| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,555,586 | T→C | 3.0% | E47E (GAA→GAG) | eutK ← | putative ethanol utilization carboxysome structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,555,586 | 0 | T | C | 3.0% | 462.4 / 2.8 | 132 | E47E (GAA→GAG) | eutK | putative ethanol utilization carboxysome structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/80); new base C (2/2); total (49/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTCATTCCCTGACGTACTGATGTTAACAGCGCCAACAACTCGTCAGCAGATTCCGCGACGATAACTGGCGCGTCGGGTTCCCTTACGGGTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGCCGACCGATCTCCTTGCGGCTGATGACACGCCCGGTACGCATCGCGGCAGCACAACCTGCGTCCAGCGCCGCACGACACGCCGCCAGATCGCCTTCCACCACCAGCGTTAAGCGACCAGGGTCAAGCACTTCGTGACTGAGCAGACGAACGTTAGCTGCTTTGAGCATGGCATCCGCTGCATCTATCGCGGCGACCATGCCGTCCACTTCCAGCAATCCCAGTGCATTGATCATCGGCAACCTCCGTTACGCACGCTGGATTGGATTACGCGCGATTTCCAGCACTGCATCGGTAAAGGCGTTACAGGCTGCTTTACACGCTGCCTGGCTACCGGTTAAAAATGCTGCCGAGTAGTTGGTTTCAGACGGTGGCGGGACATAG > NC_000913/2555299‑2555874 | tttCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTCATTCCCTGACGTACTGATGTTAACAGCGCCAACAACTCGTCAGCAGATTCCGCGACGATAACTGGCGCGTCGGGTTCCCTTACGGGTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCCTCGTCTGGCCGACCGATCTCCTTGCGGCTGATGACACGCCCGGTACGCATCGCGGCAGCCCAACCTGCGTCCAGCCCCGCCCGCCACGCCCCCAGCTCGCCt > 2:724241/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |