| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,994,992 | Δ3,877 bp | [ygeL]–ygeQ | [ygeL], ygeN, ygeO, insD‑4, insC‑4, ygeP, ygeQ | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2994992 | 2998868 | 3877 | 140 [0] | [0] 140 | [ygeL]–ygeQ | [ygeL],ygeN,ygeO,insD‑4,insC‑4,ygeP,ygeQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2994991 | 0 (0.000) | 135 (1.980) | 41/64 | 0.0 | 100% | pseudogene (102/156 nt) | ygeL | protein YgeL |
| ? | NC_000913 | 2998869 = | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+115) | ygeQ/glyU | protein YgeQ/tRNA‑Gly | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CACTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2994956‑2994991‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAC > NC_000913/2998869‑2998902 CACTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCC < 1:4783414/35‑1CACTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCC < 1:3083803/35‑1 CTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCA < 1:4899253/35‑1 CCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACT < 1:494417/35‑1 CCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACT < 1:5098307/35‑1 CCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACT < 1:3639995/35‑1 CCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACT < 1:6153745/35‑1 CCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACT < 1:2840437/35‑1 CGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTT < 1:6690401/35‑1 GCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTA < 1:4521451/35‑1 GCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTA < 1:3587212/35‑1 CTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTAT < 1:4867160/35‑1 CTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTAT < 1:4809517/35‑1 CTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTAT < 1:1257430/35‑1 CTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTAT < 1:6374220/35‑1 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1:1805704/35‑1 TTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAAC < 1:4859501/35‑1 TTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAAC < 1:427320/35‑1 TTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAAC < 1:1011515/35‑1 TCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACT > 1:6000655/1‑35 TCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACT > 1:2602382/1‑35 CTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTT < 1:5502308/35‑1 TTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTG > 1:4234461/1‑35 TTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTG > 1:1342648/1‑35 TCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGA < 1:4994544/35‑1 TCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGA < 1:5903756/35‑1 CAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAA < 1:4049099/35‑1 CAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAA < 1:7490125/35‑1 CAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAA > 1:6700830/1‑35 CAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAA < 1:6678453/35‑1 CAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAA > 1:5833722/1‑35 AGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAA > 1:1896658/1‑35 GATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAA < 1:2028544/35‑1 GATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAA < 1:7035047/35‑1 ATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAAT > 1:5325885/1‑35 TCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATA < 1:2082252/35‑1 CTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAg > 1:2570949/1‑34 TTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAG > 1:4882188/1‑35 TTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAG > 1:6829613/1‑35 TTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGG < 1:2313125/35‑1 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:608652/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:6985368/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:6136800/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:6210019/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:2117950/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:3942323/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:2690602/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:2816285/1‑35 TATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGT > 1:3471150/1‑35 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG < 1:1079048/35‑1 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG > 1:7890652/1‑35 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG > 1:624844/1‑35 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG > 1:5906666/1‑35 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG > 1:3030298/1‑35 ATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTG > 1:7395860/1‑35 TAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGT < 1:5086791/35‑1 TAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGT < 1:1508150/35‑1 TAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGT > 1:255549/1‑35 TAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGT < 1:5082556/35‑1 TAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGT < 1:7116164/35‑1 AGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTT < 1:7283291/35‑1 AGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTT < 1:1134043/35‑1 AGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTT < 1:7305635/35‑1 AGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTT > 1:4380979/1‑35 AGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTT < 1:7283379/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:743147/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT > 1:7148037/1‑35 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:808126/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:5484566/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:3940496/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:3783943/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:3082230/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:2426395/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:2394455/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:2041921/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:1198844/35‑1 GCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTT < 1:1016164/35‑1 CCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTT < 1:4425473/35‑1 CCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTA < 1:5327900/35‑1 CCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTA < 1:3862314/35‑1 CACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAC < 1:6923740/35‑1 CACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAC < 1:4019376/35‑1 CACTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2994956‑2994991‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAC > NC_000913/2998869‑2998902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |