New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 732888 = | 38 (0.760) | 4 (0.080) | 4/274 | 7.0 | 9.8% | coding (3306/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | 3622465 = | NA (NA) | coding (3275/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCT > NC_000913/3622324‑3622561 | aGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGCAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGCGGCAGTGGGGTGTTCccg > 1:533342/1‑143 (MQ=255) aGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCCGGGAGGCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccg > 2:365677/1‑143 (MQ=14) aGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGCAGCCGCTGGCAGTGTGGTGATCacg > 2:573811/1‑143 (MQ=11) cGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgccg < 2:605792/143‑1 (MQ=38) cGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgccg < 1:387354/143‑1 (MQ=38) aTTTATCAGCCGGGGAGCGTCACGCGAAGATTCATTGTCGACACTGGCACCGGTGAGCTGGCGCAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCACCAGTCCGGCGGCGAAGCCGGTGGCAGAGTGGGGGTCccgccgcg > 1:628990/1‑141 (MQ=11) gcgcAGCGGGGGGGCTTCACGCCACTCATCGGGGTCGAAACTGCCCCCGGTGAGCTTGCGAAAACGCGGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCt < 1:9691/140‑1 (MQ=11) aGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCCGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGGGCAGACGGGGGCAGTGCGGAGCGCCCGCCGGTGCTgcgg > 1:228947/1‑140 (MQ=11) ccGGGCAGCGTCACGCCACTCGTCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCa < 2:291880/143‑1 (MQ=255) cGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGGGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAg > 1:320407/1‑143 (MQ=38) gAGCTGCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc < 1:694763/143‑1 (MQ=38) cTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGCCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGAGCTGGTGCAGATGCTCg > 2:274509/1‑143 (MQ=255) ttCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGa < 2:708001/143‑1 (MQ=38) ttCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGAAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGGCGTGTGGTGTTCGCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGa > 1:682507/1‑143 (MQ=255) ttCACGCCACTCATCAGGGTCCAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGCGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCCGATGCTCgc > 1:109428/1‑142 (MQ=255) tCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGAc < 2:28033/143‑1 (MQ=38) tCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGAc > 2:261088/1‑143 (MQ=39) ccACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGCTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGCGGGGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCt > 2:140786/1‑143 (MQ=255) tcatcaGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCGTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTggga > 1:426135/1‑141 (MQ=255) catctGGGTGGAAACTGTCATCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCTGCAGACTGGCGGATGCCCTGCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGa‑‑aa < 2:446726/143‑1 (MQ=11) atcaGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGGGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAg > 2:773190/1‑143 (MQ=38) tcaGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGt > 2:267722/1‑143 (MQ=38) tcaGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGt > 2:67704/1‑143 (MQ=39) aGGGTCGAAACGGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGa < 2:592808/143‑1 (MQ=25) ggTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGaaa < 2:307823/143‑1 (MQ=37) aaaCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTg < 1:230839/143‑1 (MQ=34) tGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑CGGTGAAACCCTGGCTg > 1:872592/1‑143 (MQ=16) ccGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCgg < 2:350593/143‑1 (MQ=32) aGCTGGCGAAAAGGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCTGATGCTCGTCCG‑‑TGGATTAATTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagt < 1:722199/143‑1 (MQ=11) gtGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagtga < 2:45352/142‑1 (MQ=17) cgggCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagtga < 2:541868/141‑1 (MQ=17) cTGGCGAAGACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTGAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTGCGCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagtga < 1:639658/143‑1 (MQ=255) gAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGaaa > 2:269652/1‑143 (MQ=32) aaaCGCCGCGCCGCAGCCCGGCGGACGCCCGTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAgc < 2:430090/143‑1 (MQ=255) gccgcAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCACGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctgg > 1:829366/1‑143 (MQ=17) cAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGctggctgg < 1:269652/143‑1 (MQ=32) tGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCGGGTGACGCCGCAGAGTCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGGTGGCATCg > 2:789675/1‑143 (MQ=11) tGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGACGGTGCTGGTGCAGCTGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGCGAGTGCGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCg > 2:169595/1‑143 (MQ=255) cGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACGGGGCGGGTGAGGAAAGCCGCCGCAGGCGGGCAACGtac > 1:265360/1‑141 (MQ=11) aTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGc > 2:648280/1‑143 (MQ=32) gCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGACAGCCGCCGCCGGCTGGCAGCGTGCGGcgg > 1:777276/1‑141 (MQ=2) | AGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGA‑‑AAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCT > NC_000913/3622324‑3622561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |