 2:409596/143‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTg < 2:379026/143‑1 (MQ=255) gccgcAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCCGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCACAGCACGACGAACTGATAGGATACTTGCTGTa > 2:1024602/1‑143 (MQ=255) ccgcAGCTCCCTGCGATGCAACACGACCGTCGGGACAAGCACTTCCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTaa < 1:890628/143‑1 (MQ=255) cgCTCCGTGCGATGCAAGCTGAACGGCTTGAGAGGCACTACCTGCTGAAGCATGGGGCGAATGCCTATCACGGGAAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTTATCGCCCCGGCACTACTATTTGATATGTTCCTTGCTGTAAcgcc < 2:355393/142‑1 (MQ=255) aGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCACCGCCCCGGCACTACGCATTGCTATGTTCCTTGCCGTACcgcc > 2:292414/1‑143 (MQ=255) gCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAAcgccg < 1:529611/143‑1 (MQ=255) tGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑a > 2:520332/1‑143 (MQ=255) gATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAAc > 2:350313/1‑130 (MQ=255) gATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAAc < 1:350313/130‑1 (MQ=255) gATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCAAATGCCGATTACGGGCCGTAATCCCTCCGGCCGGGGCTTCATCGCCCCGCAACTACGACTAAGTATGGTCCTTACTGTGACGCTGCCTCC‑ACgc > 2:1023115/1‑143 (MQ=255) tGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCCCTACCTGCGTACGCATGCGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGCGCTTACTCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACgctg < 2:974639/143‑1 (MQ=255) gCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGGTGTAACGCCGCTTCC‑AGgctgc > 1:867854/1‑143 (MQ=255) aaaaCGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGctgctg > 2:1253064/1‑143 (MQ=255) aaCGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCAGGGCCTCATCGCCCCGGCACTACGAATGGCTCTGTTCCTTCCTGTAACGCCGCTTCc‑gcgacgcttcc > 1:312316/1‑135 (MQ=255) aCGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATCTGTTCCTTGCCGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTcgcg > 1:715405/1‑143 (MQ=255) agacctgctgGATAAGCGCGACCTGAGCAAGGAGGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTGCAGCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGt < 1:280488/139‑1 (MQ=255) aCTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTaa < 1:1117913/143‑1 (MQ=255) tgctgGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGACTAAATCTGATACGTTCGTTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAAc > 2:272881/1‑143 (MQ=255) tgctgGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGACATGTTCCTTGCTGTCAGGACCCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTacac > 2:516662/1‑143 (MQ=255) gctgGATAAGCCGTACCTGCGGCAGGATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCGCGCCGGGGCTTCATCGCCCCGCCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAAcc < 2:235928/143‑1 (MQ=255) gctgGAGAAGCACTACCGGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATAGGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAAcc < 2:90381/143‑1 (MQ=255) ctgCATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTGCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCa < 2:570029/143‑1 (MQ=255) cgggATAAGCGCTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATGACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCa < 2:203049/141‑1 (MQ=255) tgGATAAGCACTACCGGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAg < 1:220973/143‑1 (MQ=255) aTAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTAt > 2:389846/1‑143 (MQ=255) aGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGtt < 2:686617/143‑1 (MQ=255) aGCACGACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGtt < 2:51101/143‑1 (MQ=255) gCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGttt > 2:1006296/1‑143 (MQ=255) cACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCGGGGGCGCCATAGTCCTGCCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCCGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATCTTTc > 2:466141/1‑143 (MQ=255) ccTACCTGCGTAAGAATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCt < 2:4715/142‑1 (MQ=255) cTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCGTCATCGACCCGGCACTACGAATTGGTATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGCGGTTCAACCCGTCTGTTCCTGaaac > 2:854820/1‑142 (MQ=255) tGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGaaaaa > 1:704282/1‑143 (MQ=255) cGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATc > 1:680201/1‑143 (MQ=255) gTAAGCATGGGGCAAGCGCCTATGACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCt < 2:625193/143‑1 (MQ=255) tAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGACAAATCTg > 2:535750/1‑143 (MQ=255) tAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTg < 1:797543/143‑1 (MQ=255) ggCGAATGCCTATTACGGGCACTAGTCCCTCACGCCTGGACTGCATCGCCCCTGCACTGGGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCGGTGTGTTTCTGGAAAATCTACCGGaaaca > 2:1150553/1‑141 (MQ=255) gCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAAcgcc < 2:857744/87‑1 (MQ=255) gCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAAcgcc > 1:857744/1‑87 (MQ=255) ccAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCCTTAACACAGCAAGTTTCTGAAAAGCACGCCGGAAACAGc > 2:1102394/1‑143 (MQ=255) tGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCGTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAAc < 2:7287/143‑1 (MQ=255) tGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGCCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGTTATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGTTGGCGTTTCACCCATTTGTTTCTTAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAAc < 2:158110/143‑1 (MQ=255) ccTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGATACCTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATCTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGt < 1:667232/143‑1 (MQ=255) cTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAA‑ACCACTACCTACTTTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTc > 1:962433/1‑143 (MQ=255) tATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCa < 1:1003668/143‑1 (MQ=255) tATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCAGCGCCCCGGCACTACGAATTGCTATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCa < 1:87326/143‑1 (MQ=255) gagtgcGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCGGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCa < 2:600902/138‑1 (MQ=255) ttACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGATTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATATGCCGGAAAtgccccccgaaagt > 1:598569/1‑130 (MQ=255) cGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTaaa < 2:1015494/143‑1 (MQ=255) cGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAACTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTGAAACCAGTATGTTTCTGAAAAAGCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTaaa < 2:491886/143‑1 (MQ=255) cGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGCCTTCAGCGCCCCCGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTaaa < 2:211361/143‑1 (MQ=255) ggCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTGTGTTTCTGAAGAATCTGCCGGGAATCGCCAACGTCCTTAAAcc > 1:425711/1‑143 (MQ=255) tAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTAtt < 1:1006296/143‑1 (MQ=255) tAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCCGCACTAGGTATTATTGTCATTCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGCTTCTGAAAAATCTGCCGGAACTAGCCAACGTCATTCAACCGGAtt > 1:251090/1‑143 (MQ=255) aTCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAGCGTCGTTAAACCGTATTGc > 1:741215/1‑143 (MQ=255) cccTCACCCCGGGGCTGCATCGCCCCGGCACTACGACTTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCAt < 1:371330/143‑1 (MQ=255) cctcctgCCGGGGCCTCATCGCCCCGGCACGACGAATTGATATGTTCCTGGCTGTAACGCCGCTGCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATg < 1:1124768/137‑1 (MQ=255) ccTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATg > 1:880002/1‑143 (MQ=255) ccTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTCAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATg > 1:880001/1‑143 (MQ=255) cTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTACACCGCATTGCCTgg > 2:448242/1‑143 (MQ=255) cTCACGCCGGGGCTTCACGGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCGTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATgg < 2:1229276/143‑1 (MQ=255) cACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAg < 1:210429/143‑1 (MQ=255) cACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAg < 2:887190/143‑1 (MQ=255) cGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCa > 1:680713/1‑143 (MQ=255) cGCCGGCGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCa < 1:725795/143‑1 (MQ=255) gccgcttcTTCATCTCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCCGAAAAATCTGCCGGAAACAGCCACCGCCACTACACCGTCATGCACGGAGCAg > 2:878847/8‑143 (MQ=255) ccGGGGCTTCATCGCCCCTGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGGTGTAGCACCGCAGCC‑ACGCTCCCGATGTCAAGCCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAgg < 2:277691/143‑1 (MQ=255) cGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCCTGGAGCGGGc > 1:577907/1‑143 (MQ=255) ggCGTCATCGCCCCGGCACTACGAGTTGTTAGGTGCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGa < 2:507594/143‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGCCTCGGCACTACTAATGGTTATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGAc < 2:463523/143‑1 (MQ=255) gCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGAc < 2:680201/143‑1 (MQ=255) tCGTCCCGGCACTACGAATTGATATTTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGACAACGTc < 2:950621/143‑1 (MQ=255) tCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACTGTATTGCATGGAACAGGCCGAAAACGTc > 1:812459/1‑143 (MQ=255) | TGCGCCTATATGGGTCTATTCTCGCGCCAGCTTGCGCCGCAGCTCCCTGCGATGCAAAACGAACTGCTGGATAAGCACTACCTGCGTAAGCATGGGGCCAATGCCTATTACGGGCAGTAATCCCTCACGCCGGGGCTTCATCGCCCCGGCACTACGAATTGATATGTTCCTTGCTGTAACGCCGCTTCC‑ACGCTGCTGGCGTTAAACCAGTATGTTTCTGAAAAATCTGCCGGAAATAGCCAACGTCATTAAACCGTATTGCATGGAGCAGGCCGACAACGTC > NC_000913/3750661‑3750943 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |