| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 99 [0] | [0] 99 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 93 (1.330) | 54/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:952901‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:279173‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:2217146‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:2876478‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg < 1:1128239‑M1/49‑2 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg < 1:2011784‑M1/49‑2 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:662496‑M1/1‑47 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:51467‑M1/1‑47 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:3841285‑M1/1‑47 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:367277‑M1/1‑46 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:922311‑M1/49‑5 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:53621‑M1/49‑5 (MQ=255) tAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc > 1:2716125‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:2232490‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc < 1:949079‑M1/48‑7 (MQ=255) aaTGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc < 1:1227209‑M1/50‑10 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc > 1:4461710‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc > 1:5206246‑M1/1‑41 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg < 1:2118372‑M1/50‑11 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 1:2360869‑M1/1‑40 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcat < 1:4271855‑M1/50‑14 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcat < 1:4587944‑M1/50‑14 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:3612049‑M1/1‑37 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:400603‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:3897831‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:5335760‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:959940‑M1/1‑36 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:4027197‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat > 1:4619158‑M1/1‑35 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat > 1:3258137‑M1/1‑35 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatc > 1:4594308‑M1/1‑34 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:3200261‑M1/50‑18 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:3382303‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:2722801‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:2727834‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:2790782‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:3601788‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:3010267‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg > 1:2821911‑M1/1‑31 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 1:3251048‑M1/50‑20 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:1909902‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:730725‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:2451448‑M1/1‑30 (MQ=255) gagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttg < 1:4690993‑M1/50‑23 (MQ=255) gagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttg < 1:2118724‑M1/50‑23 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:1469358‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:285896‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt < 1:1605471‑M1/50‑24 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:3088791‑M1/50‑25 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:2210567‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:4866691‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:3398284‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:704945‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:4549757‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:2132020‑M1/50‑28 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:1870182‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:5426636‑M1/50‑28 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:2602010‑M1/1‑23 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:2720110‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3518341‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:266258‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:1794171‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 1:4927667‑M1/50‑30 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:2470517‑M1/1‑21 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:1533426‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:1670627‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:4345560‑M1/1‑19 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:431327‑M1/50‑32 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:2115670‑M1/50‑32 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:376509‑M1/1‑18 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga > 1:793752‑M1/1‑17 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga > 1:478272‑M1/1‑17 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga > 1:5108175‑M1/1‑17 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:2121422‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:2977756‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat < 1:20343‑M1/49‑35 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 1:3241344‑M1/50‑37 (MQ=255) tGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg > 1:4420659‑M1/1‑13 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:2744024‑M1/1‑12 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:4815671‑M1/1‑12 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:1180225‑M1/1‑12 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatctggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:843882‑M1/50‑40 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 1:2639683‑M1/50‑41 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 1:5056371‑M1/50‑41 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:501492‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:4177337‑M1/1‑9 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:3321112‑M1/1‑8 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:5472745‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca > 1:1105967‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca > 1:4390003‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:4570569‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:3958685‑M1/1‑5 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc < 1:216716‑M1/49‑46 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc < 1:3402517‑M1/49‑46 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc > 1:5238632‑M1/1‑2 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |