Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3888426 | 3906639 | 18214 | 40 [36] | [37] 40 | tnaC–bglG | tnaC,tnaA,tnaB,mdtL,yidZ,yieE,yieF,adeP,yieH,cbrB,cbrC,yieK,yieL,bglH,bglB,bglF,bglG |
AAAAAACCCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACAT > NC_000913/3906591‑3906689 | ataagtgcCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGc < 1:853724‑M2/42‑1 (MQ=255) ataagtgcCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGc < 1:2336481‑M2/42‑1 (MQ=255) taagtgcCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCg < 1:1036936‑M2/43‑1 (MQ=255) taagtgcCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCg < 1:3181115‑M2/43‑1 (MQ=255) cGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAg < 1:1834560/50‑1 (MQ=255) cGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAg > 1:5546144/1‑50 (MQ=255) gACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGt < 1:4932458/50‑1 (MQ=255) gACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGt < 1:6097063/50‑1 (MQ=255) ttCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTaa > 1:4575561/1‑49 (MQ=255) cACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACa < 1:4164917/49‑1 (MQ=255) cACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACa < 1:5413512/49‑1 (MQ=255) aCCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAAt < 1:3993480/50‑1 (MQ=255) gTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAg > 1:2203315/1‑50 (MQ=255) gTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAg > 1:57239/1‑50 (MQ=255) tctcTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCAt > 1:41416/1‑50 (MQ=255) tGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCAttt < 1:129072/48‑1 (MQ=255) tGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCAtt < 1:327434/47‑1 (MQ=255) tGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCAtt < 1:1786032/47‑1 (MQ=255) tGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATttat > 1:2144216/1‑50 (MQ=255) gTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATttatta < 1:5900387/50‑1 (MQ=255) gTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATttatt > 1:2952052/1‑49 (MQ=255) gTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATttatt < 1:2981328/49‑1 (MQ=255) gTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATtta < 1:5661569/47‑1 (MQ=255) tGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATgg < 1:1291840/50‑1 (MQ=255) gTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGt > 1:6349312/1‑50 (MQ=255) cAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGttt > 1:6222547/1‑50 (MQ=255) gTTTTGCGTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTta < 1:2596014/50‑1 (MQ=255) ttttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTtat < 1:868655/50‑1 (MQ=255) tttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTtat > 1:28483/1‑49 (MQ=255) tttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTtat > 1:1819705/1‑49 (MQ=255) ttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTtata < 1:1748410/49‑1 (MQ=255) ttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATaa > 1:1457924/1‑50 (MQ=255) tGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAAc > 1:2949476/1‑50 (MQ=255) gCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAAc > 1:3667588/1‑49 (MQ=255) cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGaa < 1:3504261/50‑1 (MQ=255) cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGaa > 1:2729370/1‑50 (MQ=255) cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGaa > 1:2679464/1‑50 (MQ=255) cGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAAc < 1:3536331/48‑1 (MQ=255) cGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACAt > 1:5879858/1‑50 (MQ=255) cGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGATTTTATAACGAACa < 1:3555120/49‑1 (MQ=255) | AAAAAACCCGACTTCACCAGTATTCTCTGGTTATGTCAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACAT > NC_000913/3906591‑3906689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |