| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 50 (0.950) | 42/282 | 0.2 | 100% | intergenic (+9/‑768) | crl/crl | pseudogene, sigma factor‑binding protein, RNA polymerase holoenzyme formation stimulator,regulator, Surface structures, transcriptional regulator of cryptic csgA gene for curli surface fibers/pseudogene, sigma factor‑binding protein, RNA polymerase holoenzyme formation stimulator,regulator, Surface structures, transcriptional regulator of cryptic csgA gene for curli surface fibers |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCG > NC_000913/1292899‑1293167 | cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgg < 2:492109‑M2/143‑3 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccaccatacactaaatcagtaagttggcagcagcaccTTCTgccgcc < 1:297260‑M1/10‑1 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaat > 1:508186‑M2/1‑137 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 1:308097‑M2/1‑135 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTACTTTGAACACGACTA‑TGGGGGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATGCAGTTGGGCACTAGCCAGGAATGTAGTGAATTCAAAATTGGTCTTTATTTTATgccgggtaatgac > 2:287280/1‑134 (MQ=255) aaGTGCGTCGGTGATTGTAGTAATCTCGA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactc > 2:868230‑M2/1‑132 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGACAATAAATATCtt < 2:515341‑M1/22‑1 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:175581‑M1/121‑143 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaact < 2:133551‑M2/143‑17 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactt < 1:692930‑M2/143‑18 (MQ=255) tCGTTCTTCGTAGTAAGTTCAA‑ACGTATATTTGTGTGGTTTGTTGAGCTAATACTAGAGCCTTACATTCCGTTGTGCGATAGCCAGGAAGGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactta > 2:640116‑M2/1‑125 (MQ=255) cgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctaaacgcatcagaatccactggagctcctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCAt > 1:884603‑M1/117‑143 (MQ=255) ttaggcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa < 1:933322‑M1/29‑1 (MQ=255) gatTGTAGTCATCTCAT‑ACTTATATTGGTGTTGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGTCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTCAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatttctccaacttatttat > 2:336967‑M2/2‑120 (MQ=255) aggcaacaccccgtcagaagcgtaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa > 1:246263‑M1/113‑143 (MQ=255) tagtaATCTCAA‑ACTTTTATTGGGGTGGTTTGTTGAGTTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 2:587788‑M2/1‑115 (MQ=255) tagtaATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 2:625568‑M2/1‑115 (MQ=255) tagtaATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTCTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgagagtgt < 1:180363‑M2/143‑29 (MQ=255) taATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 2:496599‑M2/143‑32 (MQ=255) ctcAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGATGTGCAATAGCCAGAAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgt < 1:483081‑M2/143‑36 (MQ=255) tcAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtagtgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:130740‑M2/143‑37 (MQ=255) tcAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:671966‑M2/143‑37 (MQ=255) aa‑aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTTAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTGCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagagttttatgttca < 2:240902‑M2/143‑39 (MQ=255) a‑aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 1:103954‑M2/1‑104 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATCTCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc < 1:50679‑M1/48‑1 (MQ=255) agttatAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTGTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:303328‑M2/3‑103 (MQ=255) cTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat < 1:323938‑M2/143‑42 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata < 1:495656‑M2/143‑43 (MQ=255) tgtgtgcggtctggacggcggatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg > 2:143550‑M1/94‑143 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAATGTTAGCCAGAGAAGACGCGGc < 1:541359‑M1/51‑1 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAACGACGCGGCa < 2:245441‑M1/52‑1 (MQ=255) atatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:614342‑M2/1‑99 (MQ=255) ttttggGGTGGTTTGTTGCGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 2:1573‑M2/3‑98 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat > 2:458514‑M1/91‑143 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata > 1:742373‑M1/88‑143 (MQ=255) ggtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:383835‑M2/1‑92 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATACATATCTTTTCATAAAATTCGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:746850‑M1/59‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:316253‑M1/59‑1 (MQ=255) cagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAagagacgcggcataccgaccttttt > 2:870856‑M1/79‑132 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGACAAGACGCGGCATATCGCCctatttctc < 2:177077‑M1/68‑4 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:670315‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 1:567798‑M1/69‑1 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCTTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATGCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 1:519928‑M2/1‑79 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaccaccaacatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat > 1:171379‑M1/71‑143 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtgatgactccaacttcttgacagtgttcgaggctccgataatccccgatgactttgtcatgcag < 1:759‑M2/143‑67 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATCTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag > 2:635776‑M2/1‑77 (MQ=255) gagacaggagccactggcgcacctcaaaaacacgatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcgccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatg > 2:929580‑M1/70‑143 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAACGACGCGGCATATAGCCCTATTCacaccgacaatt < 2:583944‑M1/77‑6 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTAGAACGATGAtt < 2:493936‑M1/77‑1 (MQ=255) ataGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATATCCAGGAAGGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:722430‑M2/1‑72 (MQ=255) ataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:496599‑M2/1‑72 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgttagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 1:9263‑M2/1‑71 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTAAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtgcggataatgcccgctgactgtgtcatgagcctccac < 2:453951‑M2/143‑73 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGAGGATTTCg < 1:34037‑M1/80‑1 (MQ=255) cgcgtctttaaTTCAGTTTTGCAATCGCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatggaggtccacc > 2:149719‑M2/6‑70 (MQ=255) agagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacc < 2:910676‑M2/143‑74 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgca > 1:363664‑M1/62‑143 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcag < 2:370197‑M1/83‑1 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGCATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat < 1:197364‑M2/143‑77 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat > 1:440170‑M2/1‑67 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTCTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGTCTTTATTTTGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat > 1:467885‑M2/1‑67 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagca < 2:839390‑M1/85‑1 (MQ=255) actggagcacctgaaaaacaccatcgtacactagatcagtaagtgggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAc > 1:315131‑M1/58‑143 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAc > 1:682261‑M1/58‑143 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGACAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:78201‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 2:109531‑M2/1‑62 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAgg < 1:146263‑M1/92‑1 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac < 1:93138‑M2/143‑89 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:400003‑M1/96‑1 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatacagcgccaccgattttgagaacgaca < 2:853920‑M2/143‑90 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCGAATAAAAATCTTTTCGTAAAATAAGCCAGAAAAGACCCGGCGTAGAGCCCTATTTACACCGATGCTTTCGCAGCccgtgagagtgaa < 1:728184‑M1/97‑7 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa > 1:806934‑M1/47‑143 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTAACCCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa < 1:862295‑M1/97‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaacTTGTGCGGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa < 1:177316‑M1/97‑1 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAACATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagggttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:870521‑M2/1‑52 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAAc < 1:129271‑M1/99‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGAAGCGCGTGAGTGTAAAAc < 2:223641‑M1/99‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttgccagcaacacaTTGTGCCGGCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGTCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAAc < 1:393873‑M1/99‑1 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGCTAAAACTTCCt < 2:168591‑M1/104‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAActtcgtg < 1:165832‑M1/105‑4 (MQ=255) accagcatacaccaacacagtaagttgccagcatcaccTCGTGACGCCAATAAACATCTTTTCATAAAATTAGCCTGAAACGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAACCTTCCTg > 1:10721‑M1/39‑143 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgccactccaccgatattgaggacgacagcgacttccgtcc < 2:694237‑M2/143‑103 (MQ=255) ggggtggtagggattcaAATTGGGTCTGTATTGTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 2:322880‑M2/9‑40 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAACCTTCCTCATTCATGTca < 1:120278‑M1/115‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 2:646947‑M1/29‑132 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt < 1:646947‑M1/104‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtt < 1:300261‑M1/119‑1 (MQ=255) agcagtagggtggcaggatcaccGTGTGACGGCAGTAAATATCTGTTCAGAAAATTAGCCAGAAAAGACGGGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAttt > 2:367271‑M1/24‑143 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTa > 1:473649‑M1/22‑143 (MQ=255) aaTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccag > 1:570781‑M2/1‑29 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgctgggtgct < 1:114278‑M2/143‑120 (MQ=255) ttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAACTTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgag < 2:86445‑M1/129‑1 (MQ=255) aaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgc > 1:467618‑M2/1‑22 (MQ=255) tGTTCTGTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 2:346699‑M2/1‑19 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGCAGAtt < 1:713240‑M1/132‑1 (MQ=255) gTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttcgtcctgcagcgccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca > 2:613724‑M2/1‑18 (MQ=255) cagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAgatca < 1:527592‑M1/133‑3 (MQ=255) gcatctccTTGTGCCACTACTAAATATCTTTTCATAAAATTATCTTGAAAAGATGCCACAAATAGCCCTATGTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAATCTTCCTGATTTATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 2:810987‑M1/9‑143 (MQ=255) gcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 2:178016‑M1/9‑143 (MQ=255) catcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAACACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCg < 1:303559‑M1/136‑1 (MQ=255) | CAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAA‑ACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCG > NC_000913/1292899‑1293167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |