New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4102352 = | 87 (0.910) | coding (664/984 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCGGCGATGGATATGACCAATGGCGGACTTTACGCTTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGAAATGGTGCCTGCGTTTAAACCGATGGCTCCGGCAGCAACTTCGCTGGTAGCGACGGCGGTCATTGTGACTTCGATTCTGGTGCCAATTCT > NC_000913/4102033‑4102602 | gggggcgATGGATATGACCAATGGGGGACTTTACGCTTCCACCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGATTTGCCCTGGAGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTggg < 1:738361/285‑1 (MQ=255) ggcgATGGATATGACCAATGGCGGACTTTACGCTTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCaa < 1:138373/288‑1 (MQ=255) ggcgATGGATATGACCAATGGCGGACTTTACGCTTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCaa < 2:149497/288‑1 (MQ=255) ggcgATGGATATGACCAATGGCGGACTTTACGCTTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCaa < 1:86949/288‑1 (MQ=255) tttgactttacgtgaccagatagaggtaagaattggcaccagaatcgaagtcacaatgaccgccgtcgctaccagcgaagttgctgccggagccatcggtttaaacgcaggcaccatttctgcaatcagcacaggtgtcgctaccgcggcccctgcggaactggaagcggcaattccggcagtgccatcgccaccgccaatcaatttatcggcgataatcaacggaataccggtcacgataattactgccacacccaacaggatccccagcaaaccagtCTGGGCAAt > 2:828000‑M1/280‑288 (MQ=255) tttgactttacgtgaccagatagaggtaagaattggcaccagaatcgaagtcacaatgaccgccgtcgctacaagcgaagttgctgccggagccatcggtttaaacgcaggcaccatttctgcaatcagcacaggtgtcgctaccgcggcccctgcggaactggaagcggcaattccggcagtgccatcgccaccgccaatcaatttatcggcgataatcaacggaataccggtcacgataattactgccacacccaacaggatccccagcaaaccagtCTGGGCAAt > 2:238043‑M1/280‑288 (MQ=255) tatGTCCAACTGCTGACGTTACGCTTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAATCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCTGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGAt < 2:736841/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |