| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3774235 = | NA (NA) | 4 (0.090) +GATTTTGCGTTTGTCATCAGACTT |
4/234 | 6.5 | NA | noncoding (1/99 nt) | RIP271 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP271 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences and 1 IHF site |
| ? | NC_000913 | = 4470517 | NA (NA) | intergenic (+195/+11) | mgtA/ridA | magnesium transporter/enamine/imine deaminase, reaction intermediate detoxification | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAG > NC_000913/3774094‑3774375 | cAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCAGACACCACCAGAGTGGATGAAGAGCGGGAACTGCTGGCAGGTAGCAACTAGTGCAATCCAACCCACTACACATGGAGAAGGTGGGGTGAACTGc > 2:292437/1‑143 (MQ=255) ccTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTCACTTGCATg > 2:643915/1‑143 (MQ=255) tGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGACGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGCGGGGTTACTCGCCCGAt > 2:868630/1‑143 (MQ=255) cAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATgcgc > 2:461501/1‑143 (MQ=255) cAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCCCTCCACATGGAGACGGTGGGGTTAACTGCCTGATgcgc > 2:629773/1‑143 (MQ=255) aTGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACTCACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAATTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTa < 1:488015/143‑1 (MQ=255) gCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACg < 1:454650/143‑1 (MQ=255) gatgatGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGAGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTAGCAGGTCGTGAGTACTACAATCCCACCCTGTCCACACGGAGAAGGTGGGGTGCATTGCCTGCTccgcagaccttacc > 2:826293/1‑133 (MQ=255) atgaGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGGACTGCTGGCAGGGCGTAAGTAAGCCAGTCCCACCCTCTCCACATGGGGCAGGTGGGGGTAATGGCGTGATGCGCGACGGCGATCAGGc > 2:464110/1‑143 (MQ=255) atgaGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTAGTGCGCTACGCTTATCAGGc > 1:613239/1‑143 (MQ=255) atgaGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAAACGCTGTCAGGTCGTAAGTCATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGCAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCCGGc > 1:431332/1‑143 (MQ=255) ttCCGTCTTCGATCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCCGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCCCCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:28429/142‑1 (MQ=255) cGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAgg > 1:396082/1‑143 (MQ=255) gTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTCTCAGGCCTACAGGa > 1:648950/1‑143 (MQ=255) gTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGa > 2:566071/1‑143 (MQ=255) tCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGCTGCa > 2:453542/1‑143 (MQ=255) tGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGCAGGTGGGGGTAATTGCCTGATGCGCCACGCTTATCAGGCCTGCCGGCTGCATCACAAtgt > 2:843398/1‑141 (MQ=255) ggCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGGCGTAAGTAATCCAATCCCCCCCTCTCCACAGGGAGGAGGGGGGGTTAAGTGCCCGAGGCGCGACGCTTATCAGGGCTACACGATGCATCACAGttgg > 1:241974/1‑141 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt < 2:396082/143‑1 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt > 1:633052/1‑143 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt < 1:796829/143‑1 (MQ=255) cactcaCCGTCAGCGTGGATGGAGTTCTGGCACTGGTGGCAGGTCGTGTGTAATCCTATCCCACCCTCTCCACATTGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgtt < 2:831275/143‑1 (MQ=37) cacacaCCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCAGCTCCACATGGCGCCGGGGGGGTTAATTGCCTGCTGCGCTACGCTTATCAAGCCTACAGGCTGCATGACGAttgttg > 2:882586/1‑139 (MQ=255) caGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCAAATCCTAACCTCTCTATGTTGAGATAGTGGGGATAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATGACAATTTGTTGAAATTGCAc > 1:476080/1‑143 (MQ=37) gCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGt > 1:78075/1‑143 (MQ=255) gCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTCGTTGAATTTGCACGt > 2:387093/1‑143 (MQ=255) gTGGATGAACGGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTTATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTc < 2:212106/143‑1 (MQ=255) gTGGACGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTGAGTAATCCAATCCCAGCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTTATGTGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTc < 2:568998/143‑1 (MQ=255) ggATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGCATTTGCGCGTTCtt > 1:536018/1‑143 (MQ=255) tGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGGATTTGCACGTTCTTGTa > 2:250586/1‑143 (MQ=255) gTGCGGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGcc < 2:901558/143‑1 (MQ=255) tGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCg > 2:510496/1‑143 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGa > 2:513285/1‑143 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAACCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGa < 1:135732/143‑1 (MQ=255) agtgctgGGCGGTGGGAAGTAATCCAATCCCACCCTCGCCACATGGAGAAGGGGGGGGTAATTGCCTGAGGCGCTACGCTTATCAGGCGTACAGGATGCAGCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAgg < 2:748109/141‑1 (MQ=37) aCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAgg > 1:73668/1‑143 (MQ=255) tgctgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGgcg > 1:265751/1‑143 (MQ=255) ggTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgcc < 1:282977/143‑1 (MQ=255) gcgcggaagtaaTCCAATCCCCCCCGCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGGTGCGCTACGCTTATCAGGCCTCCAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgcc < 1:691759/137‑1 (MQ=37) tCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgc > 1:534753/1‑143 (MQ=255) tCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgc > 1:350742/1‑143 (MQ=255) gtaagtcaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAGTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAGAAGGCGCTTACGCCGCAt < 1:316869/143‑1 (MQ=255) gtaagtaaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCAt < 1:565348/143‑1 (MQ=255) gtaagtaaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCAt > 1:560608/1‑143 (MQ=255) gtaagcaaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCAt > 2:775502/1‑143 (MQ=255) taagtaaTCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGCCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATc > 2:469015/1‑143 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACACTATGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCcgccgcc > 2:90571/1‑142 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 1:827043/1‑143 (MQ=255) tccaatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 1:126985/1‑143 (MQ=255) aatccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGCAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGGTCTTGTAGGCCGGAGACGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGca > 1:676968/1‑142 (MQ=255) atccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGCTGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGccc > 2:283473/1‑143 (MQ=255) atccCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGccc < 2:78075/143‑1 (MQ=255) ccACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCGCctc > 1:389424/1‑143 (MQ=25) ccACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCGTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctc > 2:31647/1‑143 (MQ=25) ccACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGATAGGATTAGCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctc > 1:352788/1‑143 (MQ=37) ccTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctcct < 1:775502/143‑1 (MQ=255) tctcCACGTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCGTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAGTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCa < 1:115007/143‑1 (MQ=255) ctcCATATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCAc < 1:643915/143‑1 (MQ=255) cacgTGGGGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAGTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGga < 2:400557/143‑1 (MQ=255) caTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGgaga < 1:112193/143‑1 (MQ=255) caTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGgaga < 2:160196/143‑1 (MQ=255) caTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGgaga < 2:748574/143‑1 (MQ=255) aTGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGgagaa > 2:117013/1‑142 (MQ=255) gtagaCGGTGGGGTTAATTGCCCGATGCGCTCCGCTTATCAGGCCGACAGGATGCATCACAATTTGTTGAACTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCGTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctccgtgaggagaggg < 2:789497/141‑13 (MQ=21) ggggaAGGGGGGGTTAATGGCCTGATGCGCTACGCGTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAggg < 1:236843/140‑1 (MQ=255) ggAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGTTTATCTTGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAggg < 1:387093/143‑1 (MQ=255) ggAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGTAGAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCCCCCGGAGCggt > 2:556859/1‑142 (MQ=37) agagGGTGTGGTTAATTGCGTGCTGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACAGGAGGCGTCAAAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTGGTATGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCAGCCCCTCGCCGTGAGGAGAggggc < 2:128697/143‑3 (MQ=18) aGGTGGGGTTGAGTGCCGGCTGCGCTCCGCTTATCAGGACTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCGCCTCACGGAGAGGGTTTgg < 1:235459/143‑1 (MQ=37) ggTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTggg < 1:566071/143‑1 (MQ=255) gTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCACATTCTTATCAGCCCCGCTCCTCACGGAGCGGGTTTGCGt > 1:879921/1‑143 (MQ=25) gTGGGATTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGTCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCCCGGAGAGGGTTTGGGt > 2:775972/1‑143 (MQ=255) tGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGCGGGCTTcgggg > 2:648511/1‑141 (MQ=255) gTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACACTTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATACGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGCGGGTTTGGGTGAggg > 2:827021/1‑143 (MQ=255) gTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAggg > 1:900049/1‑143 (MQ=255) aaTTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGaaa > 1:63614/1‑143 (MQ=255) gtGCCTGAGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAg < 2:488736/142‑1 (MQ=255) | CAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAG > NC_000913/3774094‑3774375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |